T. C. Jenkins biofizika kafedrasi, Jons Xopkins universiteti, 3400 N. Charlz St., Baltimor, md 21218 aqsh

Minnatdorchilik
3. Winkler WC, Breaker RR. Bakterial gen ekspressiyasini riboswitch yordamida tartibga solish. Annu Rev
9. Sobrero P, Valverde C. Bakterial oqsil Hfq: oddiy RNKni bog'lovchi omildan ko'ra ko'proq. Krit
11. Romby P, Vandenesch F, Vagner EG. Virulent-gen ekspressiyasini tartibga solishda RNK ning roli.
Curr Opin Microbiol. 2006; 9:229-236. [PubMed: 16529986]
mikrobiol. 2005; 59:487-517. [PubMed: 16153177]
4. Beisel CL, Storz G. Baza juftligi kichik RNKlar va ularning global tartibga solish tarmoqlaridagi rollari. FEMS
Rev Mikrobiol. 2012; 38:276-299. [PubMed: 22435753]
2. Grundy FJ, HenkinTM. Ribosomadan riboswitchgacha: RNK strukturasini qayta tashkil etish orqali
bakteriyalarda gen ifodasini nazorat qilish. Crit Rev Biochem Mol Biol. 2006; 41:329-338. [PubMed:
17092822]
7. Gottesman S, McCullen CA, Guillier M, Vanderpool CK, Majdalani N, Benhammou J, Tompson KM,
FitzGerald PC, Sowa NA, FitzGerald DJ. Kichik RNK regulyatorlari va stressga bakterial javob. Sovuq bahor
Harb Symp Quant Biol. 2006; 71:1–11. [PubMed: 17381274]
8. Romeo T, Vakulskas CA, Babitzke P. Global miqyosda transkripsiyadan keyingi tartibga solish: Csr /
Rsm tizimlarining shakli va funktsiyasi. Atrof-muhit mikrobiol. 2013; 15:313–324. [PubMed: 22672726]
6. Chao Y, Vogel J. Hfq ning bakterial patogenlarda roli. Curr Opin Microbiol. 2010; 13:24–33.
1. Serganov A, Patel DJ. Ribozimlar, riboswitchlar va boshqalar: oqsillarsiz gen ifodasini tartibga solish. Nat
Rev Genet. 2007; 8:776-790. [PubMed: 17846637]
[PubMed: 20080057]
10. Lucchetti-Miganeh C, Burrowes E, Baysse C, Ermel G. Post-transkripsiya regulyatori CsrA hayvonlar
xostlarida infektsiyaning turli bosqichlariga bakterial patogenlarning moslashuvida markaziy rol o'ynaydi.
mikrobiologiya. 2008; 154:16-29. [PubMed: 18174122]
Mikrobiol Rev. 2010; 34:866-882. [PubMed: 20662934]
5. Vagner EG, Romby P. Bakteriyalar va arxeyadagi kichik RNKlar: ular kimlar, nima qilishadi va buni qanday
qilishadi. Adv Genet. 2015; 90:133-208. [PubMed: 26296935]
9-sahifa
Mikrobiol spektri
Mualliflar Milliy Sog'liqni Saqlash Instituti (R01GM120425) tomonidan olib borilgan tadqiqotlarni qo'llab-quvvatlaganliklarini tan olishadi va G.
Storz va S. Gottesmanga qo'lyozma bo'yicha foydali muhokama va sharhlar uchun minnatdorchilik bildiradilar.
Woodson va boshqalar.
