«биоинформатикага муқаддима»

Фаннинг ишлаб чиқаришдаги ўрни: ―Биоинформатикага муқаддима‖ фанининг 
ишлаб чиқаришдаги асосий ўрнини тиббиѐт, фармацевтика соҳаси ва замонавий таҳлил 
лабораториялари ташкил этади. Тиббиѐтда бу фан ютуқларидан фойдаланган ҳолда 
генларни кўчириб ўтказишда, фармацевтикада янги дори воситаларини яратиш ва 
уларнинг организмдаги оқсиллар билан боғланиш механизмларини ўрганишда ва 
замонавий диагностик лабораторияларда фойдаланилади. 
Фойдаланилган адабиѐтлар: 
1. С.Игнасимуту «Основы биоинформатики». Москва 2007 
2. Аrthur M. Lesk «Introduction to Bioinformatics»/ Oksford University Press 2002. 
3. В.Д.Лахно «Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии». Москва 2002 
4. B. Alberts, A.Johnson, J.Lewis, M.Raff, K.Roberts, P.Walter. «Molecular biology of the 
cell». Fifth edition. USA. Nyu-York. 2008 
 
 
Асосий интернет сайтлари 
5. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/ 
6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/GenbankOverview.html 
7. http://www.ebi.ac.uk/embl/ 
8. http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php 
9. http://www.genome.ad.jp/kegg/ 
10. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene 
 

---

3-МАЪРУЗА 
Мавзу: Замонавий биоинформацион дастурлар.
 
Режа: 
1. Биологик кетма – кетликларни таққослаш асослари. Гомологик кетма - 
кетликлар.  
2. Биологик кетма – кетликларни локал таққосланиши. BLAST дастури. 
3. Биологик кетма – кетликларни кўплик таққосланиши. Clustal W, T-Coffee 
дастурлари. 
4. Генларнинг таққосланиши асосида турларнинг филогенетик яқинлигини 
аниқлаш. 

Мавзунинг долзарблиги: Маълумотлар базаларида сақланадиган маълумотларни 
қайта ишлаш учун яратилган замонавий дастурлар қаторига кенг қўлланиладиган BLAST, 
ClustalW, T-Coffee каби дастурлар кириб, улар ѐрдамида оқсилларнинг аминокислота 
кетма – кетлиги, ДНК ва РНК нинг нуклеотид кетма – кетликлари таҳлил қилинади. 
Таҳлил қилиш натижасида гомологик оқсилларни аниқланиши, вазифаси номаълум 
бўлган оқсилларнинг функционал фаоллигини тушунишга ѐрдам беради. Нуклеин 
кислоталар таркибидаги генлар, яъни оқсил кодловчи қисмларни аниқланиши келгусида у 
ѐки бу геннинг мутацияси натижасида келиб чиқувчи касалликларни даволаш имконини 
беради. Шунингдек, генлар ва геномларни таққослаш орқали турларнинг ўзаро қон – 
қариндошлигини аниқлаш мумкин. Шу асосида филогенетик дарахт тузилади. Бу эса 
биологиянинг энг муҳим вазифаларидан бўлган турларнинг келиб чиқиш муаммоларини 
ҳал этишга жуда катта ѐрдам беради.