Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Avtomatik genom izohi
Ansambl bu GENBANK-EBI va Sanger markazi o'rtasidagi eukaryotik genomlar bo'yicha avtomatik izohlarni ishlab chiqarish va saqlash bo'yicha qo'shma loyihadir. Kirish http://www.ensgenbank.org/ veb-ga asoslangan genom brauzeri orqali taqdim etiladi.
Ma'lumotlarni boshqarish va vakollash
Ma'lumotlar mustahkam ma'lumotlar bazasini boshqarish tizimida (ORACLE) boshqariladi, bu sxema yordamida boshqa ma'lumotlar bazalari, xususan, oqsillar ketma-ketligi bilan integratsiya va o'zaro ishlashni osonlashtiradi. Ushbu tizimdan har chorakda nashrlar va uzoq saytlarda tarqatish va o'rnatish uchun kunlik yangilanishlar yaratiladi.
Ma'lumotlar bazasi yozuvlari GENBANK tekis fayl formatida tarqatiladi, bu ko'pgina ketma-ketlikni tahlil qilish dasturiy paketlari tomonidan qo'llab-quvvatlanadi va shuningdek, o'qish oson bo'lgan tuzilmani ta'minlaydi. GENBANK yassi fayli jadval shaklida taqdim etilgan va to'rtta asosiy ma'lumotlar blokidan iborat bo'lgan qat'iy boshqariladigan qator turlaridan iborat:
1. Tavsiflar va identifikatorlar.
2. Iqtiboslar: bog'langan nashrlarning iqtibos tafsilotlari va asl jo'natuvchining nomi va aloqa ma'lumotlari.
3. Xususiyatlari: batafsil manba ma'lumoti, xususiyat joylashuvidan iborat biologik xususiyatlar, xususiyat kvalifikatsiyalari va boshqalar.
4. Ketma-ketlik: umumiy ketma-ketlik uzunligi, asosiy tarkibi (SQ) va ketma-ketlik.
Ketma-ketlik identifikatorlari
Noyob va barqaror ulanish raqamlariga qo'shimcha ravishda, GENBANK ma'lumotlar bazasi yozuvlari ketma-ketlik identifikatorlari va ketma-ketlikdagi o'zgarishlarni belgilaydigan versiya ma'lumotlarini o'z ichiga oladi. Identifikatorlarning o'zi ma'lum bir yozuvda barqaror bo'lib qoladi, shu bilan birga versiya raqami har bir ketma-ketlik yangilanishi bilan ortadi. Protein identifikatorlari tashqi ma'lumotlar bazalari (masalan, SWISS-PROT) tomonidan identifikator sifatida ishlatilishi mumkin, buning ustiga xususiyatlar darajasida, masalan, individual CDS xususiyatlariga o'zaro havolalar tuzilishi mumkin.

• 
  Nukleotidlar ketma-ketligi identifikatori Misol: SV AJ400848.1
  
• 
  Protein ketma-ketligi identifikatori Misol: protein_id=“ CAB88705.1 ”