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Machine Translated by Google

---

16. Herschlag D. RNK shaperonlari va RNKning katlama muammosi. J Biol Chem. 1995 yil; 270:20871–
21. Updegrove TB, Chjan A, Storz G. Hfq: moslashuvchan RNK matchmaker. Curr Opin Microbiol. 2016;
12. Redder P, Hausmann S, Khemici V, Yasrebi H, Linder P. Bakteriyalarning ko'p qirraliligi O'LIK qutisi RNK
spirallarini talab qiladi. FEMS Microbiol Rev. 2015; 39:392-412. [PubMed: 25907111]
20874. [PubMed: 7545662]
[PubMed: 8026476]
13. Staley JP, Vulford JL Jr. Ribosomalar va spliceosomalarning yig'ilishi: murakkab ribonukleoprotein
32. Furtig B, Nozinovic S, Reining A, Schwalbe H. Riboswitchesning bir nechta konformatsion holatlari genlarni
tartibga solishni nozik sozlash. Curr Opin Struct Biol. 2015; 30:112-124. [PubMed: 25727496]
2011; 278: 1634-1642. [PubMed: 21410645]
22. Olejniczak M, Storz G. ProQ/FinO-domen oqsillari: RNK moslamalarining yana bir keng tarqalgan
oilasi? Mol mikrobiol. 2017; 104:905–915. [PubMed: 28370625]
28. Levin JG, Guo J, Rouzina I, Musier-Forsyth K. OIV-1 ning nuklein kislotasi chaperon faolligi
14 Phadtare S, Severinov K. Sovuq zarba oqsillari bilan RNKni qayta qurish va genlarni tartibga solish. RNK Biol.
DExH/D RNK helikazasi. Fan. 2001; 291:121-125. [PubMed: 11141562]
24. Hajnsdorf E, Boni IV. S1 va Hfq RNK-bog'lovchi oqsillarning ko'p faolligi. biokimyo. 2012;
2010; 7:788-795. [PubMed: 21045540]
19. Bhaskaran H, Russell R. Nativ va noto'g'ri katlanmÿÿ RNKlarning o'lik quti orqali kinetik qayta taqsimlanishi.
94: 1544-1553. [PubMed: 22370051]
30. Bayfild MA, Yang R, Maraia RJ. La va La bilan bog'liq oqsillar (LARPs) tuzilishi va funktsiyasining saqlanib
qolgan va farqli xususiyatlari. Biochim Biophys Acta. 2010; 1799:365-378. [PubMed: 20138158]
34. Krajewski SS, Narberhaus F. RNK termosensorlari tomonidan haroratga asoslangan differentsial
gen ifodasi. Biochim Biophys Acta. 2014 yil; 1839:978–988. [PubMed: 24657524]
20. Iost I, Bizebard T, Dreyfus M. Bakteriyalardagi DEAD-box oqsillarining funktsiyalari: joriy bilim va kutilayotgan
savollar. Biochim Biophys Acta. 2013; 1829:866–877. [PubMed: 23415794]
26. Coetzee T, Herschlag D, Belfort M. Escherichia coli oqsillari, shu jumladan ribosoma oqsili S12, RNK
ÿaperonlari sifatida harakat qilib, fag T4 intronlarining in vitro birlashishini osonlashtiradi. Gen Dev. 1994
yil; 8:1575–1588. [PubMed: 7958841]
31. Sim S, Wolin SL. Kodlanmagan RNK metabolizmida Ro 60-kDa otoantigenining paydo bo'ladigan rollari.
coli. hayot. 2015; 4
17. Doetsch M, Schroeder R, Furtig B. RNK katlamidagi vaqtinchalik RNK-oqsil o'zaro ta'siri. Fevral J.
30:133-138. [PubMed: 26907610]
33. Lau MV, Ferre-D'Amare AR. Ko'p faoliyat, bitta tuzilma: Ribozim burmalarining funktsional plastisitivligi.
Molekulalar. 2016; 21
mashinalar. Curr Opin Cell Biol. 2009; 21:109-118. [PubMed: 19167202]
18. Jankowsky E, Gross CH, Shuman S, Pyle AM. RNK-oqsil o'zaro ta'sirini faol ravishda buzish
23. Bear DG, Ng R, Van Derveer D, Jonson NP, Tomas G, Schleich T, Noller HF. S1 ribosoma oqsili tomonidan
polinukleotid ikkilamchi strukturaning o'zgarishi. Proc Natl Acad Sci US A. 1976; 73: 1824–1828. [PubMed:
778845]
Nukleokapsid oqsili: teskari transkripsiya va molekulyar mexanizmda muhim rol. Prog Nuklein kislota Res Mol
Biol. 2005; 80:217–286. [PubMed: 16164976]
29. Rein A, Henderson LE, Levin JG. Retrovirus nukleokapsid oqsillarining nuklein-kislota-chaperon faolligi:
virusli replikatsiya uchun ahamiyati. Trends Biochem Sci. 1998 yil; 23:297-301. [PubMed: 9757830]
boshliq. Tabiat. 2007; 449:1014-1018. [PubMed: 17960235]
25. Kolb A, Hermoso JM, Thomas JO, Szer W. S1 ribosoma oqsilining nuklein kislotasi spiralni ochish xususiyatlari
va mRNKning ribosomalarga bog'lanishida S1 roli. Proc Natl Acad Sci US A. 1977; 74:2379–2383. [PubMed:
329281]
