Ўзбекистон республикаси соғЛИҚни сақлаш вазирлиги тошкент фармацевтика институти

Оддий фрагмент ионлар
Молекуляр ионларда боғларнинг гомолитик узилиши натижа-
сида оддий фрагмент ионлар вужудга келади. Буларга мисол тариқасида М⁺ ионлардан метил, гидроксил, этил, пропил, фенил ва бошқа радикалларни ажралишини келтириш мумкин.
Ионларнинг қайта группаланиши
Кўпгина моддаларнинг молекуляр ионлари ва кейинги парчаланиш босқичига ўтган оддий фрагмент ионлар қайта группаланиш жараёни орқали нейтрал фрагментлар ҳосил қилиб парчаланадилар.  
Қайта группаланиш йўли билан борадиган фрагментация жа
раёни тўрт, олти ва ундан кўп аъзоли ўтиш холатларига эга
бўлиши мумкин.
Метастабил ионлар
Масс-спектрларда асосий М⁺ион чўққиларидан ташқари интенсивлиги паст дунгсимон-қавариқ сигналларни пайдо бўлганини кузатиш мумкин. Бу сигналлар доимо касрли m/z қийматларга тўғри келади. Бундай чўққилар масс-спектрометрияда метастабил ионларнинг чўққилари деб юритилади.
Метастабил ионларнинг тадқиқоти моддаларнинг фрагмента-
ция йўлларини ва ионларнинг термодинамик жараёнларини ўрганишда аҳамияти каттадир.
Қўшзарядли ионлар
Ионизация жараёнида молекулалардан бир нечта электронларнинг уриб чиқарилишидан кўп зарядли ионлар вужудга келади. Кўпинча тўйиниш даражаси ўта паст бўлган кўп халқали моддаларнинг молекулалари бундай жараёнга мойил бўлади.
М⁺е^- ---> М⁺⁺+ 3е^-
m/2z
m массали zv энергияли кўп зарядли ионларнинг спектрда-
ги m/z қиймати масс-спектрометриянинг формуласига мувофиқ уларнинг хақиқий массасидан зарядига мос равишда -2, 3 ёки 4 маротаба кичик бўлади. Одатда бундай ионлар спектрда учи ўткир интенсивлиги паст бўлган нозик сигнал беради.
Беқарор икки зарядли ионлар парчаланганда иккита бир
зарядли ёки биттадан қўшзарядли ион ва нейтрал фрагментларни вужудга келтириш мумкин:
m₂+ m₁⁺⁺ ----> M⁺⁺ ---> m₁⁺ + m₂⁺