O’simliklar genomi. O'simliklar DNKsi ketma-ketligi va ifoda ma'lumotlarini to'plash, tartibga solish va baholash uchun mas'ul bo'lgan kuratorlar va hamkorlar ushbu ma'lumotni Milliy qishloq xo'jaligi kutubxonasiga (NAL) taqdim etadilar va bu ma'lumotlarni ommaga taqdim etadilar. O'rganilgan o'simliklarning barcha turlaridan bir nechtasi zamonaviy jamiyatga Zea Mays kabi ajoyib ta'sir ko'rsatdi. Makkajo'xori yoki makkajo'xori eng keng tarqalgan shtammi, teosinte (Zea mays subsp. parviglumis) tabiiy ravishda Meksikaning g'arbiy Syerra Madreda 400 dan 1700 m gacha bo'lgan balandliklarda joylashgan alohida yamoqlarda uchraydigan yovvoyi o'tdir. Gigant xonakilashtirilgan oʻt turlari (Zea mays subsp. mays) tropik Meksikadan kelib chiqqan boʻlib, bir qator oziq-ovqat, ozuqa, farmatsevtika va sanoat mahsulotlarining asosi boʻlgan don va em-xashak ishlab chiqarish uchun ishlatiladi. Makkajo'xori yetishtirish va undan oziq-ovqat mahsulotlarini ishlab chiqarish Kolumbiyagacha bo'lgan Mesoamerika sivilizatsiyalarining yuksalishi bilan bog'liq.
Makkajo'xori genomlari ma'lumotlar bazasi Meksika makkajo'xori hovuzidagi yuqori genetik biologik xilma-xillikni o'rganish uchun manba sifatida yetishtiruvchilar va olimlarga taqdim etildi, bu hozirgi va kelajakdagi makkajo'xori turlarini ko'paytirish uchun katta ahamiyatga ega. Makkajo'xori genomi 3800 Mb ketma-ketlikni o'z ichiga olgan 10 ta xromosomadan iborat. Xamirturushli sun'iy xromosomalar kutubxonasi bu miqdordagi ma'lumotlarni tahlil qilish imkonini berdi. Ushbu genomni Makkajo'xori ma'lumotlar bazasida (MaizeDB) to'liq qidirish mumkin. Shuningdek, ushbu saytda makkajo'xori zaxiralari, karyotip o'zgarishlari, gen xaritalari, gen mahsulotlari, miqdoriy bog'lanish tahlili va Medline havolalari kabi bir qator toifalarni qidirishga imkon beruvchi so'rov/qidiruv shakllari mavjud.
Arabidopsis thaliana - o'simlik tadqiqotchilari tomonidan o'simlik biologiyasining ko'p jihatlarini o'rganish uchun namunali organizm sifatida keng qo'llaniladigan kichik gulli o'simlik. Bu karam va turp kabi turlarni o'z ichiga olgan brassica oilasining a'zosi. Arabidopsis o'simlik biologiyasining ko'plab sohalarida, xususan, genetika va molekulyar biologiyada tadqiqotchilar uchun bir qator muhim afzalliklarga ega. U tez hayot aylanishiga ega, oson etishtiriladi va uning genomi kichik bo'lib, beshta xromosoma orasida taqsimlangan o'rtacha 135 Mb dan iborat. Arabidopsis genom ma'lumotlar bazasida taxminan 112 Mb ketma-ketlik ma'lumotlari mavjud. Arabidopsis axborot resursi (TAIR) Vashingtondagi Karnegi instituti oʻsimliklar biologiyasi departamenti va Genom resurslari milliy markazi oʻrtasidagi hamkorlikdagi loyihadir. Har biri ushbu loyihaning borishi haqida genomik va adabiyot ma'lumotlarini saqlaydi.
SoyBase loyihasi Ayova shtati universitetida muvofiqlashtirilgan, ishlab chiqilgan va qo'llab-quvvatlanadigan va USDA-ARS o'simlik genom dasturi tomonidan moliyalashtirilgan dukkaklilar ma'lumotlar bazasi loyihasining bir qismidir. Ushbu laboratoriya soyaning xilma-xilligi va miqdoriy belgilarining lokalizatsiyasini tahlil qilish texnologiyasini va standartlarini baholash loyihalarini amalga oshiradi. Laboratoriyaning asosiy maqsadi naslchilik uchun soya yetishtirishni yaxshilashga yordam beradigan bilim va texnologiyalarni ishlab chiqish va qo'llashdir. Bakterial sun'iy xromosoma (BAC) kutubxonasi yaratildi va u taxminan 40 000 klon yoki to'rt-besh genom ekvivalentidan iborat. 224 ta BAC klonlarining tasodifiy tanlab olishi o'rtacha 150 kb DNA insert hajmini berdi, bu har qanday maxsus ketma-ketlikni tiklashning 98% ehtimolini berdi. SoyBase o'simlik genlari, xromosoma xaritalari va DNK barmoq izlari bo'yicha ma'lumotlarning qidirish mumkin bo'lgan toifalarini o'z ichiga oladi, bu o'simlik xilma-xilligi va foydali xususiyatlarini kamsitish imkonini beradi. Metabolik yo'llarda ishtirok etadigan o'simlik patologiyalari va oqsillar to'plami ham mavjud.