15. Rudan M, Schneider D, Warnecke T, Krisko A. RNK shaperonlar E.dagi zararli mutatsiyalarni tamponlaydi.
27. Herschlag D, Khosla M, Tsuchihashi Z, Karpel RL. Bolg'a boshi ribozim katalizidagi o'ziga xos bo'lmagan
RNK bog'lovchi oqsillarning RNK chaperon faolligi. Embo J. 1994; 13:2913–2924.
Wiley Interdiscip Rev RNK. 2011; 2:686-699. [PubMed: 21823229]
Mualli
f
qo'
ly
ozma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Woodson va boshqalar.
10-bet
Mikrobiol spektri
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Machine Translated by Google

---

39 Chauhan S, Woodson SA. Uchinchi darajali o'zaro ta'sirlar RNKning katlanishining aniqligini aniqlaydi. J Am
8701472]
35. Peer A, Margalit H. Escherichia coli kichik RNKlarining evolyutsion naqshlari va ularni tartibga solish
Chem Soc. 2008; 130:1296-1303. [PubMed: 18179212]
3785. [PubMed: 1698622]
36. Kang Z, Chjan C, Chjan J, Jin P, Chjan J, Du G, Chen J. Bakteriyalardagi kichik RNK regulyatorlari:
2005; 44:4957-4970. [PubMed: 15794634]
[PubMed: 8052848]
49. Kreyg ME, Crothers DM, Doty P. O'z-o'zini to'ldiruvchi oligonükleotidlar tomonidan dimer hosil bo'lishining
gevÿeme kinetikasi. Molekulyar biologiya jurnali. 1971; 62:383-401. [PubMed: 5138338]
metabolik muhandislik va sintetik biologiya uchun kuchli vositalar. Microbiol Biotechnol ilovasi. 2014 yil; 98:3413–
3424. [PubMed: 24519458]
Tadqiqot. 1996 yil; 29:433-439.
dumaloq dikroizm va UV absorbans spektroskopiyalari va katalitik faollik. Nat Struct Biol. 1997 yil; 4:931–938.
[PubMed: 9360610]
37 Trausch JJ, Batey RT. Yangi genetik kodlangan RNK tartibga soluvchi qurilmalarni yaratish uchun tabiiy
riboswitchlardan olingan modulli "plug-and-play" ifoda platformalarini loyihalash.
42. Crothers DM. RNK konformatsion dinamikasi. In: Söll D, Nishimura S, Mur P, tahrirlovchilarRNA.
46. Sklavi B, Sallivan M, Chance MR, Brenovitz M, Vudson SA. RNKning millisekundda katlanishi
Trends Biochem Sci. 1994 yil; 19:294-300. [PubMed: 8048170]
56. Tomizava J. ColE1 plazmid replikatsiyasini nazorat qilish. Rom oqsilining RNK I va RNK II tomonidan hosil
bo'lgan beqaror kompleks bilan o'zaro ta'siri. J Mol Biol. 1990; 212:695-708. [PubMed: 1691791]
43. Draper D.E. RNK katlamlash strategiyalari. Trends Biochem Sci. 1996 yil; 21:145-149. [PubMed:
47 Lai D, Proktor JR, Meyer IM. Kotrankripsiyali RNK strukturasini shakllantirishning ahamiyati haqida.
transkript. hujayra. 1984 yil; 38:861-870. [PubMed: 6207934]
38. Behruzi R, Roh JH, Kilburn D, Briber RM, Woodson SA. Kooperativ uchinchi darajali o'zaro ta'sir tarmog'i
RNKning katlanishini boshqaradi. hujayra. 2012; 149:348-357. [PubMed: 22500801]
