«биоинформатикага муқаддима»

Функционал протеомика. Организмда қандайдир оқсилнинг мавжудлиги маълум 
вазифани бажара олиш қобилияти хақида фикр юритишга асос бўлади. Бутун протеом 
организмнинг тўлиқ хаѐт фаолиятини амалга ошириш учун хизмат қилади. Функционал 
протеомика протеомнинг функционал хоссаларини аниқлаш билан шуғулланади ва у ҳал 
қиладиган вазифалар оқсил структурани аниқлашга нисбатан анча мураккабдир. 
Протеомнинг бирор вазифани амалга ошириши мухитда қанд, липид, 
простогландинлар, турли ионлар ва бошқа қўшимча моддаларнинг бўлишини талаб этади. 
Оқсил молекулалари атрофдаги ва бошқа моддалар билан таъсирлашиб, аввал молекуляр 
сўнгра макромолекуляр даражада функционал реакцияларнинг амалга ошишига олиб 
келади. Улар қаторига ферментни субстрат билан, антителони антиген билан, 
пептидларни рецептор, токсинларни ион каналлари билан ўзор таъсирини келтириш 
мумкин. Бу каби жараѐнлар механизмини аниқлашда индивидуал участкаларнинг 
экспериментал тажрибаларидан ташқари, биоинформацион воситалар ѐрдамида тизимли 
ѐндашувлардан ҳам фойдаланилади.
Қуйидаги расмда инсон пептидомаси вакиллари – ошқозон–ичак йўлида 
локализацияланган 
турли 
гастринлар 
ва 
холецистокининлар 
кўрсатилган 
(аминокислоталарни ифодалашда стандарт бир харфли коддан фойдаланилган). 

---

Инсондаги пептидома вакиллари бирламчи структурасини булутларнинг битта пептид билан 
таққосланиши 
Ўзоро жуда ўхшаш бўлган ўнг сохалар бу пептид молекулаларининг функционал 
қисмлари ҳисобланади. Аммо оқсиллар тўғри ва тескари хоссаларга эга бўлади: 
гастринлар организмда очлик ҳиссини пайдо қилса, холецистокининлар фаолияти 
туфайли тўқлик ҳисси пайдо бўлади. Холецистокининларнинг бирламчи кетма –
кетликларида тирозин Y қолдиғининг холати гастринларга нисбатан бир қадамга 
силжиган. Қуйидаги расмда содда хордалилар вакилларидан Siona intestinalisдан олинган 
сионин пептидининг бирламчи структураси келтирилган. Униннг структураси гастрин ва 
холисцистокинин билан гомологик бўлиб, бу иккала кўрсатилган пептидлардаги каби 
холатда жойлашувчи иккита тирозин қолдиғИ билан тавсифланади. Лекин функсионал 
ҳусусиятлари хали тўлиқ ўрганилмаган. Тўғри ташкил этилган тажриба ѐрдамида бутун 
кимѐвий структура ва тирозин қолдиғининг физиологик эффектларни келиб чиқишидаги 
ўрни ҳақида тўҳталса бўлар эди.