Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

1-jadval. EBI tomonidan tarqatiladigan GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi ma'lumotlar bazasining har kuni yangilanadigan nusxalarini saqlaydigan saytlar


EBI tarmoq xizmatlari
EBI kompyuter tarmoqlari texnologiyalarining jadal rivojlanishidan to'liq foydalanadigan tarmoq xizmatlarini rivojlantirishga bag'ishlangan. EBI ma'lumotlar bazalari va dasturiy ta'minot arxivlariga World Wide Web, elektron pochta fayl serveri va FTP orqali kirish mumkin, molekulyar biologiya axborot resurslarining keng doirasiga eng ilg'or tarmoq kirishini ta'minlaydi. Tarmoqli ma'lumotlar bazalaridan yangi va yangilangan yozuvlar har kuni tarmoq serverlariga qo'shiladi, bu FastA, Blast, Blitz va Bioccelerator yordamida yozuvlarni olish va eng so'nggi nukleotid ma'lumotlarida ketma-ketlik o'xshashligini qidirishni amalga oshirish imkonini beradi.
EBI WWW serveri . EBI WWW serveridan qator xizmatlar, jumladan, ketma-ketlikni tahlil qilishning maxsus interaktiv vositalari mavjud. Tegishli URL manzillar: http://www.ebi.ac.uk/services/services.html va http://www.ebi.ac.uk/searches/searches.html
EBI tarmoq fayl serveri. EBI tarmoq fayl serveri elektron pochta orqali ma'lumotlar bazalarining to'liq to'plamiga, jamoat mulki dasturiy ta'minotiga va EBI tomonidan yuritiladigan hujjatlarga kirish imkonini beradi. Elementlar serverdan fayl server manziliga elektron pochta xabarida buyruq yuborish orqali olinadi. Fayl-serverdan foydalanish bo'yicha batafsil ko'rsatmalar va joriy ro'yxatni Internet-manzilga [e-mail] manziliga xabar matnida HELP so'zi bilan xabar yuborish orqali olish mumkin. Ko'rsatmalarning to'liq to'plami avtomatik ravishda qaytariladi.
EBI FTP serveri . EBI anonim fayl uzatish protokoli (FTP) serveri EBI molekulyar biologiya arxivlari kataloglari boʻylab navigatsiya qilish va fayllarni qidirish imkonini beradi. Ko'pgina kataloglarda yo'nalishni aniqlashda yordam beradigan "README" fayllari mavjud. Foydalanuvchilar ftp.ebi.ac.uk manzili bo'yicha anonim FTP serveriga "anonim" foydalanuvchi nomi va parol sifatida elektron pochta manzilidan foydalanishlari kerak.
50 dan ortiq qo'shimcha molekulyar biologiya ma'lumotlar bazasi to'plami ham mavjud. Ushbu ma'lumotlar bazalari Evropa va butun dunyo bo'ylab boshqa guruhlar tomonidan ishlab chiqariladi, ularning aksariyati Evropa bioinformatika instituti bilan hamkorlikda. Bir misol, immun tizimining funktsiyasida muhim bo'lgan genlarning nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlarini o'z ichiga olgan ma'lumotlar bazasi ImmunoGenetics ma'lumotlar bazasi IMGT.