Kurs ishining obyekti:
Genlarni kartalashtirish va filogenetik shajaralarni
tuzish dasturlari haqida darsliklar .
Kurs ishining maqsadi:
Kartalashtirish dasturlarini o’rganish ,seleksioner
olimlar tamonidan g’o’zada hosildorlik va tola sifatlarini genetik jixatdan
takomillashtirish ,malekulyar markerlar haqida ma’lumotga ega bo’lish
,O’simliklarda assosiativ kartalashtirish jarayonini bosqichlarini bilishdan iborat.
Kurs ishining vazifasi:
Kartalashtirish uchun qulay populyatsiyalar
boshlang’ich namunalarida tegishli malekulyar markerlarni rivojlantirish.
Seleksiyada g’o’za va boshqa ekinlarni yangi navlarini takomillashtirish.
3
Kurs ishining amaliy ahamiyati:
G’o’za , makkajo’xori ,va arpa dunyo
bo’yicha muhim qishloq xo’jalik ekinlari xisoblanganligi uchun o’simliklarni
assossiativ kartalash tadqiqotlari ekinlarning genetik takomillashishi va kelgusida
dunyo oziq –ovqat xavfsizligi uchun muhim axamiyatga ega.
Kurs ishining tuzilishi:
Kurs ishi kirish, II Bob , xulosa , foydalanilgan
adabiyotlar ro’yxati va 30 sahifadan tashkil topgan.
4
I.BOB. Kartalashtirish dasturlari.
1.1.Genlarni filogenetik shajaralarini tuzish.
Proteomika oqsillarning o’zaro ta’sirini kuzatishga imkon beradi. Bu, masalan,
hujayralar yuzasidan signallarni yadrodagi selektiv transkripsiya omillariga
yetkazish
uchun
qo’llaniladi.
Uning
yordami
bilan
nafaqat
immunosupressiya
skrining texnologiyasi
, balki umuman signal o’tkazuvchanligi
ham o’zgarishi mumkin. Proteomika usullari yangi potentsial antimikrob
agentlarning hujayrasi bilan o’zaro ta’sirining to’liqroq, keng qamrovli ko’rinishini
beradi. Proteomika yordamida mikroorganizmlarda ikkilamchi metabolik
fermentlarning biosintezi dinamikasi bo’yicha tadqiqotlar yangi, yuqori darajaga
o’tkazilishi mumkin.Proteomika va genomika o’rtasidagi aloqaga
qaytsak, shuni
ta’kidlash kerakki, proteomikani funktsional genomikaning davomi deb atash
mumkin. Genomikadan farqli o’laroq, proteomikani o’rganish mavzusi hozirgi
vaqtda ekspresatsiya qilingan genlar tomonidan kodlangan mahsulotlarga
qaratiladi.Ba’zi tu
rlarning mikroorganizmlarning minimal genomlari bir necha yuz
genlardan iborat. Inson genomi yuz ming genga yaqinlashmoqda. Maxsus
genlarning o’lchamlari mingga yaqin asosiy juftlikdan va undan ko’pdir. Shunday
qilib, individual genomni tashkil etuvchi tayanch juftliklari soni kamida yuz minglab,
odatda ko’p millionlab tayanch juftliklari bilan o’lchanadi.Shuning uchun organizm
genomini to’liq bilish uchun bir necha million nukleotid juftlarining ketma
-ketligini
aniqlash
kerak A-T - adenin-timidin
, G-C - guanidin-sitozinkomplementarlikasosida.
"Sekvenirlanish" ni amalga oshirish uchun, qo’llanilgan ibora bo’yicha, butun
genom faqat yuqori texnologiyalar va tegishli uskunalar mavjud bo’lgand
a amalga
oshiriladi.
Hozirgi kunda dunyodagi ko’plab o’nlab laboratoriyalarning kundalik ishlarining
natijalari bo’yicha bir millionga yaqin bazaviy juftliklar ketma
-ketlik tadqiq
qilmoqda. Qabul qilingan ma’lumotlarni saqlash va ulardan ba’zilari xalqaro
5
maqomga ega bo’lgan maxsus ma’lumotlar bazalariga murojaat qilmasdan
foydalanish mumkin emas. Genomik tadqiqotlar instituti (AQSh) va Heidelberg
universiteti (Germaniya) ma’lumotlar bazalari keng tanilgan. Xalqaro ma’lumotlar
bazalari gen va uning patogenlar orasida tarqalishi to’g’risida ma’lumot beradi;
ushbu gen tomonidan kodlangan mahsulot va ushbu metabolik sikldagi oqsil
molekulasining ishtiroki to’g’risida; uning sikldagi o’ziga xos r
eaktsiyasini
katalizatsiyasi haqidagi ma’lumotlarni olish imkonini beradi. Boshqacha qilib
aytganda, antimikrob moddalarni, metabolizmning selektiv inhibitorlarini tanlash
uchun dastlabki sinov ob’ekti endi mikrobial kultura emas, balki gen aniqrog’i, u
kodlaydiganmahsulothisoblanadi.
Birikkan holda irsiylanuvchi bir xromosomada joylashgan genlar majmuiga birikish
gumhi deyiladi. Organizmdagi genlaming birikish guruhi shu organism
xromosomalarining gaploid to’plamiga teng bo’ladi. Jumladan makkajoxorida (Ze
a
mays) xromosomaning gaploid to’plami va birikish guruhi 10 ga, no‘xatda
(Pisumsativum) 7 ga, drozofila mevapashshasida (Drosophila melanogaster) 4 ga,
odamda
(Homo
sapiens)
23
gateng.