o'zaro ta'sirlar. Rna. 2014 yil; doi: 10.1261/rna.043133.113
40. Thirumalai D, Hyeon C. RNK va oqsillarni katlama: umumiy mavzular va o'zgarishlar. biokimyo.
44. Zarrinkar PP, Uilyamson JR. RNK katlamidagi kinetik oraliq moddalar. Fan. 1994 yil; 265:918-924.
41. Thirumalai D, Woodson SA. Oqsil va RNKning buklanish kinetikasi. Kimyoviy hisoblar
48. Schroeder R, Barta A, Semrad K. RNKni katlama va yig'ish strategiyalari. Nat Rev Mol Cell Biol. 2004;
5:908-919. [PubMed: 15520810]
54. Tamm J, Polisky B. ColE1 primer-RNA1 kompleksining xarakteristikasi: primer RNK bilan o'zaro ta'siri uchun
zarur bo'lgan ColE1 RNA1 domenini tahlil qilish. Proc Natl Acad Sci US A. 1985; 82:2257–2261. [PubMed:
2581244]
45. Pan T, Sosnick TR. tomonidan ochilgan katta ribozimning burmalarida oraliq va kinetik tuzoqlar
50. Porschke D. Nuklein kislota qo'sh spiralining ochilish tezligini to'g'ridan-to'g'ri o'lchash. Biofizik kimyo. 1974;
2:97-101. [PubMed: 4433688]
55. Kolb FA, Engdahl HM, Slagter-Jager JG, Ehresmann B, Ehresmann C, Westhof E, Vagner EG,
51 Nordström K, Vagner EG. Antisens RNK tomonidan plazmid replikatsiyasini nazorat qilishning kinetik jihatlari.
Romby P. Loop-loop kompleksining to'rt tomonlama birikmaga o'tishi tartibga soluvchi antisens RNKning faoliyati
uchun juda muhimdir. EMBO J. 2000; 19:5905–5915. [PubMed: 11060041]
Elsevier; Oksford, Buyuk Britaniya: 2001. 61–70.
sinxrotron gidroksil radikal izlari bilan intervallarni. Fan. 1998 yil; 279: 1940-1943. [PubMed: 9506944]
Usullari Enzimol. 2015; 550:41–71. [PubMed: 25605380]
52. Tomizava J. ColE1 plazmid replikatsiyasini nazorat qilish: RNK I ni primer bilan bog'lash jarayoni
RNK. 2013; 19:1461-1473. [PubMed: 24131802]
53. Persson C, Wagner EG, Nordstrom K. Plazmid R1 replikatsiyasini nazorat qilish: boshlang'ich vaqtinchalik
kompleksning shakllanishi antisens RNK - maqsadli RNK juftligi uchun tezlikni cheklaydi. EMBO J. 1990; 9:3777–
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
Mikrobiol spektri
11-bet
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Woodson va boshqalar.
Machine Translated by Google

---

CYT-19 oqsili, DEAD-box RNK chaperoni tomonidan ochiq spiralning ochilishi. Proc Natl Acad Sci US A.
2006; 103:16698–16703. [PubMed: 17075070]
66. Vagner EG. RNK larning Hfq da aylanishi. RNK Biol. 2013; 10:619–626. [PubMed: 23466677]
57 Herschlag D, Khosla M, Tsuchihashi Z, Karpel RL. Bolg'a boshi ribozim katalizidagi o'ziga xos bo'lmagan
RNK-bog'lovchi oqsillarning RNK chaperon faolligi. EMBO J. 1994; 13:2913–2924.
62. Todd MJ, Lorimer GH, Thirumalai D. Chaperonin tomonidan osonlashtirilgan oqsillarni katlama: iterativ
tavlanish mexanizmi orqali tezlik va rentabellikni optimallashtirish. Proc Natl Acad Sci US A. 1996; 93:4030–4035.
67. Cruceanu M, Gorelick RJ, Musier-Forsyth K, Rouzina I, Williams MC. Protein nuklein kislotasi o'zaro
ta'sirining tezkor kinetikasi OIV-1 nukleokapsid oqsilining nuklein kislotasi chaperon funktsiyasining asosiy
tarkibiy qismidir. J Mol Biol. 2006; 363:867-877. [PubMed: 16997322]
58. Grossberger R, Mayer O, Valdsich C, Semrad K, Urschitz S, Shreder R. RNKning ta'siri
72. Xopkins JF, Panja S, Vudson SA. RNK tavlanishi paytida Hfq ning uchlamchi komplekslardan tez
bog'lanishi va chiqarilishi. Nuklein kislotalari Res. 2011; 39:5193-5202. [PubMed: 21378124]
CspC va CspE ning haddan tashqari ifodalanishi va yo'q qilinishiga javoban gen ekspresyon profili. J Bakteriol.
