Zamonaviy bioinformatsion ma’lumot bazalari haqidagi ma’lumotlar bilan tanishish. Biblografik ma’lumot bazalari. Matnli ma’lumotlarni olish instrumentlari. Kerakli jihozlar

Nazorat savollari

1. 
   Qanday zamonaviy bioinformatsion ma’lumot bazalari mavjud?
   
2. 
   NCBI nima?
   
3. 
   Axbarot tushunchasiga ta’rif bering
   

2- Laboratoriya mashg’ulot. Biologik makromolekulalarning birlamchi strukturasi (matn ko’rinishidagi) haqidagi ma’lumotlarni saqlovchi ma’lumot bazalari bilan Ishlash
Kerakli jihozlar: internetga ulangan kompyuter, prezentatsiya, tarqatma material
Bioinformatikaning asosiy vazifalaridan biri to'plangan biologik ma'lumotlarga kirishni saqlash va tashkil etishdir. Ma'lumotlar bazasi texnologiyalari (MB) yordamida ushbu vazifani amalga oshiring. Ma'lumotlar bazalari - bu ob'ektlar va ularning xususiyatlari to'g'risidagi ma'lumotlarni o'z ichiga olgan ma'lumot modellari. Ular bir xil xususiyatlar to'plamiga ega ob'ektlar guruhlari to'g'risidagi ma'lumotlarni saqlaydi. Har qanday kundalik ma'lumotnomalar, entsiklopediyalar, daftarlar va kataloglar ma'lumotlar bazasining oddiy kundalik misollari sifatida qaralishi mumkin. Ma'lumotlar bazalarida ma'lumotlar tartibda saqlanadi, bu esa saqlanadigan ma'lumotlarning kerakli qismlariga qulay kirish imkonini beradi Texnik jihatdan ma'lumotlar bazasini jadvallar to'plami sifatida ko'rsatish mumkin, ularning har biri bir xil turdagi ob'ektlar to'g'risidagi ma'lumotlarni saqlash uchun mo'ljallangan. Jadvalning har bir qatorida bitta ob'ektning ma'lumotlari mavjud va yozuvlar deb nomlanadi. Bunday holda, qatorni tashkil etadigan ustunlar maydonlar deb ataladi va har bir maydon ob'ektning o'ziga xos xususiyatini tavsiflaydi. Ma'lumotlar bazasidagi har bir yozuvda noyob identifikatsiya qilish imkoniyati bo'lishi kerak, bunday ma'lumotni saqlash uchun ko'pincha alohida yozuv turi ajratiladi va bu nom kalit deb ataladi. Shuni ham ta'kidlash kerakki, qiymat sifatida bir xil yoki boshqa turdagi ob'ektga havolani o'z ichiga olgan maydonlar mavjud bo'lishi mumkin, bu esa ma'lumotlar bazasida mavjud bo'lgan ob'ektlarning ierarxik va tarmoq munosabatlari to'g'risida ma'lumotlarni saqlashga imkon beradi. Saqlanadigan ma'lumotlarning tabiati bo'yicha biologik ma'lumotlar bazalarini quyidagilarga bo'lish mumkin:
• molekulyar biologik tadqiqotlar natijalarini saqlaydigan birlamchi ma'lumotlar bazalarida. Qoida tariqasida, biologik polimerlarning ketma-ketligi va tuzilishi (Genbank, EMBL, DDBJ, SWISS-PROT, TREMBL, PIR, PDB);
Ikkilamchi, birlamchi biologik ma'lumotlarni qayta ishlash natijasida. Oddiy misollar - bu ketma-ketlikda topilgan naqshlar, ketma-ketliklar va tuzilmalarning har xil tasnifi to'g'risidagi ma'lumotlarni saqlaydigan ma'lumotlar bazasi (PROSITE, Pfam, Blokirovka, PRINTS, DSSP, SCOP);
Murakkab (kompozit) ma'lumotlar bazalari. Ma'lumotlar bazasining ushbu turi dastlabki ikki turdagi ma'lumotlarni jamlaydi, bu ma'lumotlar bazalarida (NRDB, OWL, GO) qidiruv va navigatsiya imkoniyatlarini ta'minlaydi.