Учебно-методическое пособие для самостоятельной аудиторной и внеаудиторной подготовки

алифатические (аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, глицин),

ароматические (фенилаланин, тирозин, триптофан),

серосодержащие (цистеин, метионин),

гидроксипроизводные (содержат ОН-группу): серин, треонин, тирозин,

содержащие две СООН-группы, моноаминодикарбоновые: аспарагиновая и глутаминовая кислоты

содержащие две NH₂-группы, диаминомонокарбоновые: лизин, аргинин, гистидин,

амиды моноаминодикарбоновых кислот: глутамин, аспарагин.

5. По отношению их радикалов в воде. Приведенные в рис.2 аминокислоты можно выделить в группы по полярности их радикалов, что определяет для аминокислоты отношение к полярному растворителю - воде. Наиболее гидрофобными аминокислотами являются аминокислоты, имеющие разветвленные, громоздкие (занимающие в пространстве большой объем) радикалы, не имеющие функциональных групп с отрицательным, либо положительным зарядом. Если альфа-аминокислота содержит в боковом радикале полярные функциональные группы, она хорошо растворима в дистиллированной воде, либо в буферных растворах, имеющих значение рН среды близкое к рН=7.
- Аминокислоты с неполярными радикалами. К неполярным (гидрофобным) относят радикалы аминокислот, имеющие алифатические углеводородные цепи (радикалы аланина, валина, лейцина, изолейцина, пролина и метионина) и ароматические кольца (радикалы фенилаланина и триптофана). Распределение электронной плотности в таких радикалах не позволяет им вступать в электростатическое взаимодействие с молекулами воды, эти радикалы способны вступать в гидрофобные взаимодействия друг к другом. Такие эффекты в молекуле глобулярных белков обычно приводят к формированию гидрофобного ядра мицеллы, что имеет место при процессе формирования коллоидного раствора глобулярного белка.
- Аминокислоты с полярными незаряженными радикалами. Такие аминокислоты лучше растворяются в воде, так как в состав их молекул входят полярные функциональные группы, образующие водородные связи, либо электростатические взаимодействия с молекулами воды. К ним относят серин, треонин и тирозин, имеющие гидроксильные группы, аспарагин и глутамин, содержащие амидные группы, и цистеин с его тиольной (-SH; сульфгидрильной) группой.

• 
  
  

Рис. 2. Строение протеиногенных аминокислот; пролин является исключением – он циклическая иминокислота, а не альфа-аминокислота.

Цистеин и тирозин содержат соответственно тиольную и гидроксильную группы, способные к диссоциации в щелочных средах с образованием Н⁺, но при рН близких к 7,0, этого не происходит.