69. Moll I, Leitsch D, Steinhauser T, Blasi U. Sm-ga o'xshash Hfq oqsilining RNK chaperon faolligi.
74. Goldstein J, Pollitt NS, Inouye M. Escherichia coli ning asosiy sovuq zarba oqsili. Proc Natl akad
78. Nyukirk K, Feng V, Jiang V, Tejero R, Emerson SD, Inouye M, Montelione GT. NMR eritmasi
StpA Escherichia coli oqsilining RNK chaperon faolligi bo'yicha tizimli barqarorlik. Nukl kislotalari Res. 2005;
33:2280-2289. [PubMed: 15849314]
Kimyo fizikasi. 2013; 139:121924. [PubMed: 24089736]
EMBO vakili. 2003; 4:284-289. [PubMed: 12634847]
59 Mayer O, Rajkowitsch L, Lorenz C, Konrat R, Schroeder R. RNK chaperon faolligi va E. coli oqsili StpA
ning RNK bog'lash xususiyatlari. Nukl kislotalari Res. 2007; 35: 1257-1269. [PubMed: 17267410]
64. Chakrabarti S, Hyeon C, Ye X, Lorimer GH, Thirumalai D. Molekulyar shaperonlar substratlarni
muvozanatdan haydash orqali biologik vaqtlarda tabiiy hosildorlikni maksimal darajada oshiradilar. Proc Natl
Acad Sci US A. 2017; 114: E10919–E10927. [PubMed: 29217641]
70 Lease RA, Woodson SA. Sm-ga o'xshash Hfq oqsilining DsrA kichik tartibga soluvchi RNKda aylanishi. J
boshliq. J Biol Chem. 1997 yil; 272:196-202. [PubMed: 8995247]
RNKlar. Curr Opin Microbiol. 2004; 7:140-144. [PubMed: 15063850]
71. Rajkowitsch L, Schroeder R. Dissecting RNK chaperone faoliyati. RNK. 2007; 13:2053–2060.
61. Tijerina P, Bhaskaran H, Russell R. Strukturaviy RNKga xos bo'lmagan bog'lanish va imtiyozli
[PubMed: 8026476]
[PubMed: 8633011]
68. Cusick ME, Belfort M. Escherichia coli tartibga soluvchi oqsil StpA ning domen tuzilishi va RNK tavlanish
faolligi. Mol mikrobiol. 1998 yil; 28:847-857. [PubMed: 9643551]
63. Hyeon C, Thirumalai D. RNK shaperonlarining ta'siri uchun umumlashtirilgan iterativ tavlanish modeli. J
73. Adamson DN, Lim HN. Hfq-ga bog'liq kichik RNK tarmoqlarida mustahkam signalizatsiya uchun asosiy
talablar. PLoS Comput Biol. 2011; 7: e1002138. [PubMed: 21876666]
2006; 188:2521-2527. [PubMed: 16547039]
Sci US A. 1990; 87:283-287. [PubMed: 2404279]
Escherichia coli dan asosiy sovuq zarba oqsilining (CspA) tuzilishi: DNK uchun bog'lovchi epitopni aniqlash.
Proc Natl Acad Sci US A. 1994; 91:5114–5118. [PubMed: 7515185]
75. Jiang V, Xou Y, Inouye M. CspA, Escherichia coli ning asosiy sovuq zarba oqsili RNK hisoblanadi.
65. Storz G, Opdyke JA, Chjan A. mRNK barqarorligi va tarjimasini kichik, kodlanmagan holda boshqarish
Mol Biol. 2004; 344:1211–1223. [PubMed: 15561140]
60 Woodson S.A. RNK shaperonlari bilan erkin energiya landshaftlarini o'zlashtirish. RNK Biol. 2010; 7:1–10.
76. Phadtare S, Inouye M, Severinov K. Escherichia coli CspE ning nuklein kislota erish faolligi transkripsiyaga
qarshi antiterminatsiya va hujayralarning sovuqqa moslashishi uchun juda muhimdir. J Biol Chem. 2002;
277:7239-7245. [PubMed: 11756430]
[PubMed: 17901153]
77 Phadtare S, Tadigotla V, Shin WH, Sengupta A, Severinov K. Global Escherichia coli tahlili
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Woodson va boshqalar.
