Hisoblashning ochiq ramkasini izlash

AMIGen yo'l oqsilni orqaga o'tkazish va moslashtirish - masofadagi oqsil gomologiyalarini topish muammosini hal qiladi, bu erda divergensiya ramka almashinuvi mutatsiyalari va almashtirishlar natijasidir. Ikki kirish oqsili ketma-ketligini hisobga olgan holda, usul har bir oqsil uchun taxminiy DNK ketma-ketliklarining to'liq to'plamining xotirada samarali grafik ko'rinishlarini manipulyatsiya qilish orqali ularni kodlaydigan DNK ketma-ketliklarining barcha mumkin bo'lgan juftlarini bilvosita tekislaydi.
Oddiy tarjima vositalari – DNK dan oqsil ketma-ketligi.
-O'qish ramkasini topuvchini oching (NCBI) - siz kiritgan DNK ketma-ketligida ochiq o'qish ramkalarini (ORFs) qidiradi. Dastur har bir ORF diapazonini oqsil tarjimasi bilan birga qaytaradi. Potensial oqsil kodlash segmentlari uchun yangi ketma-ket DNKni qidirish uchun ORF qidiruvchisidan foydalaning, yangi ishlab chiqilgan SMART BLAST yoki oddiy BLASTP yordamida prognoz qilingan proteinni tekshiring.
-Olti kadrli tarjimalar Tuebingen, Rossiya, Bioline va Science Launcher-da amalga oshirilishi mumkin.
-EMBOSS Sixpack (EMBL-EBI) - DNK ketma-ketligini o'qiydi va uchta oldinga va (ixtiyoriy) uchta teskari tarjimani vizual tarzda chiqaradi. Shu bilan bir qatorda EMBOSS Transeq dan foydalaning
-MBS tarjimon (JustBio vositalari) - Ajoyib yangi sayt, chunki ATG dan maxsus tarjima qilish mumkin va natijalar aminokislotalar ketma-ketligini qoplaydigan nukleotidlar ketma-ketligi bilan taqdim etiladi. Qo'lyozmaga kesish/joylashtirish uchun ideal. Ushbu bepul vositadan foydalanish uchun ro'yxatdan o'tishingiz kerak. Boshqa tezkor tarjima vositalari bu yerda va shu yerda.
-Tarjima (ExPASy, Shveytsariya) - nukleotidlar (DNK/RNK) ketma-ketligini oqsil ketma-ketligiga o'tkazish imkonini beruvchi vosita.
Bir nechta ketma-ketliklarning tarjimasi.
Virtual ribosoma (Ma'lumotnoma: R. Vernersson. 2006. Nucl. Acids Res. 34 (veb-server muammosi): W385-388) - Birinchi ikkita saytdan olingan ma'lumotlar bir nechta DNK ketma-ketligini tarjima qilish uchun eng maqbul deb topdim.
TranslatorX - bu protein kodlovchi nukleotidlar ketma-ketligini ularning tegishli aminokislota tarjimalari asosida tekislash uchun mo'ljallangan veb-server. TranslatorX yangiliklari quyidagilarni o'z ichiga oladi: (i) barcha hujjatlashtirilgan genetik kodlardan foydalanish va har bir ketma-ketlik uchun turli xil genetik kodlarni belgilash imkoniyati (ii) turli xil ko'plab moslashtirish dasturlari batareyasi (iii) iloji bo'lsa, noaniq kodonlarning tarjimasi (iv) innovatsion mezon. oqsil ma'lumotlariga asoslangan GB bloklari bilan toza nukleotid hizalamalari va (v) boy chiqish, shu jumladan Jalview yordamida tekislashning grafik vizualizatsiyasi, mos keladigan aminokislotalarga ko'ra ranglangan kodon asosidagi hizalamalar, kompozitsion moyillik o'lchovlari va birinchi, ikkinchi va uchinchi kodon joylashuvga xos hizalamalar.
Yig'ilgan genomlarning tuzilishi, yig'ilish nomlari va boshqa meta-ma'lumotlar, statistik hisobotlar va genomik ketma-ketlik ma'lumotlariga havolalar haqida ma'lumot beruvchi ma'lumotlar bazasi.
