Трофимова Светлана Алексеевна, доцент кафедры ботаники и физиологии растений института биологии, экологии и агротехнологий ПетрГУ, кандидат биологических наук рабочая программа дисциплины

Собеседование
Средство контроля, организованное как специальная беседа преподавателя со студентом на темы, связанные с изучаемой дисциплиной, и рассчитанное на выяснение объема знаний обучающегося по определенному разделу, теме, проблеме и т.п.
Собеседование проводится с группой студентов по темам лабораторных занятий. Тематика лабораторных занятий и самостоятельной работы для их подготовки указаны в разделах 3.3 и 3.4.
Оценка собеседования проводится по 5-балльной системе

«5»	Обучающийся показал глубину, прочность, систематичность знаний; рациональность используемых подходов; умение поддерживать и активизировать беседу, вел себя корректно;
«4»	Обучающийся показал глубину, прочность, систематичность знаний; рациональность используемых подходов; ведение беседы не полностью соответствует требованиям к ней, что связано с недостаточностью профессионально значимых личностных качеств;
«3»	Обучающийся показал глубину, прочность, систематичность большинства полученных знаний; рациональность используемых подходов; ведение беседы не полностью соответст­вует требованиям к ней; отсутствует умение поддерживать и активизировать беседу;
«2»	У обучающегося отсутствует глубина, прочность, систематичность знаний; рациональность используемых подходов; умение поддерживать и активизировать беседу;
«1»	Обучающийся не участвовал в собеседовании.

Ситуационная задача
Учебная задача, сформулированная в терминах и условиях конкретной ситуации, с которой обучающийся может встретиться на практике. Решение ситуационной задачи является показателем качества самостоятельных занятий студента, знаний учебного материала, специальных исследований, источников, глубины проработанности рекомендованной литературы.
Пример ситуационной задачи
«Из культуры бактерий рода Bacillus был приготовлен фиксированный мазок и окрашен по методу Грама. К каким бактериям (грамположительным или грамотрицательным) относятся бациллы при окраске данным методом? Как будет изменяться цвет вегетативных клеток и спор на разных этапах окраски:
1-й этап – фиксированный неокрашенный мазок;
2-й этап – мазок после обработки генциановым фиолетовым и раствором Люголя;
3-й этап – мазок после обработки этиловым спиртом;
4-й этап – мазок после окраски фуксином (конечный результат)»
Ответ:
цель – изучить механизм окраски бактерий по методу Грама;
пояснение – бациллы являются грамположительными бактериями; на первом этапе вегетативные клетки и споры бактерий не окрашены; на втором этапе вегетативные клетки окрасятся в фиолетовый цвет, споры останутся не прокрашенными; после обработки спиртом вегетативные клетки останутся окрашенными в фиолетовый цвет, споры – не прокрашенными; на последнем этапе картина не изменится.

Оценка решения ситуационных задач обучающимися проводится по 5-балльной системе

«5»	Задача выполнена верно и полностью; в логических рассуждениях и обосновании решения нет пробелов и ошибок; в решении нет ошибок (возможна одна неточность, описка, не являющаяся следствием незнания или непонимания учебного материала);
«4»	Задача выполнена полностью, но обоснования шагов решения недостаточны (если умение обосновывать рассуждения не являлось специальным объектом проверки); допущена одна ошибка или два-три недочета (если эти виды работы не являлись специальным объектом проверки); выполнено без недочетов не менее 3/4 задачи;
«3»	Допущены более одной ошибки или более трех недочетов, но обучающийся владеет обязательными умениями по проверяемой теме; без недочетов выполнено не менее половины задачи;
«2»	Допущены существенные ошибки, показавшие, что обучающийся не владеет обязательными умениями по данной теме в полной мере; правильно выполнено менее половины задачи;
«1»	Ситуационная задача не решена.

Реферат
Продукт самостоятельной работы обучающегося, представляющий собой краткое изложение в письменном виде полученных результатов теоретического анализа определенной учебно-исследовательской темы, где автор раскрывает суть исследуемой проблемы, приводит различные точки зрения, а также собственные взгляды на нее.
В течение семестра каждому студенту необходимо подготовить и оформить один реферат. Реферат готовится после прослушивания лекций и освоения всех разделов дисциплины. Преподаватель, закрепляя за студентом тему реферата, выдает рекомендации по необходимой литературе, предоставляя также студенту самостоятельно провести поиск по базам данных в Интернете и в библиотеках.

Темы рефератов

1. 
   Исторический очерк рождения гипотез о происхождении жизни на Земле и роли микроорганизмов в эволюции биосферы.
   
2. 
   Роль Л. Пастера и Р. Коха в становлении микробиологии.
   
