T. C. Jenkins biofizika kafedrasi, Jons Xopkins universiteti, 3400 N. Charlz St., Baltimor, md 21218 aqsh

Chaperonlar va RNK o'rtasidagi ko'p domenli o'zaro ta'sirlar
CspA singari, NCp7 ning ko'p nusxalari bitta RNKni bog'lab, uning tuzilishini beqarorlashtiradi (93, 94).
Nukleokapsid oqsillarining RNK chaperon faolligi asosan OIV nukleokapsidining (NCp7) keng
qamrovli tadqiqotlari natijasida tushuniladi, bu RNK tuzilmalarini buzishi va RNK zanjirlari orasidagi o'zaro
ta'sirni rag'batlantirishi mumkin (29). Ushbu chaperon xususiyatlari retrovirus hayot aylanishining ko'plab
bosqichlariga, jumladan, genomik RNKning dimerizatsiyasi va qadoqlanishi, tRNKni tayyorlash va trans
aktivatsiyasiga hissa qo'shadi (86, 87). Uzunroq gag poliproteinidan qayta ishlangan NCp7 RNK
tuzilmalarini bog'laydigan va beqarorlashtiruvchi ikkita kichik Zn barmoq domenini o'z ichiga oladi (88-91).
Har bir Zn barmog'ida juftlashtirilmagan guanozin nukleobazani bog'lashga qodir bo'lgan hidrofobik
cho'ntak mavjud. Tartibsiz, musbat zaryadlangan N-terminal domeni NCp7 ning yig'ish xususiyatlari bilan
bog'liq (92).
RNKni bog'laydigan boshqa oqsillar (83), bir ipli RNK uchun moslashuvchan, ammo energiya
jihatidan qulay o'zaro ta'sir yuzasini taklif qiladi. Muhimi shundaki, CspA ning ochiq yuzasida yon zanjirlar
dinamik (84), lekin RNK soch ipi (82) bilan bog'langanda barqarorlashadi. Shunday qilib, RNK asos
juftlarida harakatning kuchayishi oqsildagi harakatning kamayishi bilan birga keladi.
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
5-sahifa
Woodson va boshqalar.
Mikrobiol spektri
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Machine Translated by Google

---

S1 proteini uchun kamida uchtasi kerak
RNK-bog'lovchi attenuator oqsili (TRAP) ayniqsa dramatik
CspA, NCp7 va StpA kabi kichik chaperon oqsillari bir vaqtning o'zida oqsilning ko'plab nusxalariga
ega bo'lish orqali RNKni qayta tuzadilar, bu oqsillar nima uchun o'rtacha yuqori protein: RNK
nisbatlarida eng samarali ekanligini tushuntiradi (59, 75, 91) . Har bir polipeptid, shuningdek, RNKni
ochish yoki tavlash uchun birgalikda ishlashi kerak bo'lgan bir nechta RNK bog'lovchi domenlarga
ega (68). Masalan, OIV NCp7 ning chaperon faolligi har bir Zn barmog'i va asosiy N-terminal
mintaqasining (88-90, 97, 100) birgalikda harakatini talab qiladi. Ribosomal protein S1 ham RNK
spirallarini bo'shatish uchun yaxshi tavsiflangan moyillikka ega (23-25). 30S ribosomadagi oltita
oligonükleotid bog'lash (OB) domenlaridan tuzilgan mRNKlarni joylashtirish uchun (101) mRNKni
ochish uchun bir nechta OB domenlari birgalikda ishlashi kerakligini ko'rsatadi. Ushbu g'oyaga mos
keladigan optik cÿmbÿz tajribalari shuni ko'rsatdiki, har bir S1 oqsili bir vaqtning o'zida butun spiralni
ochish uchun zarur bo'lgandan kamroq energiya talab qiladigan 10 ta asosiy juftlikni ko'p bosqichli
tarzda yechib tashlaydi (102).
Hfq hujayradagi boshqa RNKlarni e'tiborsiz qoldirib, RNK substratlarining keng oilasini (122) tanib
olish uchun RNKni bog'lovchi yuzalar va tartibsiz domenlar aralashmasidan foydalanadi. "Proksimal" yuz
Chaperon faolligi bo'lgan eukaryotik oqsillar odatda moslashuvchan bog'lovchilar bilan birlashtirilgan
bir nechta RNK bog'lash domenlarini o'z ichiga oladi. Ushbu "marvarid marjon" tashkiloti RNK ketma-
ketlik motivlarini (103) aniqroq aniqlash imkonini beradi va RNKdagi konformatsion o'zgarishlarni o'z
ichiga oladi. Masalan, Prp24 xamirturushi U6 va U4 snRNK o'rtasidagi tavlanishni osonlashtiradi, bu
spliceosomal komplekslarni qayta ishlash uchun muhim qadamdir (104). Prp24 ning to'rtta RNKni
aniqlash motivi (RRM) domenlari spliceosomal U6 snRNKni o'rab, RNKning ikki va bir ipli hududlari
bilan keng aloqalarni o'rnatadi (105). Ushbu domenlarni qayta yo'naltirish, ehtimol, U6 tayanch juftlarini
qayta qurishga ruxsat berish uchun kerak (106). Xamirturush La oqsili pol III transkriptlarining 3' uchlarini
(107, 108) va chaperonlar noto'g'ri katlanmÿÿ pre-tRNKlarni (109) va boshqa kichik yadro RNKlarini
(110) bog'laydi. La RNK 3' uchini bog'laganda, La motivi va RRM domeni o'rtasida moslashuvchan
bog'lovchi tartiblanadi, bu ikki domenni yo'naltiradi va substrat tanlashning aniqligini sezilarli darajada
oshiradi (111).
Bacillus subtilis trp
masalan, 33 nt gacha RNK ni katta 11 subbirlikli g'ildirak (113) atrofida o'rash. Kichikroq misol - Ro
antijeni, u eukaryotik Y qutisi kichik RNKlarni bog'lash va ularga chaperon qilish uchun HEAT
takrorlash halqasidan foydalanadi (31). (S.Volinning bobiga ham qarang).