Madaniyat kollektsiyalari, muzeylar, gerbariyalar va boshqa tabiiy tarix kolleksiyalari uchun tanlangan metamaʼlumotlar toʻplami. Yozuvlarda yig'ish kodlari, to'plamlarning uy muassasalari haqidagi ma'lumotlar va NCBIdagi tegishli ma'lumotlarga havolalar ko'rsatilgan.
Genomika, funktsional genomika va genetika tadqiqotlari to'plami va ularning ma'lumotlar to'plamiga havolalar. Ushbu resurs loyiha doirasi, materiali va maqsadlarini tavsiflaydi va mos kelmaydigan izohlar, bir nechta mustaqil taqdimotlar va ko'pincha turli ma'lumotlar bazalarida saqlanadigan turli xil ma'lumotlar turlarining xilma-xilligi tufayli topish qiyin bo'lgan ma'lumotlar to'plamini olish mexanizmini taqdim etadi.
BioSample ma'lumotlar bazasi eksperimental tahlillarda ishlatiladigan biologik manba materiallarining tavsiflarini o'z ichiga oladi.
Biyomedikal adabiyotlarni, kichik molekulalarni va biologik munosabatlar nuqtai nazaridan ketma-ketlik ma'lumotlarini guruhlaydigan ma'lumotlar bazasi.
To'g'ridan-to'g'ri yoki boshqa NCBI ma'lumotlar bazalaridagi bog'langan ma'lumotlardan qidirish mumkin bo'lgan biotibbiyot kitoblari to'plami. To'plamga biotibbiyot darsliklari, boshqa ilmiy nomlar, genetik manbalar kiradi GeneReviews, va NCBI yordam qo'llanmalari.
Inson o'zgarishi va kuzatilgan salomatlik holati o'rtasidagi hisobot munosabatlarining ommaviy, kuzatilgan rekordini tasdiqlovchi dalillar bilan ta'minlash uchun resurs. NIH Genetic Testing Registry (GTR), MedGen, Gene, OMIM, PubMed va boshqa manbalardagi tegishli maʼlumotlarga yozuvlardagi giperhavolalar orqali kirish mumkin.
Butun dunyo bo'ylab o'tkazilgan inson ishtirokchilarining davlat va xususiy tomonidan qo'llab-quvvatlanadigan klinik tadqiqotlari reestri va natijalari ma'lumotlar bazasi.
NCBI Hisoblash Biologiyasi Filialining (CBB) tuzilma guruhi tomonidan ishlab chiqilgan manbalarga kirish va havolalarni ta'minlaydigan markazlashtirilgan sahifa. Ushbu manbalar ma'lumotlar bazalari va makromolekulyar tuzilmalarni, saqlanib qolgan domenlarni va oqsil tasnifini, kichik molekulalar va ularning biologik faolligini, biologik yo'llar va tizimlarni o'rganishda yordam beradigan vositalarni o'z ichiga oladi.
Doimiy izohlangan va yuqori sifatli inson va sichqoncha oqsillarini kodlash mintaqalarining asosiy to'plamini aniqlash bo'yicha hamkorlikdagi harakat.
Molekulyar evolyutsiyada saqlanib qolgan oqsil domenlarini ifodalovchi ketma-ketliklarni tekislash va profillar to'plami. Shuningdek, u MMDB ma'lumotlar bazasida ma'lum 3 o'lchovli oqsil tuzilmalariga domenlarni moslashtirishni o'z ichiga oladi.
dbVar ma'lumotlar bazasi keng ko'lamli genomik o'zgarishlar, jumladan, katta kiritishlar, o'chirishlar, translokatsiyalar va inversiyalar bilan bog'liq ma'lumotlarni arxivlash uchun ishlab chiqilgan. Variantlarni arxivlashdan tashqari, dbVar fenotip ma'lumotlari bilan aniqlangan variantlarning assotsiatsiyasini ham saqlaydi.