3. 
   Два надцарствапрокриот: бактерии и археи, их основные филогенетические линии.
   
4. 
   Микобактерии: особенности строения клеточной стенки.
   
5. 
   Методы современного типирования бактерий: геномный и протеомный анализ.
   
6. 
   Особенности методов внутривидовой идентификации бактерий.
   
7. 
   Современные аспекты проблемы микробного биоразнообразия.
   
8. 
   Использование микроорганизмов в биологических тест-системах.
   
9. 
   Происхождение эукариотической клетки (влияние горизонтального переноса генов, рождение науки молекулярной экологии).
   
10. 
    Микроводоросли: классификация, места обитания, особенности строения, питания и размножения.
    
11. 
    Микромицеты: классификация, места обитания, особенности строения, питания и размножения.
    
12. 
    Дрожжеподобные одноклеточные грибы: классификация, места обитания, особенности строения, питания и размножения.
    
13. 
    Гипотезы происхождения вирусов и бактериофагов на примере теорий прогресса и регресса.
    
14. 
    Онкогенные вирусы. Теория вирусного онкогенеза Зильбера.
    
15. 
    Retroviridae: классификация, ультраструктура, репродукция, этапы взаимодействия с чувствительной клеткой.
    
16. 
    Rеoviridae: классификация, ультраструктура, репродукция, методы индикации и идентификации.
    
17. 
    Togaviridae: классификация, ультраструктура, репродукция, методы индикации и идентификации.
    
18. 
    Вирусные заболевания растений.
    
19. 
    Вирусные заболевания насекомых.
    
20. 
    Генная инженерия и генетика вирусов.
    
21. 
    Методы картирования вирусных геномов.
    
22. 
    Происхождение фотосинтеза и дыхания.
    
23. 
    Трофическое разнообразие : фото- и хемотрофы, лито- и органотрофы, авто- и гетеротрофы.
    
24. 
    Группы фотосинтезирующих микроорганизмов: сущность микробного фотосинтеза.
    
25. 
    Группы хемосинтезирующих микроорганизмов: сущность микробного хемосинтеза.
    
26. 
    Аэробы и анаэробы связь с типом метаболизма.
    
27. 
    Кинетика роста микроорганизмов, закономерности отмирания, анабиоз.
    
28. 
    Психрофилы, мезофилы, термофилы (точки роста, зоны оптимума).
    
29. 
    Галлофилы, морские и пресноводные формы.
    
30. 
    Свет и хроматическая адаптация , устойчивость к излучениям.
    
31. 
    Значение абиогенной составляющей для формирования популяционной структуры вида.
    
32. 
    Общие представления об антибиотиках, принципы их классификации, механизмы действия.
    
33. 
    Методы поиска и выделения микробов-продуцентов антибиотических веществ.
    
34. 
    Пути биосинтеза, химическая и биологическая модификация природных антибиотиков и её значение.
    
35. 
    Особенности микроорганизмов, как важных биогеохимических агентов.
    
36. 
    Биогеотехнология – прикладной раздел микробной биогеохимии, учение об использовании микроорганизмов для добычи и переработки полезных ископаемых.
    
37. 
    Роль микроорганизмов в процессах добычи и переработки нефти, угля, природного газа, руды, черных, цветных, благородных металлов.
    
38. 
    Разнообразие почвенных бактерий.
    
39. 
    Определение понятия сукцессии, закономерности функционирования микробного сообщества.
    
40. 
    Образование торфа и гумуса, самоочищение почв.
    

Оценка реферативной работы обучающихся проводится по 5-балльной системе:

«5»	Содержание реферата информационно достаточно; материал соответствует теме и плану реферата; целесообразно используется терминология, поясняются новые понятия, цитаты оформлены правильно; присутствует выраженная собственная позиция; достаточное количество использованных источников (7-10); присутствует владение материалом;
«4»	Содержание реферата информационно достаточно; материал соответствует теме и плану реферата; целесообразно используется терминология, поясняются новые понятия, цитаты оформлены правильно; присутствует выраженная собственная позиция; достаточное количество использованных источников (7-10); владение материалом недостаточное;
«3»	Содержание реферата не имеет достаточный информационный материал; материал частично соответствует теме и плану реферата; специальная терминология используется редко, цитаты не оформлены правильно; отсутствует выраженная собственная позиция; недостаточное количество использованных источников (4-6); не владеет материалом;
«2»	Содержание реферата не информационно; материал не соответствует теме и плану реферата; не используется специальная терминология, цитаты не оформлены; отсутствует собственная позиция; количество использованных источников недостаточное (2-3); не владеет материалом.
«1»	Обучающийся не подготовил реферат

Доклад
Продукт самостоятельной работы обучающегося, представляющий собой публичное выступление по представлению полученных результатов решения учебно-исследовательской темы.
Доклад выполняется по заданной теме реферата с использованием средств презентации в программе MS PowerPoint продолжительностью до 10 мин.