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
12-bet
Mikrobiol spektri
Machine Translated by Google

---

Escherichia coli dan asosiy sovuq zarba oqsilining (CspA) magistral dinamikasi: bir zanjirli RNK-bog'lanish
joyidagi konformatsion dinamikaning dalillari. biokimyo. 1998 yil; 37:10881-
RNKlar. Trends Biochem Sci. 2011; 36:373-380. [PubMed: 21550256]
79. Schindelin H, Jiang W, Inouye M, Heinemann U. CspA ning kristall tuzilishi, Escherichia coli ning asosiy sovuq
zarba oqsili. Proc Natl Acad Sci US A. 1994; 91:5119–5123. [PubMed: 8197194]
10896. [PubMed: 9692981]
88. Guo J, Vu T, Keyn BF, Jonson DG, Xenderson LE, Gorelick RJ, Levin JG. Mahalliy sink barmoq tuzilmalarining
nozik o'zgarishlari inson immunitet tanqisligi virusi 1-toifa nukleokapsid oqsilining nuklein kislotasi chaperon
faolligiga dramatik ta'sir ko'rsatadi. J Virol. 2002; 76:4370–4378.
Stoylov SP, Mely Y. OIV-1 nukleokapsid oqsili tomonidan namunaviy RNKning tartibli agregatsiyasining xususiyatlari
va o'sish mexanizmi: elektron mikroskopiya tadqiqoti. biopolimerlar. 1998 yil; 45:217-229. [PubMed: 9465785]
1994 yil; 269:31491–31495. [PubMed: 7989315]
2010; 88:167-174. [PubMed: 20453919]
89. Heath MJ, Derebail SS, Gorelick RJ, DeStefano JJ. N- va C-terminal sinkning farqlovchi rollari
konformatsion tebranishlarni faollashtirish orqali nukleokapsid oqsili tomonidan TAR ning to'ldiruvchi ketma-ketligi. J
Mol Biol. 2003; 326:691-700. [PubMed: 12581633]
oqsillar. J Mol Biol. 2004; 337:147-155. [PubMed: 15001358]
82. Rennella E, Sara T, Juen M, Wunderlich C, Imbert L, Solyom Z, Favier A, Ayala I, Weinhaupl K, Schanda P, Konrat
R, Kreutz C, Brutscher B. RNK bilan bog'lanish va E ning chaperon faolligi. coli sovuq zarba oqsili CspA. Nukl
kislotalari Res. 2017; 45:4255-4268. [PubMed: 28126922]
teskari transkriptaza orqali proviral DNKga aylantirilishi. Biochem Soc Trans. 2016; 44: 1427-1440.
90. Uilyams MC, Gorelick RJ, Musier-Forsyth K. OIV-1 nukleokapsid oqsilining nuklein kislotasi chaperon funktsiyasi
uchun zarur bo'lgan o'ziga xos sink-barmoq arxitekturasi. Proc Natl Acad Sci US A. 2002; 99:8614–
2004; 279:44154–44165. [PubMed: 15271979]
87. Rein A, Datta SA, Jones CP, Musier-Forsyth K. Retrovirus Gag oqsillarining turli xil o'zaro ta'siri.
91. Williams MC, Rouzina I, Wenner JR, Gorelick RJ, Musier-Forsyth K, Bloomfield VA. OIV-1 nukleokapsid oqsilining
nuklein kislotasi chaperon faolligi mexanizmi bitta molekula cho'zilishi bilan aniqlangan. Proc Natl Acad Sci US A.
2001; 98:6121-6126. [PubMed: 11344257]
95. McCauley MJ, Rouzina I, Manthei KA, Gorelick RJ, Musier-Forsyth K, Williams MC. Nukleokapsid oqsilining
maqsadli bog'lanishi OIV-1 TAR RNKning katlama landshaftini o'zgartiradi. Proc Natl Acad Sci US A. 2015;
112:13555–13560. [PubMed: 26483503]
84 Feng V, Tejero R, Zimmerman DE, Inouye M, Montelione GT. Yechim NMR tuzilishi va
80. Phadtare S, Tyagi S, Inouye M, Severinov K. Escherichia coli CspE yuzasida joylashgan aromatik patch tarkibidagi
uchta aminokislotalar nuklein kislota erish faolligi uchun juda muhim, bu transkripsiyani antiterminatsiyaga olib
keladi va hujayralarning sovuqqa moslashishiga olib keladi. J Biol Chem. 2002; 277:46706–46711. [PubMed:
12324471]