Genotip va fenotipning o'zaro ta'sirini o'rganadigan tadqiqotlar tavsifi va natijalari uchun arxiv va tarqatish markazi. Ushbu tadqiqotlar genom bo'ylab assotsiatsiya (GWAS), tibbiy takrorlash, molekulyar diagnostika tahlillari, shuningdek, genotip va klinik bo'lmagan belgilar o'rtasidagi bog'lanishni o'z ichiga oladi.
Yagona nukleotid o'zgarishlari, mikrosatellitlar va kichik o'lchamdagi kiritish va o'chirishni o'z ichiga oladi. dbSNP populyatsiyaga xos chastota va genotip ma'lumotlarini, eksperimental sharoitlarni, molekulyar kontekstni va neytral o'zgarishlar va klinik mutatsiyalar uchun xaritalash ma'lumotlarini o'z ichiga oladi.
NIH genetik ketma-ketlik ma'lumotlar bazasi, barcha ochiq DNK ketma-ketliklarining izohli to'plami. GenBank Yaponiya DNK ma'lumotlar banki (DDBJ), Evropa molekulyar biologiya laboratoriyasi (EMBL) va NCBIdagi GenBankni o'z ichiga olgan Xalqaro nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi hamkorlikning bir qismidir. Ushbu uchta tashkilot har kuni ma'lumot almashadi. GenBank bir nechta bo'limlardan iborat bo'lib, ularning aksariyatiga Nukleotidlar bazasi orqali kirish mumkin. Istisnolar EST va GSS bo'linmalari bo'lib, ularga mos ravishda Nukleotid EST va Nukleotid GSS ma'lumotlar bazalari orqali kirish mumkin.
To'liq ketma-ketlashtirilgan va genga xos ma'lumotlarga hissa qo'shish uchun faol tadqiqot hamjamiyatiga ega bo'lgan genomlarga e'tibor qaratuvchi genlarning qidiriladigan ma'lumotlar bazasi. Ma'lumotlarga nomenklatura, xromosoma lokalizatsiyasi, gen mahsulotlari va ularning atributlari (masalan, oqsil o'zaro ta'siri), bog'liq belgilar, fenotiplar, o'zaro ta'sirlar va iqtiboslarga havolalar, ketma-ketliklar, o'zgarishlar tafsilotlari, xaritalar, ifoda hisobotlari, homologlar, oqsil domeni tarkibi va tashqi ma'lumotlar bazalari kiradi.
MIAME-ga mos keladigan ma'lumotlarni taqdim etishni qo'llab-quvvatlaydigan umumiy funktsional genomik ma'lumotlar ombori. Massiv va ketma-ketlikka asoslangan ma'lumotlar qabul qilinadi va foydalanuvchilarga eksperimentlar va tanlangan gen ifodasi profillarini so'rash va yuklab olishda yordam beradigan vositalar taqdim etiladi.
Gene Expression Omnibus (GEO) omboridan yig‘ilgan, tanlangan gen ifodasi va molekulyar ko‘plik ma’lumotlar to‘plamini saqlaydi. DataSet yozuvlari klaster vositalari va differentsial ifoda so'rovlarini o'z ichiga olgan qo'shimcha resurslarni o'z ichiga oladi.
Mutaxassislar tomonidan yozilgan, NCBI Bookshelfdagi o'zaro ko'rib chiqilgan kasalliklar tavsiflari to'plami, ularda genetik testlar o'ziga xos irsiy sharoitlari bo'lgan bemorlar va oilalarning diagnostikasi, boshqaruvi va genetik maslahati uchun qo'llaniladi.
Tanlangan genetik kasalliklar uchun ma'lumotlarning qisqacha mazmuni, asosiy mutatsiya(lar) va klinik xususiyatlarni muhokama qilish, shuningdek, tegishli ma'lumotlar bazalari va tashkilotlarga havolalar.
Genetik testlar va laboratoriyalarning ixtiyoriy reestri, testlar haqida batafsil ma'lumot, masalan, nima o'lchanganligi, analitik va klinik haqiqiyligi. GTR shuningdek, genetik sharoitlar haqida ma'lumot olish uchun bog'liq bo'lib, turli xil resurslarga, jumladan, amaliy ko'rsatmalar, nashr etilgan adabiyotlar va genetik ma'lumotlar/ma'lumotlarga kontekstga xos havolalarni taqdim etadi. GTRning boshlang'ich doirasi Mendeliya kasalliklari uchun yagona gen testlarini, shuningdek massivlar, panellar va farmakogenetik testlarni o'z ichiga oladi.
