«биоинформатикага муқаддима»

"Реал вақт"даги ПЗРнинг ишлаш схемаси: Taq Man Assay. "TaqMan" вики-мақоласидаги расм. 
"Реал вақт"даги ПЗРдаги флуоресценция тўпланиб бориши эгри чизиғи: флуоресценция 
интенсивлигининг сикл номерига боғлиқлиги (ба`зи бир пробиркаларнинг ўз эгри чизиги мавжуд). 
 
Бундай ѐндашувни амалга оширишнинг энг кенг тарқалган усули зондни парчалаш 
хисобига флуорофорни юлиб олиш саналади. Бу холатда реакция қоришмасида яна бир 
компонент мавжуд бўлиши керак -махсус бир занжирли ДНК-зонд: праймерлар орасида 
жойлашган, амплифицирланувчи фрагмент кетма -кетлигига комплементар ДНК 
молекуласи. 
Бунда 
унинг 
бир 
учига 
кимѐвий 
йўл 
билан 
флуорофор 
(флуоресценцияланувчи молекула), бошқасига эса -ўчирувчи (флуорофор энергиясини 
ютиб юборувчи ва флуоресценцияни "ўчирувчи" молекула) ўрнатилган бўлиши керак. 
Бундай зонд эритмада мавжуд бўлганда ѐки бутун кетма -кетлик билан комплементар 
боғланганда флуорофор ва ўчирувчи бир -бирига яқин жойлашади ва флуоресценция 
кузатилмайди. Аммо, Тақ-полимераза таркибига кирувчи 3-екзонуклеазанинг фаоллиги 
хисобига (яъни у синтез жараѐнида тўқнашувчи ва унинг ўрнига янгисини синтезловчи 
ДНКни парчалайди) иккинчи занжир синтезида зонд парчаланиб кетади, флуорофор ва 

---

ўчирувчи диффузия хисобига бир -биридан узоқлашиб, флуоресценция намоѐн бўлади. 
ПЗР жараѐни давомида нусхалар сони экспоненциал тарзда ортганлиги сабабли 
флуоресценция ҳам ортади. Лекин, бу полимераза фаоллигининг секин -аста тушиб 
бориши, қайсидир компонентларнин гетишмаслиги каби жараѐнлар хисобига узоқ давом 
этмайди. Флуоресценция графиги ўсишини таҳлил қилиш орқали ПЗР бориши хақида 
кўп нарсаларни билиш мумкин, лекин, энг мухими дастлаб қанча ДНК-матрицалар 
бўлганлигидир: бу миқдорий ПЗР (quaintitive PCR, qPCR ) деб номланади .
ПЗРнинг илмий сохада қўлланилишининг барча вариантларини келтириб ўтишнинг 
иложи йўқ. ДНК фрагментини ажратиб олиш, секвенирлаш, мутагенез... ПЗР -илмий 
мақсадларда энг кўп қўлланилувчи усул саналади. У тиббиѐтда ирсий ва юқумли 
касалликларни олдиндан диагностика қилишда, оталикни аниқлашда, шахсни аниқлаш 
ишларида кенг қўлланилиб келади .