|
Член-корреспондент РАН, профессор С.Е. СЕВЕРИН
Список сокращений
Са
2+
— катион(ы) кальция, ион(ы)
кальция: ионизированный
(свободный) кальций
Сl
–
—
анион(ы)
хлора
FAD —
флавинадениндинуклеотид
FMN —
флавинмононуклеотид
Н
+
— ион(ы) водорода, протоны
Нb —
гемоглобин
НbСО — карбоксигемоглобин
НbО
2
—
гемоглобин
оксигенированный
[К
+
]
— концентрация ионов калия
LT —
лейкотриены
MetHb — метгемоглобин
Na
+
—
катион(ы)
натрия
[Na
+
]
— концентрация ионов натрия
NAD —
никотинамидаденин
динуклеотид
NADP — никотинамидадениндинуклео-
тидфосфат
NO
— оксид азота, вырабатываемый
в эндотелии фактор релакса-
ции (вазодилатации)
НТФ —
нуклеозидтрифосфаты
р
а
СО
2
—
парциальное
напряжение
двуокиси углерода
в артериальной крови
рСО
2
—
парциальное
давление
двуокиси углерода
PG —
prostaglandins,
простагландины
Pi —
фосфат
неорганический
(H
3
PO
4
)
рО
2
—
парциальное
давление
кислорода
PPi —
пирофосфат неорганический
(H
4
P
2
O
7
)
SAG —
S-аденозилгомоцистеин
SAM —
S-аденозилметионин
2,3-БФГ — 2,3-бисфосфоглицерат
АД —
артериальное
давление
АДГ —
антидиуретический
гормон
(вазопрессин)
АДФ —
аденозиндифосфорная
кислота, аденозиндифосфат
АКТГ —
адренокортикотропный
гормон
АЛТ —
аланинаминотрансфераза
АМФ —
аденозинмонофосфат
апоЛП — аполипопротеин
АПФ —
ангиотензинпревращающий
фермент
ACT —
аспартатаминотрансфераза
AT —
антитело,
антитела
АТФ —
аденозинтрифосфорная
кислота
АТФаза — аденозинтрифосфатаза
АХАТ —
ацетил-КоА-холестерол-ацил-
трансфераза
АХЭ —
ацетилхолинэстераза
АЦ —
аденилатциклаза
БИФ —
бифункциональный
фермент
ВЖК
— высшие жирные кислоты
ГАМК —
J
-аминомасляная кислота
ГГФРТ — гипоксантингуанинфосфо-
рибозилтрансфераза
ГДФ —
гуанозиндифосфат
ГЛЮТ — глюкозные
транспортеры
ГМФ —
гуанозинмонофосфат
10
Список сокращений
ГТ —
глутатионтрансфераза
ГТФ —
гуанозинтрифосфат
Д
— дальтон (после числового
значения)
ДАГ —
диацилглицеролы
ДАФ —
дигидроксиацетонфосфат
ДНК —
дезоксирибонуклеиновая
кислота
дНТФ — дезоксинуклеозидтрифосфат
ДОФА — дигидроксифенилаланин
дТМФ — дезокситимидинмонофосфат
ДФФ —
диизопропилфторфосфат
ЖКТ —
желудочно-кишечный
тракт
ИЛ —
интерлейкин,
интерлейкины
ИМФ —
инозинмонофосфат
ИФ-3 —
инозитолтрифосфат
ИФН —
интерферон,
интерфероны
КАТ —
карнитинацилтрансфераза
кД —
килодальтон
КК —
креатинкиназа
КоА
— кофермент (коэнзим) А
KoQ
— кофермент (коэнзим) Q
КФС II — карбамоилфосфатсинтетаза II
ЛДГ —
лактатдегидрогеназа
ЛП —
липопротеин
ЛПВП — липопротеины
высокой
плотности
ЛПНП — липопротеины
низкой
плотности
ЛПОНП — липопротеины очень низкой
плотности
ЛППП — липопротеины
промежуточной плотности
ЛХАТ —
лецитинхолестеролацил-
трансфераза
МАГ —
моноацилглицеролы
МАО —
моноаминоксидаза
мРНК — матричная
РНК
мяРНП — малые
ядерные
рибонуклеопротеины