1000 dan ortiq organizmlarning butun genomlaridan olingan ketma-ketlik va xarita ma'lumotlarini o'z ichiga oladi. Genomlar to'liq ketma-ketlashtirilgan organizmlarni ham, ketma-ketligi davom etayotgan organizmlarni ham ifodalaydi. Hayotning uchta asosiy sohasi (bakteriyalar, arxeya va eukariotalar), shuningdek, ko'plab viruslar, faglar, viroidlar, plazmidlar va organellalar mavjud.
Genom Reference Consortium (GRC) inson va sichqonchaning mos yozuvlar genomlari uchun javobgarlikni o'z zimmasiga oladi. A'zolar Vashington universitetidagi Genom markazi, Wellcome Trust Sanger instituti, Evropa bioinformatika instituti (EBI) va Biotexnologiya ma'lumotlari milliy markazidan (NCBI) iborat. GRC noto'g'ri ko'rsatilgan joylarni tuzatish va qolgan montaj bo'shliqlarini yopish uchun ishlaydi. Bundan tashqari, GRC murakkab yoki strukturaviy o'zgaruvchan genomik lokuslar uchun muqobil yig'ilishlarni taqdim etishga intiladi. GRC veb-saytida (http://www.genomereference.org) jamoatchilik hozirda ko'rib chiqilayotgan genomik hududlarni ko'rishlari, genom bilan bog'liq muammolar haqida xabar berishlari va GRC bilan bog'lanishlari mumkin.
Glikoinformatika va glikobiologiya bilan bog'liq manbalarga kirish va havolalarni ta'minlaydigan markazlashtirilgan sahifa.
OIV-1 oqsillarining inson xostlari oqsillari bilan ma'lum o'zaro ta'siri to'g'risidagi ma'lumotlar bazasi. U tegishli PubMed yozuvlari va ketma-ketlik ma'lumotlariga havolalar bilan oqsillarning o'zaro ta'siri to'g'risidagi nashr etilgan hisobotlarning izohli bibliografiyalarini taqdim etadi.
GenBank va RefSeqdagi izohli kodlash hududlarida, shuningdek SwissProt va PDB oqsillari ketma-ketliklarida aniqlangan oqsillarni tavsiflovchi konsolidatsiyalangan yozuvlar to'plami. Ushbu resurs tadqiqotchilarga ko'proq maqsadli qidiruv natijalarini olish va qiziqish oqsilini tezda aniqlash imkonini beradi.
NIAID Gripp genomlarini ketma-ketlashtirish loyihasi va GenBank ma'lumotlari to'plami. U gripp ketma-ketligini tahlil qilish, izohlash va GenBankga topshirish uchun vositalarni taqdim etadi. Ushbu resursda grippning boshqa ketma-ketlik manbalariga, nashrlar va gripp viruslari haqida umumiy ma'lumotlarga havolalar mavjud.
NCBI ma'lumotlar bazasi yozuvlarida havola qilingan jurnallar, shu jumladan PubMed tezislari haqida ma'lumot beruvchi NLM Catalog ma'lumotlar bazasi to'plami. Ushbu kichik to'plamni jurnal nomi, MEDLINE yoki ISO qisqartmasi, ISSN yoki NLM Katalog identifikatori yordamida qidirish mumkin.
MeSH (Tibbiy mavzu sarlavhalari) - MEDLINE/PubMed uchun maqolalarni indekslash uchun AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi tomonidan boshqariladigan lug'at. MeSH terminologiyasi bir xil tushunchalar uchun turli terminologiyadan foydalanishi mumkin bo'lgan ma'lumotlarni olishning izchil usulini ta'minlaydi.