Оценка доклада обучающихся проводится по 5-балльной системе

«5»	Выступление соответствует теме, поставленным целям и задачам; изложенный материал является актуальным, подчеркивается его проблемность и новизна; имеется доказательная база; презентация структурирована и подчеркивает целостность выступления; используются ссылки на информационные ресурсы; присутствует речевая культура, владение материалом , компетентность;
«4»	Выступление соответствует теме, поставленным целям и задачам; изложенный материал является актуальным, подчеркивается его проблемность и новизна; имеется доказательная база; презентация не полностью структурирована и не подчеркивает целостности выступления; используются ссылки на информационные ресурсы, но они недостаточны; присутствует речевая культура, есть недочеты во владении материалом, компетентность недостаточная;
«3»	Выступление соответствует теме, поставленным целям и задачам, но изложенный материал не является актуальным, проблемным и новым; имеется слабая доказательная база; презентация не структурирована и не подчеркивает целостности выступления; используются ссылки на информационные ресурсы, но они недостаточны; плохая речь, есть недочеты во владении материалом, отсутствует компетентность;
«2»	Выступление не соответствует теме, поставленным целям и задачам, изложенный материал не является актуальным, проблемным и новым; отсутствует доказательная база; презентация не структурирована и не подчеркивает целостности выступления; используются ссылки на информационные ресурсы, но они недостаточны; плохая речь, много недочетов, отсутствует компетентность;
«1»	Обучающийся не подготовил доклад-презентацию

5.2. Промежуточная аттестация проводится в видеозачета

Промежуточная аттестация проводится в виде зачета. К зачету допускаются обучающиеся, не имеющие задолженностей по всем видам занятий и работ в семестре. Форма зачета – собеседование по предложенным вопросам, на подготовку отводится 30 минут.

Вопросы к зачету

1. 
   Определение микробиологии, как науки. Предмет и задачи микробиологии.
   
2. 
   Роль А. Левенгука, Л. Пастера, Р. Коха , И. И. Мечникова, С. В. Виноградского в развитии микробиологии.
   
3. 
   «Морфологический период» в развитии микробиологии.
   
4. 
   «Эколого-физиологический период» в развитии микробиологии.
   
5. 
   Морфология бактерий. Формы и размеры бактериальной клетки.
   
6. 
   Строение и химический состав прокариотический клетки.
   
7. 
   Клеточная стенка грациликутных и фирмакутных бактерий. Механизм и теория окраски по Граму.
   
8. 
   Включения бактериальной клетки. Состав, организация, функции, методы выявления.
   
9. 
   Строение жгутика прокариот, пили. Типы движения микробов. Методы изучения подвижности.
   
10. 
    Капсула бактерий, значение, методы выявления.
    
11. 
    Споры и спорообразование бактерий. Варианты покоящихся форм бактерий. Методы выявления.
    
12. 
    Основные принципы классификации бактерий.
    
13. 
    Морфология актиномицетов и низших грибов.
    
14. 
    Размножение плесневых грибов. Экологическая роль в природе. Методы изучения морфологии низших грибов.
    
15. 
    Археи. Особенности строения.
    
16. 
    Микоплазмы и L формы.
    
17. 
    Риккетсии и хламидии.
    
18. 
    Строение дрожжевой клетки. Размножение дрожжей.
    
19. 
    Морфология микроформ водорослей и простейших.
    
20. 
    Питательные среды: классификация, требования, предъявляемые к питательным средам.
    
21. 
    Чистые культуры микроорганизмов: методы получения и назначение.
    
22. 
    Культивирование аэробных и анаэробных микроорганизмов.
    
23. 
    Классификация микроорганизмов по типам питания и способам получения энергии.
    
24. 
    Рост микроорганизмов: основные параметры роста и особенности отдельных фаз роста.
    
25. 
    Рост бактерий в непрерывных и периодических культурах.
    
26. 
    Действие физических и химических факторов на рост микроорганизмов.
    
27. 
    Природа антимикробных веществ и методы определения чувствительности микроорганизмов к антибиотикам.
    
28. 
    Понятие о стерилизации и дезинфекции.
    
29. 
    Метаболизм микроорганизмов. Основные представления.
    
30. 
    Транспорт веществ у прокариот через ЦПМ: понятие о протон-движущей силе.
    
31. 
    Роль ферментов в жизнедеятельности микроорганизмов. Конститутивные и индуцибельные ферменты. Локализация ферментов в клетке.
    
