I bob. Drug design-dori vositalari

2.2 Strukturaga asoslangan dori vositalarini loyihalash uchun odatiy klasterlash tahlilining oqim sxemasi
So'nggi skorlama funktsiyalari bilan hisoblangan bog'lanish yaqinligining etarli prognozini bartaraf etish uchun tahlil qilish uchun oqsil-ligand o'zaro ta'siri va birikma 3D tuzilishi ma'lumotlaridan foydalaniladi. Strukturaga asoslangan dori dizayni uchun, boyitishni yaxshilash va potentsial nomzodlarni samarali qazib olish uchun oqsil-ligand o'zaro ta'siriga qaratilgan bir nechta skriningdan keyingi tahlillar ishlab chiqilgan:
Konsensus balli 


Bir nechta ball funksiyalari bo'yicha ovoz berish orqali nomzodlarni tanlash


Protein-ligand tuzilmaviy ma'lumotlari va baholash mezoni o'rtasidagi munosabatni yo'qotishi mumkin


Klaster tahlili 


Protein-ligand 3D ma'lumotlariga ko'ra nomzodlarni ko'rsating va klaster qiling

• 
  

Protein-ligand o'zaro ta'sirini mazmunli ifodalash kerak.

Turlari 

Ligandga asoslangan (bilvosita) va tuzilishga asoslangan (to'g'ridan-to'g'ri) dori vositalarini loyihalash strategiyalarini ta'kidlaydigan dori-darmonlarni aniqlash sikli.
Dori vositalarini loyihalashning ikkita asosiy turi mavjud. Birinchisi ligandga asoslangan dori dizayni , ikkinchisi tuzilishga asoslangan dori dizayni deb ataladi .

Ligandga asoslangan 

Ligandga asoslangan dori dizayni (yoki bilvosita dori dizayni ) qiziqishning biologik maqsadi bilan bog'langan boshqa molekulalar haqidagi bilimga tayanadi. Ushbu boshqa molekulalar molekula maqsad bilan bog'lanishi uchun ega bo'lishi kerak bo'lgan minimal zarur strukturaviy xususiyatlarni belgilaydigan farmakofor modelini olish uchun ishlatilishi mumkin. [32] Boshqacha qilib aytganda, biologik nishon modeli unga bogʻlangan narsa haqidagi bilimga asoslangan holda tuzilishi mumkin va bu model oʻz navbatida maqsad bilan oʻzaro taʼsir qiluvchi yangi molekulyar obʼyektlarni loyihalash uchun ishlatilishi mumkin. Shu bilan bir qatorda, molekulalarning hisoblangan xususiyatlari va ularning eksperimental ravishda aniqlangan biologik faolligi o'rtasidagi bog'liqlik miqdoriy tuzilish-faollik munosabatlari (QSAR), kelib chiqishi mumkin. Ushbu QSAR munosabatlari o'z navbatida yangi analoglarning faolligini bashorat qilish uchun ishlatilishi mumkin.