Tibbiy genetika haqidagi ma'lumotlar portali. MedGen bir nechta manbalardan atamalar ro'yxatini o'z ichiga oladi va ularni kontseptsiya guruhlari va ierarxiyalariga ajratadi. Shuningdek, havolalar NIH Genetic Testing Registry (GTR), ClinVar, Gene, OMIM, PubMed va boshqa manbalardagi ushbu tushunchalar bilan bog'liq ma'lumotlarga taqdim etiladi.
NCBI C++ asboblar to'plami bo'yicha keng qamrovli qo'llanma, jumladan, uning dizayn va ishlab chiqish asoslari, C++ kutubxonasi ma'lumotnomasi, dasturiy ta'minot misollari va demolari, tez-tez so'raladigan savollar va nashr yozuvlari. Qo'llanmani Internetda qidirish mumkin va uni PDF hujjatlar qatori sifatida yuklab olish mumkin.
Oʻquv qoʻllanmalari va oʻquv materiallariga, jumladan PowerPoint slaydlari va tarqatma materiallarga havolalar beradi.
NCBI qo'llanmasining bir qismi bo'lgan ushbu lug'atda NCBI vositalari va qisqartmalar, bioinformatika atamalari va ma'lumotlarni taqdim etish formatlari tavsiflari mavjud.
NCBI ma'lumotlar bazalari va dasturiy ta'minot haqida keng maqolalar to'plami. Ajam foydalanuvchi uchun mo'ljallangan, har bir maqolada mavjud tahlil vositalarini qidirish va ulardan foydalanish bo'yicha maslahatlar bilan birga manba va uning dizayni haqida umumiy ma'lumot berilgan. Barcha maqolalarni onlayn qidirish va PDF formatida yuklab olish mumkin, qo'llanmani NCBI Bookshelf orqali olish mumkin.
NCBI Bookshelf orqali kirilgan Yordam qoʻllanmasi koʻplab NCBI resurslari, jumladan PubMed, PubMed Central, Entrez tizimi, Gene, SNP va LinkOut uchun hujjatlarni oʻz ichiga oladi. Barcha bo'limlarni PDF formatida yuklab olish mumkin.
Oziq-ovqat, atrof-muhit va bemor izolyatsiyalaridan kelib chiqadigan bakterial patogen genomik ketma-ketliklarni to'plash va tahlil qilishni o'z ichiga olgan loyiha. Hozirgi vaqtda avtomatlashtirilgan quvur liniyasi oziq-ovqat orqali yuqadigan kasalliklarning tarqalishini tekshirishda yordam berish va oziq-ovqat bilan ifloslanishning potentsial manbalarini aniqlash uchun birinchi navbatda sog'liqni saqlash laboratoriyalari tomonidan ta'minlangan ketma-ketlikni aniqlaydi.
Kutubxona fondidagi barcha jurnallar, kitoblar, audiovizuallar, kompyuter dasturlari, elektron resurslar va boshqa materiallar uchun bibliografik ma’lumotlar.
GenBank, RefSeq, Third Party Annotation (TPA) ma'lumotlar bazasi va PDB kabi bir nechta manbalardan olingan nukleotidlar ketma-ketligi to'plami. Nukleotidlar ma'lumotlar bazasini qidirish uning har bir komponenti ma'lumotlar bazasidan mavjud natijalarni beradi.
Inson genlari va genetik kasalliklar ma'lumotlar bazasi. NCBI joriy tarkibni qo'llab-quvvatlaydi va uni qidirish va boshqa NCBI ma'lumotlar bazalari bilan integratsiyalashuvini qo'llab-quvvatlashda davom etmoqda. Biroq, OMIM endi omim.org saytida yangi uyga ega va foydalanuvchilar to'liq rekord ko'rsatish uchun ushbu saytga yo'naltiriladi.
Qiyosiy tadqiqotlar natijasida kelib chiqadigan tegishli DNK ketma-ketliklarining ma'lumotlar bazasi: filogenetik, populyatsiya, atrof-muhit va kamroq darajada mutatsion. Ma'lumotlar bazasidagi har bir yozuv DNK ketma-ketliklari to'plamidir. Masalan, populyatsiyalar to'plami organizm ichidagi genetik o'zgaruvchanlik haqida ma'lumot beradi, filogenetik to'plam esa bir nechta qarindosh organizmlardan olingan bitta genning ketma-ketligini va ularning uyg'unligini o'z ichiga olishi mumkin.
