Muhandislik qilingan oqsil-oqsil kompleksining strukturasini aniqlash va termodinamik stabilizatsiyasi

Protein-oqsil o'zaro ta'siri
,
tadqiqot, Uells va uning hamkasblari inson o'sish gormoni (hGH) ning bog'lanish interfeysini o'rganishdi.
Tanish sohasida o'rtacha o'nta vodorod aloqasi mavjud bo'lib, ulardan deyarli bittasi
. ning 27%
oqsil boshqasining bo'shlig'iga mahkam joylashadi. Ta'rifga ko'ra, issiq nuqta mutatsiyasi tomonidan harakat qiladi
Bog'lanish yaqinligi uchun muhim bo'lgan yon zanjirlarni aniqlash uchun alanin bilan interfeys
kristall tuzilmalar tomonidan qo'llab-quvvatlanadi, bu ikkalasining issiq nuqtalari o'rtasida yuqori to'ldiruvchilikni ko'rsatadi
bog'langanda erituvchiga etib bo'lmaydi. Aksariyat komplekslar ushbu diapazonning pastki qismida to'planganligi
aniqlandi, 75 tadan 55 tasi (70%) standart o'lchamda, 1250-2000 Å2.
Katta interfeyslarga ega bo'lgan oqsil komplekslari, ko'pincha bog'lanishdan keyin katta konformatsiyalar kuzatiladi
Alanin skanerlash mutagenezi shuni ko'rsatdiki, issiq nuqtalar deb ataladigan qoldiqlar muhim ahamiyatga ega
interfeysi boshqalarga qaraganda yaqinlikka ko'proq ta'sir ko'rsatdi va o'zaro ta'sir qilish nuqtasini tashkil etdi. Bu ta'sir
va retseptorning hujayradan tashqari domeni (hGHbp) (Wells 1991; Clackson and Wells 1995).
oligomerik oqsillarning o'zaro ta'sir yuzasiga o'lchami. Biroq, ular kamroq ekanligi aniqlandi
Interfeys maydoni ikkala oqsilning maydoni sifatida aniqlanadi
chunki obligat bo'lmagan komplekslar barqaror va suvda eruvchan bo'lishi kerak, ammo majburiy oqsil
Conte va boshqalar. 1999).
bog'langan davlat ansamblini bog'lanmaganga nisbatan beqarorlashtirish (DeLano 2002). Kashshoflikda
shunga o'xshash
uchinchisi zaryadlangan yon zanjirni o'z ichiga oladi. Tuzli ko'priklar ham keng tarqalgan. Karbonil kislorod - bu
19
o'zgarishlar.
ion juftlarini va bittasining hidrofobik qoldiqlarini hosil qiluvchi ko'milgan zaryadlangan qoldiqlarga ega molekulalar
bog'lovchi yaqinlik (Clackson and Wells 1995; Bogan and Thorn 1998; Hu va boshq. 2000). Bu uzoqroq
.
komplekslar bo'lmasligi mumkin (Lo Conte va boshq. 1999). Oligomerik oqsillar va oqsillarning o'xshash xususiyati
murakkab. Ular ba'zi aminokislotalarning yadro mintaqasida almashinishini aniqladilar
Lo Konte va uning hamkasblari interfeys maydonlarining umumiy diapazoni 1150 dan 4660 Å2 gacha keng ekanligini
aniqladilar.
hidrofobik va oligomerik birikmalarga qaraganda ko'proq zaryadlangan guruhlarni o'z ichiga oladi. Bu ajablanarli emas
Ular bog'lanishda individual aminokislotalarni almashtirish uchun alaninni skanerlash usulidan foydalanganlar
interfeysdagi eng keng tarqalgan vodorod aloqasi qabul qiluvchisi. (Jons va Tornton 1996; Lo
4.4 Issiq nuqtalarning xarakteristikalari
4.3 Interfeysning o'lchami
oqsil komplekslari 2000-4660 Å2 oralig'ida kattaroq interfeysga ega edi.
Machine Translated by Google

---