Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Patent adabiyotidan ketma-ketliklar. Patent ketma-ketligi EPO bilan davom etayotgan hamkorlikda olinmoqda. EPO siyosati patent berilgan yoki berilmaganligidan qat'i nazar, patentga talabnoma berilgan kundan boshlab 18 oy o'tgach, ma'lumotlarni ommaga (va GENBANKga) chiqarishdan iborat. EPO tomonidan e'lon qilingandan so'ng, eng so'nggi patent ketma-ketligi ma'lumotlari GENBANK ma'lumotlar bazasiga integratsiya qilinadi va jamoatchilikka taqdim etiladi. EPO patent adabiyotidan olingan barcha yozuvlar ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/genbank/patent/ saytida mavjud. Bundan tashqari, ushbu fayllar NCBI (AQSh) va DDBJ (Yaponiya) tomonidan kiritilgan Amerika va Yaponiya patent adabiyotlari ma'lumotlarini o'z ichiga oladi.
Kirish raqamlari va ma'lumotlarning maxfiyligi. Kirish raqamlari ma'lumotlar bazasidagi ketma-ketlikni doimiy ravishda aniqlaydigan noyob identifikatorlardir. Ko'pgina jurnal muharrirlari jurnalni nashr qilishdan oldin ketma-ketlik ma'lumotlarini DDBJ/GENBANK/GenBankga topshirishni talab qiladi. Yangi taqdimnomaga javoban qo'shilish raqamlari taqdim etiladi va ariza olingan kundan boshlab ikki ish kuni ichida mualliflarga etkaziladi. Ushbu qo'shilish raqamlari (masalan , X56734 va AL450380 ) qo'lyozma/nashrga kiritilgan bo'lib, jamiyatga jurnal maqolasini o'qib chiqqandan so'ng ma'lumotlarni olish imkonini beradi.
Taqdim etish jarayonida taqdim etuvchilardan ular taqdim etgan ma'lumotlar darhol ommaga taqdim etilishi mumkinmi yoki muallif tomonidan belgilangan sanagacha ma'lumotlar saqlanishi kerakmi yoki yo'qligini aniqlash so'raladi. Ma'lumotlar e'lon qilinganidan keyin hech qachon yopilmaydi.
GENBANK-Bank veb-resurslarini taqdim etadi, shu jumladan taqdimotlar, ma'lumotlarga kirish, genom ma'lumotlari va ma'lumotlar bazasini qidirish va tahlil qilish vositalari haqida batafsil ma'lumot.
1-jadval. GENBANK-Bank veb-resurslarining qisqacha mazmuni, shu jumladan taqdimotlar, ma'lumotlarga kirish, genom ma'lumotlari, shuningdek ma'lumotlar bazasini qidirish va tahlil qilish vositalari haqida batafsil ma'lumot

Sarlavha	URL
General
GENBANK-EBI bosh sahifasi	www.ebi.ac.uk/
GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi	www.ebi.ac.uk/genbank/
Hujjatlar
GENBANK ma'lumotlar bazasi hujjat sahifasi	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/
Ma'lumotlar bazasi foydalanuvchi uchun qo'llanma	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/User_manual/usrman.html
Ma'lumotlar bazasi relizlar eslatmalari	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/Release_notes/current/relnotes.html
DDBJ/GENBANK/GenBank xususiyatlari jadvali hujjati	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/FT_definitions/feature_table.html
Taksonomiya ma'lumotlar bazasi	www3.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/tax.html
Ma'lumotlar bazasiga kirish misoli	www.ebi.ac.uk/cgi-bin/genbankfetch?x64011
WEBALIGN: Taqdimotlar ketma-ketligini tekislash	www.ebi.ac.uk/genbank/Submission/alignment.html
WebFeat: xususiyat jadvali kalitlari/saralash ta'riflari	www3.ebi.ac.uk/Services/WebFeat/
Izoh misollari: GENBANK kiritish misollari.	www3.ebi.ac.uk/Services/Standards/web/
DE liniyasi standartlari: kirish ta'riflari uchun ko'rsatmalar	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/de_line_standards.html
GENBANK ning har kuni yangilanadigan nusxalarini saqlaydigan saytlar	www.ebi.ac.uk/genbank/Access/other_sites.html
Taqdimotlar
Nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlarini taqdim etish	www.ebi.ac.uk/genbank/Submission/
Information for Submitters Document	www.ebi.ac.uk/genbank/Documentation/information_for_submitters.html
Vector Scanning prior to submission	www2.ebi.ac.uk/blastall/vectors.html
WEBIN: web-based sequence submission system	www.ebi.ac.uk/genbank/Submission/
SEQUIN: stand-alone sequence submission tool	www3.ebi.ac.uk/Services/Sequin/
Genome Project Submission Account guidelines	www3.ebi.ac.uk/Services/GenomeSubm/
WEBUP: sequence update form	www3.ebi.ac.uk/Services/webin/update/update.html
Access
Access to servers, query tools and data archives	www.ebi.ac.uk/genbank/Access/
Sequence Retrieval Service (SRS)	http://srs.ebi.ac.uk/
Current Database Release	ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/genbank/release/
Sequence Tagged Sites (STS) resources	www.ebi.ac.uk/genbank/Access/sts.html
Expressed Sequence Tag (EST) resources	www.ebi.ac.uk/genbank/Access/est.html
Patent adabiyotidan ketma-ketliklar	ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/genbank/patent/
Genom ma'lumotlari
Tugallangan Genomlar veb-serveri	www.ebi.ac.uk/genomes/
Genom FTP server	ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/genbank/genomes/
Ansambl: genom ma'lumotlarini avtomatlashtirilgan tahlil qilish	http://ensgenbank.ebi.ac.uk/
Genom MOT: genom loyihalari holati	www.ebi.ac.uk/Databases/Genome_MOT/genome_mot.html
Ma'lumotlar bazasini qidirish, ko'rib chiqish va tahlil qilish vositalari
Qidiruv, ko'rib chiqish va tahlil vositalariga kirish	www.ebi.ac.uk/Tools/