To'liq prokariotik va organella plazmidlari va genomlari tomonidan kodlangan Reference Sequence oqsillaridan tashkil topgan tegishli oqsil ketma-ketligi (klasterlar) to'plami. Ma'lumotlar bazasi annotatsiya ma'lumotlariga, nashrlarga, domenlarga, tuzilmalarga, tashqi havolalarga va tahlil vositalariga oson kirish imkonini beradi.
GenPept, RefSeq, Swiss-Prot, PIR, PRF va PDB kabi turli manbalardan olingan protein ketma-ketligi yozuvlarini o'z ichiga olgan ma'lumotlar bazasi.
Umumiy funktsiyaga ega gomologik oqsillarni ifodalovchi modellar to'plamini o'z ichiga olgan ma'lumotlar bazasi. U saqlangan domen arxitekturasi, yashirin Markov modellari va BlastRules-ni o'z ichiga oladi. Ushbu modellarning bir qismi prokariotik genom annotatsiya quvuri (PGAP) tomonidan bashorat qilingan oqsillarga nomlar va boshqa atributlarni belgilash uchun ishlatiladi.
Depozit qilingan bioaktivlik ma'lumotlari va PubChem Substance ma'lumotlar bazasidagi kimyoviy moddalarni skrining qilish uchun foydalaniladigan bioaktivlik tahlillari tavsiflari, shu jumladan skrining protsedurasiga xos shartlar va ko'rsatkichlar (bioaktivlik darajalari) tavsiflaridan iborat.
Nomlar, sinonimlar yoki kalit so'zlar yordamida qidirish mumkin bo'lgan noyob, tasdiqlangan kimyoviy tuzilmalarni (kichik molekulalar) o'z ichiga oladi. Murakkab yozuvlar, agar turli omonatchilar bir xil tuzilmani taqdim etgan bo'lsa, bir nechta PubChem Substance yozuvlari bilan bog'lanishi mumkin. Ushbu birikma yozuvlari PubChem Substance tarkibidagi moddalarni tavsiflash uchun taqdim etilgan tasdiqlangan kimyoviy tasvir ma'lumotlarini aks ettiradi. PubChem birikmalarida saqlangan tuzilmalar oldindan klasterlangan va identifikatsiya va o'xshashlik guruhlari bo'yicha o'zaro havola qilingan. Bundan tashqari, kimyoviy tuzilmalarni qidirish va filtrlash uchun hisoblangan xususiyatlar va deskriptorlar mavjud.
PubChem Substansiya yozuvlari omonatchilar tomonidan PubChemga elektron tarzda taqdim etilgan moddalar haqida ma'lumotni o'z ichiga oladi. Bunga yuborilgan har qanday kimyoviy tuzilish ma'lumotlari, shuningdek, kimyoviy nomlar, sharhlar va omonatchining veb-saytiga havolalar kiradi.
MEDLINE va qo'shimcha hayot fanlari jurnallaridan biotibbiyot adabiyotlari uchun iqtiboslar va tezislar ma'lumotlar bazasi. Maqolalarning to'liq matnli versiyalari PubMed Central (quyida tasvirlangan) yoki boshqa veb-saytlar orqali mavjud bo'lganda havolalar taqdim etiladi.
To'liq matnli biotibbiyot va hayot haqidagi fanlar jurnali adabiyotlarining raqamli arxivi, shu jumladan klinik tibbiyot va sog'liqni saqlash.
RefSeqGene Inson geniga xos mos yozuvlar genomik ketma-ketliklari to'plami. RefSeq geni NCBI ning RefSeq ma'lumotlar bazasining kichik to'plami bo'lib, mahalliy ma'lumotlar bazalari kuratorlari va genetik test hamjamiyatining ko'rib chiqishlari asosida aniqlanadi. Ular mutatsiyalar haqida hisobot berish, izchil intron va ekzon raqamlash konventsiyalarini o'rnatish va boshqa biologik ahamiyatga ega o'zgarishlarning koordinatalarini aniqlash uchun barqaror asos yaratadi. RefSeqGene Locus Reference Genomik (LRG) hamkorlikning bir qismidir. Malumot ketma-ketligi (RefSeq).
