Kimyoda qo’llaniladigan hisoblash majmualari
Ta’kidlab o’tilganidek, informasion texnologiyalar rivojlanishi bilan kimyoda ishlatiladigan programma majmualari sifat va miqdor jihatdan rivojlandi va rivojlanmoqda. Ularning asosiy turlari www.freechemical.info internet sahifasida tavsiflangan. Biz faqat ayrimlari xaqida to’xtalamiz xolos. Eng birinchi yaratilgan va mashhur hisoblash majmualaridan biri J. Popl tomonidan yaratilgan GAUSSIAN hisoblash majmuasidir. Bugungi kunda ushbu usulning shaxsiy kompyuterlarga mo’ljallangan Windows va Linux operatsion sistemalarida ishlaydigan variantlari yaratilgan. GAUSSIAN hisoblash majmuasi keng imkoniyatga ega bo’lib, kimyoning deyarli barcha sohalaridagi muammolarni yechishga mo’ljallangan va o’z ichiga ayrim yarim empirik hamda juda ko’p noempirik hisoblash usullarini qamrab olgan. GAMESS (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) Gordon guruhi tomonidan yaratilgan kvant-kimyoviy hisoblash majmuasi sanaladi. Uning PC/GAMESS varianti A. Granovskiy tomonidan Windows uchun modifikasiya qilingan. Ushbu variant 2009 yildan boshlab Firefly deb nomlanmoqda. U bir necha yarim empirik va noempirik hisoblash usullarini o’z ichiga olgan. Shuningdek, ushbu dasturda DFT, MP2-4 hisoblashlarini va UB- hamda IQ-spektrlarini DFT yoki noempirik usullarda hisoblash mumkin. Oxirgi paytlarda yaratilgan va juda mukammal kompyuter majmualaridan biri ORCA hisoblanadi. Ushbu dastur nemis olimi Frank Niz ( F Neese ) tomonidan yaratilgan. rank empirik, noempirik va DFT hisob imkoniyatini beradi. lashlarini Dastur empirik, yarim amalga oshirish Majmuaga juda ko’p bazis to’plamlari va DFT usullari kiritilgan. ORCA majmuasi xuddi Gaussian va GAMESS kabi qora fonda (cmd.exe dasturida) ishlaydi, ya’ni birikmalarning dastlabki geometriyalarini chizish yo ’li bilan hosil qilish imkoniyati yo’q. Dastlabki geometriyalar boshqa yordamchi dasturlar (Avogadro, ChemCraft) orqali hosil qilinadi va natijalar visuallashtiriladi. Ham yarim empirik ham noempirik, s huningdek molekulyar mexanika usullarida hisobkitob o ’tqazish majmualardan biri HyperChem hisoblanadi. GAMESS programmalaridan imkoniyatini beruvchi GAUSSIAN , ORCA va farqli ravishda hisoblanishi kerak bo’lgan birikmaning geometriyasi xuddi qalam bilan chizilgandek hosil qilinadi va hisoblashlarni bevosita k uzatib turish imkoniyati mavjud, yani vizualizatsiya qilingan. HyperChem programmasiga MM+, AMBER, BIO+ va OPLS MM usullari kiritilgan. Yarim empirik usullarining qariyb hammasi kirgan.
