3-ma'ruza Mavzu: Oqsillar va aminokislotalarning inson ovqatlanishidagi fiziologik ahamiyati

Shakl: 2.9. Polipeptid zanjiri tuzilishidagi atomlar orasidagi masofa va burchaklar

disulfid aloqalarini olib, keyin aminokislotalar tarkibini, N-terminal va C-terminal aminokislotalarni va aminokislotalarning bir-biriga qo'shilish tartibini aniqlang. Disulfid -S-S- aloqalari kuchli oksidlovchi (ijro kislotasi) yoki qaytaruvchi vosita bilan yopiladi va aminokislotalar tarkibi peptid aloqalarini 6 N HC1 eritmasi bilan 110 ° C vakuumda 24 soat davomida gidroliz qilgandan keyin aniqlanadi. Triptofanni tahlil qilish uchun ishqorli gidroliz o'tkaziladi, chunki kislotali muhitda bu aminokislota yo'q qilinadi. Gidroliz natijasida olingan aminokislotalar aralashmalari xromatografiya orqali kation almashinadigan qatron bo'yicha taqsimlanadi va aniqlanadi (Oqsilni miqdoriy va miqdoriy aniqlashga qarang).

Aminokislota qoldiqlarini bir-biri bilan bog'lash tartibi kimyoviy (Edman usuli) va enzimatik usullar bilan belgilanadi. Enzimatik usullar fermentlarning o'ziga xos xususiyatlariga asoslanadi. Shunday qilib, tripsin lizin va arginin karboksil guruhlari darajasida molekulani, ximotripsin aromatik aminokislotalarning karboksil guruhlarini parchalaydi:

Aminokislotalar qoldiqlari ketma-ketligini tahlil qilish uchun boshlang'ich material uch qismga bo'linadi, ulardan biri sovuq HC1, ikkinchisi tripsin bilan, uchinchisi esa ximotripsin bilan ishlanadi. Olingan peptidlarning aralashmalari aminokislota tarkibi uchun tahlil qilinadi va nihoyat ekzopeptidazalar (amino va karboksipeptidazlar) bilan davolanadi. Natija peptidning parchalanishi zanjirning muayyan nuqtalarida sodir bo'lishini hisobga olgan holda umumlashtiriladi. Quyidagi rasmda bug'doyning birinchi 25 aminokislotalari a 2 - va γ 1, bug'doy peptidining aminokislotalar ketma-ketligi ko'rsatilgan va shu bilan Amerika Ponca kultivari uchun hal qilingan.

Protein molekulasining polipeptid zanjiri bir xil tekislikda yotmaydi. Poling va Kori ko'plab oqsillar spiral shaklida konfiguratsiyaga ega ekanligini ko'rsatdi, bu ularni xayoliy silindr bo'ylab harakatlanadigan spiral shaklida osonlikcha tasavvur qilish mumkin. Ushbu tuzilma -CO va -NH orasidagi vodorod aloqalarining ko'pligi sababli barqaror