NCBI tomonidan ishlab chiqarilgan, ajratilgan, ortiqcha bo'lmagan genomik DNK, transkript (RNK) va oqsil ketma-ketliklari to'plami. RefSeqs genom annotatsiyasi, gen identifikatsiyasi va xarakteristikasi, mutatsiya va polimorfizm tahlili, ekspression tadqiqotlar va qiyosiy tahlillar uchun barqaror ma'lumotnoma beradi. RefSeq to'plamiga Nukleotid va Protein ma'lumotlar bazalari orqali kirish mumkin.
Retroviruslarni tadqiq qilishni qoʻllab-quvvatlash uchun maxsus moʻljallangan resurslar toʻplami, jumladan, soʻrovlar ketma-ketligining genotipini aniqlash uchun BLAST algoritmidan foydalanadigan genotiplash vositasi, bir nechta ketma-ketlikni global tekislash uchun moslashtirish vositasi, OIV-1 avtomatik ketma-ketlik izohlash vositasi va izohli xaritalar. GenBank, FASTA va grafik formatlarda ko'rish mumkin bo'lgan ko'plab retroviruslar, ular bilan bog'liq ketma-ketlik yozuvlariga havolalar mavjud.
SARS koronavirusi (CoV) boʻyicha maʼlumotlarning qisqacha mazmuni, jumladan, eng soʻnggi ketma-ketlik maʼlumotlari va nashrlarga havolalar, SARS bilan bogʻliq boshqa manbalarga havolalar va turli xil izolyatsiyalar genomlari ketma-ketligini oldindan hisoblab chiqilgan moslashtirish.
Sequence Read Archive (SRA) Roche 454 GS System®, Illumina Genome Analyzer®, Life Technologies AB SOLiD System®, Helicos Biosciences Heliscope®, Complete Genomics® va Pacific Bioscience kabi keyingi avlod sekvensiya platformalaridan olingan ketma-ketlik ma'lumotlarini saqlaydi.
Protein ma'lumotlar bankidan olingan makromolekulyar 3D tuzilmalarni, shuningdek ularni vizualizatsiya qilish va qiyosiy tahlil qilish vositalarini o'z ichiga oladi.
NCBI ma'lumotlar bazasida molekulyar ma'lumotlarga ega bo'lgan 160 000 dan ortiq organizmlarning nomlari va filogenetik nasllarini o'z ichiga oladi. Taksonomiya ma'lumotlar bazasiga yangi taksonlar qo'shiladi, chunki ular uchun ma'lumotlar saqlanadi.
GenBankdagi mavjud asosiy ketma-ketlik ma'lumotlaridan tuzilgan ketma-ketliklarni o'z ichiga olgan ma'lumotlar bazasi. Ketma-ketliklar va tegishli izohlar eksperimental ravishda qo'llab-quvvatlanadi va ko'rib chiqiladigan ilmiy jurnalda nashr etilgan. TPA yozuvlari nukleotidlar bazasi orqali olinadi.
DNK ketma-ketligi xromatogrammalari (izlari), asosiy qo'ng'iroqlar va turli xil keng ko'lamli ketma-ketlik loyihalaridan bir martalik o'qishlar uchun sifat baholari ombori.
Resurslarning keng doirasi, jumladan viruslar biologiyasining qisqacha xulosasi, Entrez Genome-dagi virusli genom ketma-ketligiga havolalar va Virusli Reference Sequences haqida ma'lumot, minglab virusli genomlar uchun mos yozuvlar ketma-ketliklari to'plami.
Gripp virusi resursining boshqa organizmlar uchun kengayishi, tanlangan viruslar ketma-ketlik to'plamini, tahlil vositalarini, shu jumladan virusga xos BLAST sahifalarini va genom annotatsiyasi quvurlarini yuklab olish uchun interfeysni taqdim etadi.