32. 
    Способы изучения биохимической регуляции метаболизма микроорганизмов.
    
33. 
    Аэробное дыхание бактерий: строение дыхательной цепи.
    
34. 
    Анаэробное дыхание бактерий: строение дыхательной цепи.
    
35. 
    Микроорганизмы, восстанавливающие нитраты, сульфаты, соединения железа.
    
36. 
    Определение понятия «брожение»: спиртовое, молочнокислое брожение. Микроорганизмы-участники.
    
37. 
    Окисление этилового спирта, масляно-кислое и пропионово-кислое брожение.
    
38. 
    Цикл соединений углерода в природе.
    
39. 
    Разложение микроорганизмами целлюлозы, лигнина, пектиновых веществ.
    
40. 
    Окисление микроорганизмами углеводородов, жиров.
    
41. 
    Микробиологические превращения соединений азота.
    
42. 
    Фиксация молекулярного азота.
    
43. 
    Аммонификация белков (минерализация азота).
    
44. 
    Разложение мочевины и цианамида. Аммонификация гумуса.
    
45. 
    Нитрификация: этапы и условия процесса.
    
46. 
    Прямая и косвенная денитрификация
    
47. 
    Биологическое связывание фосфора.
    
48. 
    Роль микробов в фосфорном питании растений.
    
49. 
    Биологическое окисление сероводорода и микроорганизмы, вызывающие его.
    
50. 
    Окисление и восстановление соединений железа микроорганизмами.
    
51. 
    Характеристика основных представителей железобактерий.
    
52. 
    Бактерии экстремальных условий обитания.
    
53. 
    Генетический аппарат прокариот.
    
54. 
    Особенности репликации, транскрипции, трансляции .
    
55. 
    Трансформация у прокариот: значение.
    
56. 
    Трансдукция у прокариот: значение.
    
57. 
    Конъюгация у прокариот: значение.
    
58. 
    Плазмиды и другие внехромосомные детерминанты наследственности прокариот.
    
59. 
    Генотипическая и фенотипическая изменчивость. Мутационная природа изменчивости.
    
60. 
    Генная инженерия: практическое значение учения о генетике микроорганизмов.
    
61. 
    История вирусологии. Происхождение вирусов, природа вирусов, прионы.
    
62. 
    Структура и химический состав вирусов.
    
63. 
    Культивирование и индикация вирусов.
    
64. 
    Взаимодействие вируса с чувствительной клеткой: продуктивная и интегративная форма взаимодействия.
    
65. 
    Этапы транскрипции у РНК- и ДНК- вирусов.
    
66. 
    Репликация вирусных РНК и ДНК: синтез вирусных белков.
    
67. 
    ВИЧ: взаимодействие вируса с чувствительной клеткой.
    
68. 
    Онкогенные вирусы: теория вирусного онкогенеза.
    
69. 
    Бактериофаги: классификация, взаимодействие с клеткой вирулентных фагов.
    
70. 
    Умеренные бактериофаги. Взаимодействие с клеткой, лизогения, фаговая конверсия.
    
71. 
    Фитопатогенные вирусы: механизм заражения вирусами растений, вироиды.
    
72. 
    Эволюция микробного паразитизма.
    
73. 
    Происхождение патогенных грибов.
    
74. 
    Патогенность и вирулентность.
    
75. 
    Инфекционный процесс: условия возникновения.
    
76. 
    Природа и свойства экзо- и эндотоксинов.
    
77. 
    Абиотические и биотические факторы среды, влияющие на микроорганизмы в экосистеме.
    
78. 
    Эпифитные микроорганизмы, роль в жизнедеятельности растений.
    
79. 
    Ризосферная микрофлора растений: гистосфера.
    
80. 
    Нормальная микрофлора человека и животных: биологическая роль, способы изучения.
    
81. 
    Микробиология воздуха и почвы. Санитарные исследования воздуха и почвы.
    
82. 
    Микрофлора воды. Санитарные исследования воды.
    
83. 
    Сапробность поверхностных водоемов: роль микрофлоры воды в естественном самоочищении.
    
84. 
    Микроорганизмы и макроорганизмы как симбиотические партнеры.
    
85. 
    Симбиотические ассоциации микроорганизмов: типы и функции симбиоза.
    
86. 
    Происхождение жизни, первичная клетка. Современные представления об эволюции микроорганизмов.
    
87. 
    Роль микроорганизмов почвообразовательном процессе.
    
88. 
    Роль микроорганизмов в детоксикации ядовитых веществ.
    
89. 
    Бактериальные удобрения.
    
90. 
    Использование микроорганизмов в биотехнологии.
    

Критерии оценивания