Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Patent adabiyotidan ketma-ketliklar
Patent Backfile loyihasi . GENBANK maʼlumotlar bazasi Yevropa Patent idorasi bilan davom etayotgan hamkorlikda ketma-ketlik maʼlumotlarini ajratib olish va ularni ommaviy ketma-ketlik maʼlumotlar bazalariga kiritish uchun Yevropa patent hujjatlarining “orqa faylini” qayta ishlamoqda. AQSh, NCBI va Yaponiyada DDBJ Amerika va Yaponiya patent adabiyotlari bilan shug'ullanadi. EPO/GENBANK Backfile loyihasi 1960 yildan 1993 yilgacha bo'lgan patent hujjatlarini o'z ichiga olgan va 25 000 dan ortiq protein va nukleotidlar ketma-ketligini tiklash bilan yakunlangan.
Patent Frontfile loyihasi . Backfile loyihasi tugagandan so'ng, GENBANK ma'lumotlar bazasi hozirda 1993 yil sentyabridan boshlab EPO tomonidan elektron shaklda talab qilinadigan patent talabnomalaridan iborat Frontfile ma'lumotlarini kiritish bo'yicha EPO bilan hamkorlik qilmoqda. Dasturiy ta'minot va avtomatik protseduralar yaratilgan va hozirda foydalanilmoqda. so'nggi EPO patent arizalaridagi ketma-ketlik ma'lumotlarini qayta ishlash va birlashtirish. EPO siyosati patent berilgan yoki berilmaganligidan qat'iy nazar, patentga talabnoma berilgan kundan boshlab 18 oy o'tgach, ma'lumotlarni ommaga (va GENBANKga) chiqarishdan iborat. EPO tomonidan e'lon qilingandan so'ng, eng so'nggi patent ketma-ketligi ma'lumotlari GENBANK ma'lumotlar bazasiga integratsiya qilinadi va jamoatchilikka taqdim etiladi.
Yangi HTG bo'limi: Yuqori o'tkazuvchanlik
genomlari ketma-ketligi ma'lumotlar bazasi
Yuqori o'tkazuvchanlik genomlari ketma-ketligi (HTG) uchun yangi bo'lim yaratildi. Ushbu yangi bo'linma yuqori samarali sekvensiya loyihalari tomonidan ishlab chiqarilgan genomik ketma-ketliklar uchun ishlatiladi. Yozuvlar, birinchi navbatda, nematodlar va odamlardir va uzoq ketma-ketliklardan iborat. Ushbu yozuvlarning aksariyati uchun annotatsiya kompyuter tahlillari orqali yaratiladi. Ushbu bo'limdagi yozuvlarning barchasi ketma-ketlik holatini ko'rsatadigan kalit so'zlarni o'z ichiga oladi (masalan, HTGS_PHASE1).
Bitta qo'shilish raqami odatda bitta klonga beriladi va ketma-ketlik o'sib borishi va kirish bir fazadan ikkinchisiga o'tishi bilan u bir xil qo'shilish raqamini saqlab qoladi. Shuni ta'kidlash kerakki, bu ma'lumotlar tugallanmagan va to'g'ri ketma-ketlikni ifodalamaydi. Ketma-ketlik ustida ish olib borilmoqda va ushbu ma'lumotlarning chiqarilishi ish davom etar ekan, ketma-ketlik o'zgarishi mumkinligini tushunishga asoslanadi.