Биополимерларнинг аффин модификацияси
Биополимерлар (био… ва полимерлар) — барча тирик организмларнинг ҳаёт фаолиятида муҳим роль ўйнайдиган юқори молекулали табиий бирикмалар. Нуклеин кислоталар, оқсиллар ва полисахаридларпк ўз ичига олади. Булардан ташқари, аралаш Биополимерлар ҳам бўлиб, уларга нуклеопротеид, гликопротеид, липопротеид, гликолипид, липосахарид ва б. киради. Асосий Биополимерлардан нуклеин кислоталар ҳужайраларда генетик функцияни бажаради. Оқсиллар ҳужайраларнинг энг зарур таркибий қисми бўлиб, бир қатор муҳим функцияларни ўтайди. Оқсилферментлар ҳужайраларда рўй бераётган моддалар алмашинувида кимёвий реакцияларни тартиб билан ва зарур тезликда олиб боради. Мускул оқсиллари, микроб хивчинлари ва ҳужайра ворсинкалари қисқариб, кимёвий энергияни механик ишга айлантиради. Шунинг ҳисобига организмлар ҳаракатланади. Қон оқсиллари кислород (гемоглобин) нн ташиб, организмни ёт оқсиллар (углобулинлар)дан ҳимоя қилади ва қон ивишида иштирок этади. Полисахаридлар тўқималар тузилишида иштирок этиб, резерв Биополимерлар функциясини бажаради. Биополимерларнинг тузилиши—молекулаларнинг узок, вақт давом этган эволюцияси натижасидир, шунинг учун улар биологик вазифасини тўла бажаришга мослашган.
Оксил фолдинги
Biokimyo va molekulyar biologiyada oqsil holdingi (oqsil burma, inglizcha katlama) - bu polipeptid zanjirining o'z-o'zidan noyob mahalliy (tabiiy, ingliz tilidan) fazoviy tuzilishga (uchlamchi tuzilish deb ataladigan) o'z-o'zidan katlanma jarayoni. Polipeptidning birlamchi tuzilishining (chapda) uchinchi tuzilishga o'tishi (o'ngda)
Har bir oqsil molekulasi mRNK ketma-ketligidan aminokislotalarning chiziqli zanjiri sifatida tarjima qilingan polipeptid sifatida shakllana boshlaydi. Polipeptid barqaror uch o'lchovli tuzilishga ega emas (rasmning chap tomonidagi misol). Shu bilan birga, zanjirdagi barcha aminokislotalar ma'lum kimyoviy xususiyatlarga ega: hidrofobiklik, gidrofillik, elektr zaryadi. Aminokislotalar bir-biri bilan va hujayra muhiti bilan o'zaro ta'sirlashganda, aniq belgilangan uch o'lchovli struktura olinadi - konformatsiya. Natijada, oqsil globulasining tashqi yuzasida faol markazlarning bo'shliqlari, shuningdek, multimerik oqsillar bo'linmalarining bir-biri bilan va biologik membranalar bilan aloqa nuqtalari hosil bo'ladi.
Kamdan kam hollarda ikkita protein konformatsiyasi (konformerlar deb ataladigan) bir vaqtning o'zida mahalliy bo'lishi mumkin. Ular juda katta farq qilishi va hatto turli funktsiyalarni bajarishi mumkin. Buning uchun oqsil molekulasining faza fazosining turli mintaqalarida energiya jihatidan taxminan teng bo'lgan ikkita holat mavjud bo'lishi kerak, ularning har biri tegishli ehtimollik bilan o'zining tabiiy shaklida sodir bo'ladi.
Uchinchi darajali tuzilmani barqarorlashtirish uchun hujayradagi ko'plab oqsillar translatsiyadan keyingi modifikatsiyadan o'tadi. Ko'pincha polipeptid zanjirining fazoviy jihatdan yaqin bo'limlari o'rtasida disulfid ko'priklar mavjud.To'g'ri uch o'lchovli struktura oqsillarning to'g'ri ishlashi uchun juda muhimdir. Katlama xatolar odatda turli xil xususiyatlarga ega bo'lgan faol proteinga olib keladi. Ba'zi kasalliklar hujayralardagi noto'g'ri qatlamlangan oqsillarning to'planishidan kelib chiqadi, deb ishoniladi (batafsilroq, Prions maqolasiga qarang) [1].
Katlama chaperon oqsillarini o'z ichiga oladi. Va ko'pchilik yangi sintezlangan oqsillar chaperonlar yo'qligida katlansa ham, ma'lum bir ozchilik ularning mavjudligini talab qiladi.
Proteinlarni katlama mexanizmi to'liq tushunilmagan. Proteinning uch o'lchovli tuzilishini eksperimental aniqlash ko'pincha juda qiyin va qimmat. Biroq, oqsilning aminokislotalar ketma-ketligi odatda ma'lum. Shuning uchun olimlar oqsilning fazoviy tuzilishini aminokislotalar ketma-ketligidan bashorat qilish uchun turli xil biofizik usullardan foydalanishga harakat qilmoqdalar .
Do'stlaringiz bilan baham: |