Ivtantermo ma’lumotlar bazasi
Serverning ushbu bo'limida Ivtanthermo ma'lumotlar bazasidan birikmalarning miqdori cheklangandir taxminan 300 ta mavjud. Jadvalda bir xil harorat uchun ikkita turli qator ko'rsatilgan bo'lsa, demak, bu nuqtada fazali o'tish sodir bo'ladi Birikmanini tanlash uchun uni ro'yxatda toping (ushbu birikma tarkibiga kiradigan har qanday elementlarga tegishli bo'limda, masalan, H2O vodorod va kislorod bo'limlarida berilgan)
H
H(g) H2(g) H2O(g) H2O2(g) HF(g) H6F6(g)
HCl(g) HOCl(g) H2SO4(g) NH3(g) N2H2(g) N2H2(g;1,1)
HNO2(g) HNO2(g;cis) HNO2(g;trans) HNO3(g)
NH4F(c) NHF2(g) CH(g) CH2(g) CH3(g)
CH4(g) C2H(g) C2H2(g) C2H3(g) C2H4(g)
C2H5(g) C2H6(g) HCO(g) COOH(g) H2CO(g)
HCOOH(g) CH2O2(g) HCOOH(g;cis) HCOOH(g;trans) CH3O(g)
CH2OH(g) CH3OH(g) C2H2O(g) C2H4O(g) C2H4O(g;*)
C2H4O2(g) C2H4O2(g;*) C2H4O3(g) C2H4O3(g;1) C2H5OH(g)
CHF(g) CH2F(g) CH3F(g) CHF2(g) CH2F2(g)
CHF3(g) C2HF(g) C2H3F(g) C2H5F(g;*) C2H2F2(g)
C
C(c;graphite) C(c;diamond) C(g) C2(g)
CCl(g) CCl2(g) CCl3(g) CCl4(g)
C2Cl(g) C2Cl2(g) C2Cl3(g) C2Cl4(g) C2Cl5(g)
CH3Cl(g) CHCl2(g) CH2Cl2(g) CHCl3(g) C2HCl(g)
C2H3Cl(g) C2H5Cl(g;*) C2H2Cl2(g) C2H2Cl2(g;1,1)
C2HCl5(g;*) HClCO(g) CFCl(g) CF2Cl(g) CF3Cl(g)
CFCl2(g) CF2Cl2(g) CFCl3(g) C2FCl(g) C2F3Cl(g)
C2F2Cl2(g) C2F2Cl2(g;1,1) C2F2Cl2(g;cis) C2F2Cl2(g;trans)
FClCO(g) CHFCl(g) CH2FCl(g) CHF2Cl(g) CHFCl2(g)
C2H2FCl(g) C2H2FCl(g;1,1) C2H2FCl(g;cis) C2H2FCl(g;trans)
C2HF2Cl(g;1,1) C2HF2Cl(g;cis) C2HF2Cl(g;trans) C2HFCl2(g)
C2HFCl2(g;cis) C2HFCl2(g;trans) CS(g) CS2(g)
CN(g) NCN(g) CNN(g) CNC(g) CCN(g)
C2N2(g) NCO(g) HCN(g) HNC(g) HCCN(g)
FCN(g) ClCN(g) CaCO3(c) Na2CO3(c)
F
F(g) F2(g) FO(g) F2O(g) HF(g)
H2F2(g) H3F3(g) H4F4(g) H5F5(g) H6F6(g)
HOF(g) ClF(g) ClF3(g) ClF5(g) SF(g)
SF2(g) SF3(g) SF4(g) SF5(g) SF6(g)
SSF2(g) FSSF(g) S2F10(g) FSO(g) SOF2(g)
Xulosa
Kompyuter kimyosi - kimyoning informatsion texnologiyalarsiz tasavvur qilish qiyin bo’lgan sohasi bo’lib, zamonaviy kimyoning ajralmas qismidir. Ushbu fan kvant-kimyoviy hisoblashlar bilan cheklanib qolmasdan o’z ichiga empirik usullarda birikmalarning turli xil fizik-kimyoviy xarakteristikalar hisobi, moddalar reaktsion qobiliyatini baholash va biologik faolliklarini ifodalovchi matematik modellar tuzish, hamda dinamik jarayonlarni modellash kabi izlanishlarni qamrab olmoqda. Dunyo olimlari tomonidan turli xil kimyoviy, spectral va boshqa muammolar modellashtirish dasturlari yordamida yechilmoqda. Mazkur muammolarni hal qilishda zamonaviy DFT usullarini o’z ichiga olgan Gaussian, ORCA, Firefly/GAMESS, Hyperchem kabi dasturlar keng qo’llanilmoqda.
Do'stlaringiz bilan baham: |