«биоинформатикага муқаддима»

Полимераза занжир реакцияси (ПЗР) 
Полимераза занжир реакцияси -молекуляр -биологик усул бўлиб, in vitro аниқ бир 
ДНК фрагменти нусхасини жуда катта миқдорда ( 10
12
маротабагача) ошириш имконини 
беради. Бу усул 1983 йилда Кери Мюллис томонидан кашф этилган бўлиб, ушбу 
кашфиѐти учун 1993 йилда М. Смит билан бирга кимѐ йўналишида Нобел мукофоти 
совриндори бўлган.

---

Усул сунъий шароитда ферментлардан фойдаланган холда ДНКнинг аниқ бир 
участкасини кўп маротаба танлов асосида нусха олишига асосланган. Шу билан бир 
қаторда фақатгина берилган шартларни қондирувчи ДНК участкасидан нусха олинади ва 
у тадқиқ қилинаѐтган шароитда мавжуд бўлиши керак. Тирик организмлар ҳужайрасида 
кечувчи ДНК репликацияси жараѐнидан фарқли равишда ПЗР ѐрдамида ДНКнинг 
нисбатан кичик участкалари амплифицирланади (одатда 3000 жуфт нуклеотиддан 
ортмайди, лекин шундай усуллар мавжудки нуклеотид жуфти сонини 20 минггача 
"кўтаради" -у Лонг Ранге ПCР деб номланади). 
Хақиқатдан, ПЗР ДНК фрагментининг кўп маротабалик сунъий репликацияси 
саналади. ДНК -полимеразалар шундай тузилганки, фақатгина матрица ва мономерларга 
эга холатда янги ДНКни синтез қилолмайди. Бунинг учун уларга синтезни бошлаб 
берувчи томизғи яъни праймер керак бўлади. Праймер - бу ДНК-матрицага комплементар 
бўлган қисм, бир занжирли нуклеин кислота фрагментидир. Ҳужайрада репликация 
жараѐнида бундай праймерлар махсус праймаза ферменти томонидан синтезланади ва 
кейинчалик ДНК билан ўрин алмашинувчи РНК молекулалари хисобланади. Аммо, 
ПЗР.да сунъий синтезланган ДНК молекулаларидан фойдаланилади. Чунки бу ерда 
РНКни йўқотиш ва унинг ўрнига ДНКни синтезлаш босқичларининг кераги йўқ. ПЗР.да 
праймерлар амплифицирланувчи участкани иккала томондан чегаралаб олади.
ПЗР.нинг ишлаш механизмини. Дастлаб, реакцион қоришмага ДНК-матрица, 
праймерлар, ДНК-полимераза, эркин нуклеозидлар (янги синтезланувчи ДНКнинг 
бўлажак "харф"лари), ҳамда полимераза ишини яхшиловчи бир қатор бошқа моддалар 
(уларни реакцияда қўлланилувчи махсус буферларга жойлаштиришади) жойланади.