Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Ma'lumotlarning maxfiyligi va chiqarilish sanalari . Ma'lumotlar bazasiga taqdim etilgan ketma-ketliklar darhol ommaga e'lon qilinishi yoki muallif tomonidan belgilangan sanagacha ushlab turilishi mumkin. Ma'lumotlar e'lon qilinganidan keyin hech qachon yopilmaydi. Umuman olganda, agar muallif tomonidan boshqacha tartib nazarda tutilmagan bo'lsa, taqdim etilgan ketma-ketliklar ushbu ketma-ketliklar jurnal nashrida paydo bo'lishidan bir necha oy oldin tadqiqot hamjamiyatiga taqdim etiladi .
Ma'lumotlarni taqdim etish vositalarining yangi avlodi
Murakkab ketma-ketlikni yuborish vositalarining yangi avlodi endi EBIda mavjud bo'lib, mualliflarga ketma-ketlik ma'lumotlarini GENBANK Sequence Ma'lumotlar bazasiga oddiy va qulay tarzda WWW shakllari (Webin) yoki ko'p platformali (Mac) orqali yuborish imkonini beradi. /PC/Unix) mustaqil dasturiy vosita (Sequin).

3-rasm. Webin manba ma'lumotlar sahifasi.


Webin
Webin nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlarini va tegishli biologik ma'lumotlarni Evropa Bioinformatika Institutidagi (EBI) GENBANK Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasiga yuborish uchun yangi WWW ketma-ketligini yuborish vositasidir. EBIda Webinga kirish uchun quyidagi URL manzilidan foydalaning: http://www.ebi.ac.uk/submission/webin.html
Webin foydalanuvchini ketma-ketlik ma'lumotlari va tavsifiy ma'lumotlarni interaktiv va oson tarzda taqdim etish imkonini beruvchi WWW shakllari ketma-ketligi bo'yicha yo'naltiradi. Ushbu jarayon davomida ma'lumotlar bazasi yozuvini yaratish uchun zarur bo'lgan barcha ma'lumotlar yig'iladi:

• 
  Yuboruvchi ma'lumotlari
  
• 
  Chiqarilgan sana haqida ma'lumot
  
• 
  Ketma-ket ma'lumotlar, tavsif va manba ma'lumotlari
  
• 
  Iqtibos ma'lumotlari
  
• 
  Xususiyat ma'lumotlari (masalan, kodlash hududlari, tartibga solish signallari va boshqalar)
  

1997 yil iyun oyida chiqarilganidan beri Webin tezda ma'lumotlarni taqdim etishning afzal ko'riladigan vositasiga aylandi.
Payet
Sequin - bu GENBANK, GenBank yoki DDBJ ketma-ketlik ma'lumotlar bazalariga yozuvlarni yuborish uchun NCBI tomonidan ishlab chiqilgan eng so'nggi ko'p platformali (Mac/PC/Unix) mustaqil dasturiy vositadir. Sequin dasturini yuklab olish va o'rnatish bo'yicha batafsil ko'rsatmalar va umumiy ma'lumotlar WWW brauzeri va anonim FTP orqali GENBANK ma'lumotlar bazasidan mavjud. WWW: http://www.ebi.ac.uk/subs/allsubs.html FTP: ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/sequin/