3-amaliy mashg’ulot blast dasturi yordamida nukleotid ketma-ketlikni solishtirish. Blast dasturi vositasida aminokislotalar ketma-ketliklarini taqqoslash va translyantlarning olinishi
3-AMALIY MASHG’ULOT BLAST DASTURI YORDAMIDA NUKLEOTID KETMA-KETLIKNI SOLISHTIRISH. BLAST DASTURI VOSITASIDA AMINOKISLOTALAR KETMA-KETLIKLARINI TAQQOSLASH VA TRANSLYANTLARNING OLINISHI
DNK-dan o'qish ramkalarini qidirish 3.1. DNK ketma-ketligini hisobga olgan holda:
Berilgan ketma-ketlik biron bir oqsilni kodlashini aniqlash uchun talab qilinadi. Proteinning aminokislotalar ketma-ketligi to'g'risidagi ma'lumotlarni o'z ichiga olgan DNK ketma-ketligining bir qismi bu "Ochiq o'qish doirasi" (ORF) “Open Reading Frame”.
NCBI ORF Finder o'qish doirasini qidirish xizmatini oching:
www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder
Xizmat ko'rsatish interfeysini tahlil qiling, guruh bilan belgilangan parametrlarning ma'nosini muhokama qiling.
3.2. Ushbu tartibda standart sozlamalar bilan o'qish freymlarini qidiring.
Qidiruv natijalari sahifasini ko'rib chiqing. Sahifaning yuqori qismida topilgan ORFlar proektsiyalanadigan ketma-ketlikning allaqachon ma'lum bo'lgan "chizig'i" mavjud. Quyida topilgan ORFlar va ularning