НДФ —
нуклеозиддифосфат
НК —
нуклеиновая
кислота
НМФ —
нуклеозидмонофосфат
ОПК
— общий путь катаболизма
ПДК —
пируватдегидрогеназный
комплекс
ПКА —
протеинкиназа
А
ПКС —
протеинкиназа
С
ПНФ —
предсердный
натрийуретиче-
ский фактор
ПОЛ —
перекисное
окисление
липидов
ПТГ —
паратиреоидный
гормон
ПФ —
пиридоксальфосфат
ПЦР
— полимеразная цепная реакция
ПЯЛ —
полиморфно-ядерные
лейкоциты
РААС —
ренин-ангиотензин-альдосте-
роновая система
РНК —
рибонуклеиновая
кислота
рРНК —
рибосомная
РНК
РНР —
рибонуклеотидредуктаза
РЭС —
ретикулоэндотелиальная
система
СТГ —
соматотропный
гормон
ТАГ —
триацилглицеролы
ТГ —
тиреоглобулин
ТГФК — тетрагидрофолат
ТДФ —
тиаминдифосфат
тРНК —
транспортная
РНК
ТТГ —
тиреотропный
гормон
УДФ —
уридиндифосфат
УМФ —
уридинмонофосфат
УТФ —
уридинтрифосфат
УФО —
ультрафиолетовое
облучение
ФАФС — 3-фосфоаденозин-5-
фосфосульфат
ФКУ —
фенилкетонурия
ФРДФ — фосфорибозилдифосфат
ХМ —
хиломикроны
Хc —
холестерол
цАМФ — циклический
аденозин-3’,
5’-монофосфат
ЦДФ —
цитидиндифосфат
ЦМФ —
цитидинмонофосфат
ЦНС
— центральная нервная система
ЦПЭ
— цепь переноса электронов
ЦТК
— цикл трикарбоновых кислот,
цикл Кребса
ЦТФ —
цитидинтрифосфат
ЭР —
эндоплазматический
ретикулум
ЭХc —
эфиры
холестерола
1
Белки. Структура
и функции
Цели изучения.
Знать и уметь объяснять:
x
уровни структурной организации белков, роль конформации белков в фор-
мирования активного центра и функционирования белков;
x
причины развития наследственных и приобретенных протеинопатий;
x
влияние экзогенных лигандов (токсинов, ядов) на активность белков, ме-
ханизмы лечебного действия некоторых лекарств;
x
особенности строения олигомерных белков и механизмы адаптивной ре-
гуляции их функций;
x
причины и следствия денатурации белков, применение денатурирующих
агентов как антисептиков в медицине и фармации.
Белки или протеины количественно преобладают над всеми другими макро-
молекулами живой клетки. Белки участвуют во всех биологических процессах,
выполняя разнообразные
функции
. По характеру выполняемых функций белки
можно разделить на следующие группы:
x
ферменты;
x
рецепторные
белки;
x
регуляторные
белки;
x
структурные
белки;
x
транспортные
белки;
x
защитные
белки;
x
сократительные
белки.
Каждый белок имеет уникальную, свойственную лишь ему структуру, и в та-
кой же мере уникальную функцию, отличающуюся от функций других белков.
1.1. Структура белка
Белки
— это высокомолекулярные соединения (полимеры), состоящие из
D
-аминокислот — мономерных звеньев, соединенных между собой пептидными
12
Биологическая химия
Таблица 1.1
Свойства радикалов аминокислот
Название
аминокислоты
Строение
R-группы
Название
аминокислоты
Строение
R-группы
1. НЕПОЛЯРНЫЕ (гидрофобные) R-группы.
