|
III-bob. Xulosa.
GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi (aka GENBANK-Bank; http://www.ebi.ac.uk/genbank/) barcha mavjud ommaviy manbalardan nukleotidlar ketma-ketligini o'z ichiga oladi, tartibga soladi va tarqatadi. GENBANK-Bank Buyuk Britaniyaning Kembrij yaqinidagi Yevropa bioinformatika institutida (EBI) joylashgan va yuritiladi. DDBJ (Yaponiya) va GenBank (AQSh) bilan xalqaro hamkorlikda har kuni hamkorlikdagi ma'lumotlar bazalari o'rtasida ma'lumotlar almashiladi. GENBANK ma'lumotlar bazasiga asosiy hissa qo'shuvchilar alohida olimlar va genom loyihalari guruhlari hisoblanadi. Webin individual topshiruvchilar uchun afzal veb-asoslangan topshirish tizimi bo'lib, avtomatik protseduralar keng ko'lamli genom sekvensiyasi markazlari va Evropa Patent idorasidan (EPO) ketma-ketlik ma'lumotlarini kiritish imkonini beradi. Ma'lumotlar bazasi nashrlari har chorakda ishlab chiqariladi. Tarmoq xizmatlari FTP, elektron pochta va World Wide Web interfeyslari orqali eng so'nggi ma'lumotlar to'plamiga bepul kirish imkonini beradi. EBI ning Sequence Retrieval System (SRS), molekulyar biologiyadagi ma'lumotlar banklari uchun tarmoq brauzeri asosiy nukleotidlar va oqsillar ma'lumotlar bazalarini va boshqa ko'plab maxsus ma'lumotlar bazalarini birlashtiradi va bog'laydi. Ketma-ketlik o'xshashligini qidirish uchun tashqi foydalanuvchilarga o'z ketma-ketliklarini GENBANK Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi va SWISS-PROTdagi so'nggi ma'lumotlar bilan solishtirish imkonini beruvchi turli xil vositalar (masalan, Blitz, Fasta, BLAST) mavjud. Barcha resurslarga http://www.ebi.ac.uk manzilidagi EBI bosh sahifasi orqali kirish mumkin. asosiy nukleotid va oqsil ma'lumotlar bazalarini va boshqa ko'plab maxsus ma'lumotlar bazalarini birlashtiradi va bog'laydi. Ketma-ketlik o'xshashligini qidirish uchun tashqi foydalanuvchilarga o'z ketma-ketliklarini GENBANK Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi va SWISS-PROTdagi so'nggi ma'lumotlar bilan solishtirish imkonini beruvchi turli xil vositalar (masalan, Blitz, Fasta, BLAST) mavjud. Barcha resurslarga http://www.ebi.ac.uk manzilidagi EBI bosh sahifasi orqali kirish mumkin. asosiy nukleotid va oqsil ma'lumotlar bazalarini va boshqa ko'plab maxsus ma'lumotlar bazalarini birlashtiradi va bog'laydi. Ketma-ketlik o'xshashligini qidirish uchun tashqi foydalanuvchilarga o'z ketma-ketliklarini GENBANK Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi va SWISS-PROTdagi so'nggi ma'lumotlar bilan solishtirish imkonini beruvchi turli xil vositalar (masalan, Blitz, Fasta, BLAST) mavjud. Barcha resurslarga http://www.ebi.ac.uk manzilidagi EBI bosh sahifasi orqali kirish mumkin.
Yevropa bioinformatika instituti (EBI) Germaniyaning Geydelberg shahridagi Yevropa molekulyar biologiya laboratoriyasining (GENBANK) punktidir. EBI Buyuk Britaniyaning Kembrij yaqinidagi Wellcome Trust Genom kampusi hududida, Sanger markazi va Buyuk Britaniyaning Inson genomini xaritalash loyihasi resurs markazi yonida joylashgan.
EBI markazining xizmat ko'rsatish dasturining asosiy vazifalari ma'lumotlarni joylashtirish va ulardan foydalanishni qo'llab-quvvatlash uchun biologik ma'lumotlar bazalari va axborot xizmatlarini yaratish, saqlash va taqdim etish. Shu nuqtai nazardan, bir qator ma'lumotlar bazalari, xususan, GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi (GENBANK-bank), oqsillar ma'lumotlar bazalari (SWISS-PROT va TrGENBANK), Makromolekulyar tuzilmalar ma'lumotlar bazasi (MSD) va gen ifodasi ma'lumotlari uchun ArrayExpress va boshqa bir qancha ma'lumotlar bazalari ishlaydi. ularning aksariyati tashqi guruhlar bilan hamkorlikda ishlab chiqariladi.
GENBANK Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi (http://www.ebi.ac.uk/genbank/) DDBJ/GENBANK/GenBankning uch tomonlama xalqaro nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi hamkorlikning Yevropa a'zosidir. Asosiy ma'lumotlar manbalari keng miqyosli genom sekvensiyasi markazlari, alohida olimlar va Evropa Patent idorasi (EPO). GENBANK-Bankga to'g'ridan-to'g'ri taqdim etish DDBJ (Yaponiya) va GenBank (AQSh hamkorlikdagi ma'lumotlar bazalari bilan kundalik ma'lumotlar almashinuvi bilan to'ldiriladi.
GENBANK ma'lumotlar bazasi genomlarni sekvensiyalash bo'yicha olib borilgan katta sa'y-harakatlar natijasida tez o'sib bormoqda. 12 oylik muddat ichida ma'lumotlar bazasi hajmi 8255 million nukleotidni (63-iyun, 2000 yil) o'z ichiga olgan taxminan 6,7 million yozuvdan 12 milliondan ortiq yozuvga va 12 820 million nukleotidga (67-reliz, 2001 yil iyun) oshdi. Xuddi shu davrda ma'lumotlar bazasida mavjud bo'lgan organizmlar soni >30% ga oshib, 75 000 dan ortiq turga etdi.
Do'stlaringiz bilan baham: |
