Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Yangi nuklein kislota identifikatori (NI) liniyasi
Har bir nuklein kislotalar ketma-ketligi uchun identifikatorni o'z ichiga olgan yangi NI turi kiritildi. Ketma-ketlik bir xil bo'lsa-da, bu identifikatorning qiymati ham shunday bo'ladi. Ketma-ketlik o'zgarishi sodir bo'lganda, kichik bo'lsa ham, yangi NI qiymati tayinlanadi, AC liniyasidagi ulanish raqami o'zgarishsiz qolishi mumkin.
Yangi protein identifikatori (PID)
CDS xususiyatidan "PID" (oqsil identifikatori) ma'lumotlar bazasiga o'zaro havolada ushbu kodlash ketma-ketligining tarjima qilingan mahsuloti uchun identifikator mavjud. Ushbu identifikator ketma-ketlikdagi o'zgarishlarga qaramay, tarjima o'zgarmas ekan, o'zgarishsiz qoladi. Shuning uchun u tashqi ma'lumotlar bazalari (masalan, SWISS-PROT) tomonidan o'zaro havolalar tuzilishi mumkin bo'lgan identifikator sifatida ishlatilishi mumkin.
Ma'lumotlar bazasini qayta loyihalash
So'nggi oylarda ma'lumotlar bazasini qayta loyihalash yakunlandi. Takomillashtirilgan ma'lumotlar bazasi sxemasiga va Unix operatsion tizimiga o'tish natijasida ma'lumotlar bazasi o'sib borayotgan ma'lumotlar hajmiga, ayniqsa loyihalarni ketma-ketlashtirishga dosh berishga imkon beradigan yaxshilandi.

• 
  Tuzilgan ketma-ketliklar toʻliq genomlar kabi uzun ketma-ketliklarni ifodalash usulidir. Yangi CON boʻlimi uning tarkibiy qismlaridan konstruksiya ketma-ketliklari qanday qurilgani haqidagi maʼlumotlarni oʻz ichiga olgan yozuvlarni oʻz ichiga oladi. Yangi sxema ushbu turdagi ketma-ketliklarni to'liq qo'llab-quvvatlaydi.
  
• 
  Dastlabki ketma-ketlik guruhi tomonidan taqdim etilmagan ma'lumotlar bazasi yozuvlariga izohlar uchinchi tomon izohlari deb ataladi. Garchi ko'rsatmalar hali ham xalqaro hamkorlik tomonidan belgilanishi kerak bo'lsa-da, yangi sxema ushbu turdagi izohlarni qo'llab-quvvatlash uchun ishlab chiqilgan.
  
• 
  SQL*Forms 4.5 da grafik izohlash vositalari yaratildi, bu esa izohlash jarayonida qo'shimcha avtomatlashtirish va yaxshilangan aniqlikni tekshirish imkonini beradi.
  
• 
  SWISS-PROT va TRGENBANK aloqalarini boshqarish takomillashtirilgan versiyalarni kuzatish, yangilash mexanizmlari va GENBANK nukleotidlari va oqsil ma'lumotlar bazalari o'rtasidagi sinxronizatsiyani taklif qiladi.
  

GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasidan iqtibos qilish uchun afzal ko'rilgan shakl: Stoesser G., Moseley MA, Sleep J., McGowran M., Garcia-Pastor M. and Sterk P. (1998) The GENBANK Nukleotid Sequence Database. Nuklein kislotalar Res ., 26 , 8-15.