T. C. Jenkins biofizika kafedrasi, Jons Xopkins universiteti, 3400 N. Charlz St., Baltimor, md 21218 aqsh

Vaqtinchalik o'zaro ta'sirlar iterativ chaperon davrlarini boshqaradi
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Mikrobiol spektri
3-sahifa
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Woodson va boshqalar.
Machine Translated by Google

---

Yaqinda o'tkazilgan biofizik tadqiqotlar CspA va OIV NCp7 kabi passiv RNK chaperonlari RNKning
ikkilamchi tuzilmalarini qanday zaiflashtirishini yoritadi. CspA asosiy sovuq zarba oqsili bo'lib, 10 C da
sovuq zarbada kuchli induktsiya qilinadi (74). Boshqa funktsiyalar bilan bir qatorda, CspA va uning nisbiy
CspE mRNKning ikkilamchi tuzilmalarini beqarorlashtirish uchun taklif qilinadi, ular past haroratda
transkripsiyani tugatishi yoki mRNK tarjimasiga xalaqit berishi mumkin (75-77). CspA va CspE ning sovuq
zarba domenlari eukaryotik Y-box oqsillari bilan bog'liq va RNKni bir sirt bo'ylab bog'laydigan beta-barrel
tuzilishini hosil qiladi (78, 79). Sovuq zarba domenining yuzasidan chiqadigan uchta aromatik yon zanjir
RNK chaperon faolligi uchun hal qiluvchi ahamiyatga ega ekanligi aniqlandi (80, 81).
Takroriy tavlanish mexanizmi GroEL oqsili chaperoni (62) va CYT-19 DEAD-box RNK chaperoni
(19) ustida o'tkazilgan tajribalar bilan tasdiqlangan, ular ikkalasi ham substratni ochishning bir nechta
tsikllarini amalga oshirish uchun ATP gidrolizidan foydalanadi. GroEL va CYT-19 ATPazlarning reaktsiya
kinetikasining yaqinda o'tkazilgan nazariy tahlili faol oqsil va RNK chaperonlari muvozanatdan uzoqda
ishlaydi, hatto ba'zi bir mahalliy protein yoki RNK ham ochilgan bo'lsa ham, qisqa muddatda mahalliy
substrat miqdorini oshiradi, degan taklifga olib keldi. vasiy tomonidan (64). Ushbu doirada, qayta-qayta
ochilgan turlar substratlarning mahalliy tuzilishga erishish tezligini tezlashtiradi, garchi chaperonning
samaradorligi uning mahalliy va noto'g'ri qatlamlangan oqsil yoki RNKni farqlash qobiliyatiga bog'liq.
E. coli
Passiv shaperonlar, shuningdek, RNKni vaqtincha ochish (va qayta yig'ish) uchun o'z substratlarida va
undan tashqarida aylanishadi (60). Bog'lanish va bo'shatishning o'xshash tsikllari trans ta'sir etuvchi
tartibga soluvchi RNKlar va ularning maqsadlari o'rtasidagi tavlanishni osonlashtiradi. Asosiy farq
shundaki, chaperon bir vaqtning o'zida tartibga soluvchi yoki yo'naltiruvchi RNK va maqsadli RNKni
bog'lashi kerak, bu ularni ikki RNKning asosiy juftligini ta'minlaydigan uchlamchi kompleksda birlashtiradi
(65). RNK tayanch juftligidan keyin chaperon RNK dupleksini chiqaradi yoki RNK kompleksi aylantirilganda
qayta ishlanadi (66).
RNK o'z-o'zidan yoki boshqa RNK bilan buklanishdan qat'i nazar, chaperonning tez bog'lanishi va
chiqarilishi RNKning eng barqaror tuzilishini izlashiga imkon berish uchun juda muhimdir (17). Buni OIV
NCp7 (67) va 68 variantlari bo'yicha o'tkazilgan tajribalar tasdiqladi. Xuddi shunday, sRNKlar va ularning
mRNK maqsadlari o'rtasida tavlanishni rag'batlantiradigan Hfq oqsili in vitro (59, 69-71), sRNK-mRNK
dupleksini (70, 72) o'chiradi. Samarali moslashish sRNK Hfq kompleksi qo'shimcha sayt topilmaguncha
nomzod maqsadlari orasida tezkor qidiruvni talab qiladi (73).
StpA (59,
Rennella va boshqalar bir nechta CspA oqsillari ikkita qo'shimcha RNK soch iplarining
dimerizatsiyasini qanday osonlashtirishini kuzatish uchun vaqt bilan hal qilingan NMR spektroskopiyasidan
foydalanganlar (82). Eng sekin ochilish tezligi RNKning dimerizatsiya tezligiga teng bo'lib, har bir soch
tolasi ikkita ip tavlanishidan oldin ochilishi kerakligini ko'rsatadi. CspA, hayratlanarli darajada pastadirga
eng yaqin yoki spiral birikmasidagi tayanch juftlarini beqarorlashtirib, soch turmagining ochilish tezligini
oshirdi. Oldingi tadqiqotlarda bo'lgani kabi, ta'sirlangan aromatik qoldiqlar RNKning beqarorlashishiga
yordam berdi. Mualliflarning xulosasiga ko'ra, RNK soch iplaridagi tayanch juftlari atrofdagi asosiy
qoldiqlar bilan vodorod bog'lanishi bilan birga aromatik yon zanjirlar bilan o'zaro ta'sir qilish natijasida asta-
sekin buziladi. Bu aromatik va asosiy yon zanjirlarning kombinatsiyasi mavjud
E. coli ,