Kurs ishi mavzu: dnk va rnk nukleotidlar ketma-ketliklari ma`lumot bazalari

Ma'lumotlarni taqdim etish shakli
Elektron pochta ma'lumotlarini yuborish shakli ma'lumotlar bazasiga kirishni yaratish uchun zarur bo'lgan barcha ma'lumotlarni so'raydi. Ushbu shakl quyidagi manbalardan mavjud: (i) EBI fayl serveri orqali elektron pochta orqali ( [e-mail] ); (ii) EBI WWW-serveridan ( http://www.ebi.ac.uk/subs/allsubs.html ); (iii) GENBANK nukleotidlar ketma-ketligi ma'lumotlar bazasining barcha nashrlari bilan. Bundan tashqari, GENBANK ma'lumotlar bazasidan qog'oz topshirish shakli mavjud.
Ommaviy taqdimotlar
Biz bir vaqtning o'zida ko'p sonli o'xshash ketma-ketliklarni (masalan, >25) yuborishni rejalashtirayotgan mualliflarni ma'lumotlarni yuborishdan oldin ma'lumotlar bazasi bilan bog'lanishlarini tavsiya qilamiz. Keyinchalik ma'lumotlar bazasi xodimlari ushbu aniq ma'lumotlarni taqdim etishni imkon qadar qulay qilishda yordam beradi, shu bilan muallifga ko'plab topshirish tadbirlarini individual ravishda bajarish uchun zarur bo'lgan vaqt va kuchni tejaydi. Ma'lumotlar bazasi xodimlariga murojaat qilganda, mualliflar topshirishni rejalashtirgan ketma-ketliklar sonini ko'rsatishi va ketma-ketliklardan biri uchun to'ldirilgan ariza shaklini taqdim etishi kerak. Ushbu ma'lumotlarga asoslanib, ma'lumotlar bazasi xodimlari bir qator shablonlarni yaratadilar va ularni har bir ketma-ketlikda talab qilinadigan yagona ma'lumot bilan yakunlash uchun muallifga etkazadilar. Qayta topshirilgandan so‘ng ushbu andozalar ma’lumotlar bazasi kuratorlari tomonidan ommaviy qayta ishlanadi.
Xabarlarni yangilash
Taqdim etilgan ma'lumotlar bazasiga kirish yaratilgandan so'ng, uning nusxasi ma'lumotnoma va sharhlar yoki tuzatishlar uchun yuboruvchiga yuboriladi. Biroq, ko'pincha yozuv yaratilganda to'g'ri bo'ladi, lekin vaqt o'tishi bilan eskirib qoladi: mualliflar ketma-ketlikning o'ziga tuzatishlar kiritishlari yoki ketma-ketlikning yangi xususiyatlarini kashf qilishlari mumkin. Bunday topilmalar ko'pincha nashr etilmaganligi sababli, yozuvlarni to'g'ri va dolzarb saqlashning yagona yo'li - mualliflar o'zlarining yangi topilmalarini ma'lumotlar bazasiga etkazishlaridir. GENBANK ma'lumotlar bazasi yozuvlari bilan bog'liq yangilanish ma'lumotlari ma'lumotlar bazasiga WWW, elektron pochta yoki pochta yoki faks orqali yuborilishi mumkin: WWW: http://www.ebi.ac.uk/ebi_docs/update.html FTP: ftp.ebi.ac. uk faylida: pub/databases/genbank/release/update.docElektron pochta: [e-mail] so'roviga binoan
Bir oy ichida GENBANK ma'lumotlar bazasi ~1500 ta yangilanish xabarlarini oladi, ulardan ~900 tasi iqtiboslar yangilanishidir. Foydalanuvchilar ma'lumotlar bazasida topilgan har qanday xatolar haqida xabar berishlari mumkin, ammo shuni bilishlari kerakki, faqat asl yuboruvchi guruh ketma-ketlik yangilanishi va asosiy izoh o'zgarishlariga ruxsat berishi mumkin. 
Ko'pgina taqdimotlar hali nashrga qabul qilinmagan ma'lumotlarni ifodalaydi va shuning uchun yozuv yaratilganda ma'lumotlar uchun to'liq jurnal iqtibos mavjud emas. Shuning uchun biz tadqiqotchilarni bizga taqdim etgan ma'lumotlar qachon va qayerda e'lon qilinganligi to'g'risida ma'lumot berishni va bunday nashrlarga tegishli kirish raqamlarini kiritishni so'raymiz. Bibliografik ma'lumotnomalarni yangilab turish va maxfiy ma'lumotlarni o'z vaqtida ommaga e'lon qilish uchun asosan mualliflar va foydalanuvchilarning hamkorligiga tayanamiz.

4-rasm. 1989-yildan 1997-yil sentabrgacha boʻlgan beshta yirik genom sekvensiyasi loyihasining jamlangan taraqqiyot syujeti. Faqat 1000 nukleotiddan uzunroq tugallangan genomik DNK ketma-ketliklari hisobga olindi.