В группе R есть неполярные связи С-С, С-Н
Глицин
Gly, G
–H
Метионин Met, M
–CH
2
–CH
2
–S –CH
3
Аланин
Ala, A
–CH
3
Фенилаланин
Phe, P
Валин
Val, V
СН
3
–CH
СН
3
Триптофан
Trp, W
Лейцин
Leu, L
СН
3
–CH
2
–CH
2
СН
3
Пролин
Pro, P
Изолейцин
Ile, I
СН
3
–CH
СН
2
— CH
3
CH
2
N
H
CH
2
N
H
COOH
D
NH
3
+
— CH — COO
–
_
R
Рис. 1.1.
Общая структура аминокислот. R — боковая цепь
связями. Все 20 аминокислот, встречающихся в белках, — это
D
-аминокислоты,
общим признаком которых является наличие аминогруппы NН
2
и карбоксиль-
ной группы СООН у
D
-углеродного атома. Исключением является пролин,
который содержит в
D
-положении группу NH и называется иминокислотой.
D
-Аминокислоты
отличаются друг от друга структурой боковой цепи — радика-
ла (R) — и, следовательно, свойствами. Все аминокислоты можно разделить на
группы на основе полярности боковых цепей, т.е. способности взаимодейство-
вать с водой при биологических значениях рН (рис. 1.1 и табл. 1.1).
Пептидные связи
образуются при взаимодействии
D
-карбоксильной груп-
пы одной аминокислоты и
D
-аминогруппы от последующей аминокислоты
(рис. 1.2). Пептидная связь — это амидная ковалентная связь, соединяющая
13
Раздел 1.
Белки. Структура и функции
Название
аминокислоты
Строение
R-группы
Название
аминокислоты
Строение
R-группы
2. ПОЛЯРНЫЕ (гидрофильные) R-группы.
В группе R есть полярные связи С-О, С-N, O-H, S-H
а) полярные незаряженные
R-группы
б) полярные отрицательно заряженные
R-группы
Серин
Ser, S
–CH
2
–OH
Аспарагиновая
кислота
Asp, D
–CH
2
–COO-
Треонин
Thr, T
–CH –CH
3
|
OH
Глутаминовая
кислота
Clu, E
–CH
2
–CH
2
–COO-
Цистеин
Cys, C
–CH
2
–SH
в) полярные положительно заряженные
R-группы
Тирозин
Tyr
–CH
2
— –OH
Лизин
Lys, K
–CH
2
–CH
2
–CH
2
–CH
2
–NH
3
+
Аспарагин
Asn, N
–CH
2
–CONH
2
Аргинин
Arg, R
–CH
2
–CH
2
–CH
2
–NH–C–NH
2
| |
NH
3
+
Глутамин
Gln, Q
–CH
2
–CH
2
–
CONH
2
Гистидин
His, H
HN
NH
+
CH
2
Рис. 1.2.
Образование пептидной связи
H
2
N CH COOH
R
1
H
2
N CH COOH
R
2
H
2
N CH CO
R
1
HN CH COOH
R
2
- H
2
O
+
аминокислоты в полипептидную цепочку. Следовательно, пептиды — это ли-
нейные полимеры из аминокислот. В полипептидной цепи различают:
N-конец
,
образованный свободной
D
-аминогруппой, и
С-конец
, имеющий свободную
D
-карбоксильную группу (рис. 1.3, 1.4).
Последовательность аминокислот в цепи изображают начиная с N-концевой
аминокислоты. С нее же начинается нумерация аминокислотных остатков.
В полипептидной цепи многократно повторяется последовательность:
–NH–CH–CO–.
14
Биологическая химия
+
H
3
N
C
C
N
C
C
N
C
C
N
C
C
N
C
C
N
C
C
N
C
COO
-
H
H
H
H
H
H
O
O
O
O
O
O
CH
2
COO
-
CH
2
CH
2
COO
-
CH
2
CH
2
CH
2
CH
2
NH
3
+
CH
2
CH
2
CH
2
NH
C
H
2
N
NH
2
+
CH
3
CH
2
HN
NH
H
H
H
H
H
H
H
H
+
NH
CH
C
N
CH
CO
H
2
C
CH
2
CH
2
O
R
Do'stlaringiz bilan baham: |