Ma’lum birikish guruhga kilqan genlaming joylashish tasviri genetic xa
rita deyiladi.
Birinchi marotaba genetic xarita 1911 yili A.Stertevant tomonidan X xromosomada
tuzilgan. Genetik xarita tuzish nihoyatda murakkab jarayon bo’lib,
hozircha
drozofila
, makkajo‘xori, no’xat, pomidor, sichqon, neyrospora, ichak tayoqchasi
bakteriyasi, odamning genetic xaritasi tuzilgan. Genetik xarita tuzish uchun
nihoyatda ko‘p genlarni irsiylanish tipi o‘rganiladi. Chunonchi, drozofila 4 ta birikish
guruhidagi 5
00, makkajo‘xorida 10 ta guruhga birikkan 400 ta genlar, uysichqonida
15 guruhga birikkan 200 ta genlarni irsiylanish tiplari o’rganilgan. Genetik xaritada
organizmning
xar
bir
birikish
guruhi
alohida
Tasvirlanadi va ularda joylashgan genlaming qisqartirilganliomi, genlar orasidagi
masofa krossingover foizlari natijalariga qarab belgilanadi. Genlar orasidagi
6
masofani ifodalashda xromosomaning bosh qismi nilokusini nol deb olinib unga
nisbatan genlami krossingover foizlari hisoblanadi. Shuning uchun genetic xaritada
genlami lokusini krossingover miqdorida ifodalashda 50, 100 va undan ortiq
raqamlar
uchrashi
mumkin.
Yuqorida qaydetilganidek genetic xarita tuzganda belgilami ifoda etuvchi
genlaming bosh harfi yoziladi. Masalan, drozoflla tanasining sariq bolishi yollow
—
y, qanotining rudiment bo£lishi rudimentary —
r, vertigial - v qanot, black - b tana,
echinus -
e ko£zninging liztilidagi oldingi harfl bilan ifodalanadi.
Birinchi marotaba A.Stertevant genlar xromosomada birikkan holda
bo‘lganda X xromosomada turli mutatsiyali drozofilalami chatishtirib Fb da
rekombinantlashgan duragay organizmlaming miqdoriga qarab xromosomadagi
genlar joylashishi zchilligini, bir gen bilan qo‘shni gen orasidagi
masofaga qarab
bilish mumkin
, degan xulosaga keldi.Odamning genetic xaritasini tuzish XX asrning
70-yillarida boshlangan. Keyingi yillarda yangi tadqiqot metodlarini qoilash
natijasida deyarli barcha xromosomalardagi ko‘pchilik genlarning joylanishi
aniqlandi.
Bakteriyalaming genetic xaritasi eukariotlami genetic xaritasidan tubdan farq
qiladi. Ma’lumki mikroorganizmlarda genlar rekombinantlashuvi bir tomonlama
bo‘ladi. Jumladan oshqozon tayoqchasi (Escherichia coli) bakteriyasida irsiy axborot
almashinuvi bakte
riyalar orasidagi kon’yugatsiya davrida bir tomonlama sodir
bo’ladi. Bakteriyadagi xalqasimon yagona xromosoma kon’yugatsiya davrida
ma’lum bir joydan uzilib ikkinchi bakteriyaga uzatiladi. Xromosomaning uzatilgan
qismining masofasi kon’yugatsiya davrining
vaqti bilan belgilanadi. Kon’yugatsiya
qanchalik uzoq davom etsash unchalik bir xromosomadan ikkinchi xromosomaga
irsiy axborot, ya’ni genlar ko‘p o’tadi. Shu sababli bakteriya xalqasimon
xromosomasidagi genlar orasidagi masofa vaqt biriiklari bilan ifodalanadi
Genetik xaritadan farqli ravishda sitologik xaritada genlarni xromo
s
om
adagi
7
haqiqiy o‘miuzunlik birliklarida ifodalanadi.
Birinchi bor sitologik xarita drozofila
meva pashshasining so‘lak bezlaridan olingan gigant xromos
omalarida tuzilgan.
joylanish izchilligi bir biri gamosekanligi aniqlandi. Amerikalik olim K.Bridjes
drozofila mevapashshasi ninguchta autosomava X xromosomasining genetic va
sitologik xaritasidagi genlar orasidagi masofani oichab taqqosladi. Bunda genetic
xaritada umumiy masofa 279 krossingover foizini tashkil qilsa, mikroskop ostida
oichanganda bu xromosomalaming tabiiy uzunligi sitologik xaritada 1180 mkm ga
teng boidi. K.Bridjes xromosomalaming tabiiy uzunligini (1180 mkm) genetic
xaritadagi krossingover foizlaridagi uzunligiga (279 krossingover) taqsimlab
krossingover koeffitsient birligi 4,2 teng ekanligini maiumqildi. Shunday qilib
genetic xaritada 1% krossingoverga sitologik xaritada 4,2mkm birlik moskelar ekan.
Jumladan drozofilaning X xromosomasida y va ecgenlari orasidagi masofa genetic
xaritada 5,5% tashkiletadi. Shu genlar orasidagi koeffitsientidan foydalanib
hisoblaganimizda ular o‘rtasidagi tabiiy masofa sitologik xaritada 5,5X4,2=23 mkm
tashkil qiladi.
Do'stlaringiz bilan baham: |