85. Tompa P, Kovacs D. O'simliklar va hayvonlarda o'ziga xos tartibsiz chaperonlar. Biochem Cell Biol.
[PubMed: 11932404]
81. Phadtare S, Inouye M, Severinov K. CspA oilasi tomonidan nuklein kislota erishi mexanizmi
86. Darlix JL, de Rocquigny H, Mely Y. Nukleokapsidning retrovirus RNKdagi ko'p roli.
93. Azoulay J, Clamme JP, Darlix JL, Roques BP, Mely Y. Destabilization of OIV-1
97. Godet J, Ramalanjaona N, Sharma KK, Richert L, de Rocquigny H, Darlix JL, Duportail G, Mely Y. Primerning
tavlanishida OIV-1 nukleokapsid sink barmoqlarining o'ziga xos ta'siri
barmoqlar inson immunitet tanqisligi virusi nukleokapsid oqsili bilan kuchaytirilgan nuklein kislota tavlanishida. J Biol
Chem. 2003; 278:30755–30763. [PubMed: 12783894]
94. Heilman-Miller SL, Vu T, Levin JG. Nuklein kislota strukturasining o'zgarishi va barqarorligi modullanadi
OIV-1 nukleokapsid oqsili vositachiligida minus zanjirli uzatish samaradorligi. J Biol Chem.
[PubMed: 27911725]
8619. [PubMed: 12084921]
83. Hall KB. RNK va oqsillar: o'zaro hurmat. F1000Res. 2017; 6:345. [PubMed: 28408981]
92. Le Cam E, Coulaud D, Delain E, Petitjan P, Roques BP, Jerar D, Stoylova E, Vuilleumier C,
96. Siz JC, McHenry CS. Odamning immunitet tanqisligi virusi nukleokapsid oqsili teskari transkripsiyada ishtirok
etadigan terminal ortiqcha ketma-ketliklarning zanjirli uzatilishini tezlashtiradi. J Biol Chem.
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Woodson va boshqalar.
Mikrobiol spektri
13-bet
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Machine Translated by Google

---

107. Belair C, Sim S, Wolin SL. Kodlanmagan RNK kuzatuvi: maqsadlar vositalarni oqlaydi. Kimyo
Rev. 2017; doi: 10.1021/acs.chemrev.7b00462
majburiy ortiqcha strand o'tkazish paytida majburiy sayt to'ldiruvchi ketma-ketliklar. Nukl kislotalari Res.
112. Wilusz CJ, Wilusz J. Eukaryotik Lsm oqsillari: bakteriyalardan saboqlar. Nat Struct Mol Biol. 2005; 12:1031-1036.
[PubMed: 16327775]
98. Grohman JK, Gorelick RJ, Lickwar CR, Lieb JD, Bower BD, Znosko BM, Weeks KM. RNK chaperon
funktsiyasi uchun guanozin-markazli mexanizm. Fan. 2013; 340:190-195.
2008; 18:290-298. [PubMed: 18515081]
109. Pannone BK, Xue D, Wolin SL. U6 snRNP yig'ilishida xamirturush La proteinining roli: La proteini RNK polimeraza
III transkriptlari uchun molekulyar chaperon ekanligidan dalolat beradi. Embo J. 1998; 17:7442–7453. [PubMed:
9857199]
105. Montemayor EJ, Curran EC, Liao HH, Andrews KL, Treba CN, Butcher SE, Brow DA. 1,7-A o'lchamdagi U6
kichik yadro ribonukleoproteinining asosiy tuzilishi. Nat Struct Mol Biol.
110. Blewett NH, Maraia RJ. tRNK va boshqa RNK jarayonlarida ishtirok etish, shu jumladan xamirturush va
boshqa eukaryotlar o'rtasidagi farqlar. Biochim Biophys Acta. 2018; doi: 10.1016/
2014 yil; 21:544-551. [PubMed: 24837192]
99. Darlix JL, Godet J, Ivanyi-Nagy R, Fosse P, Mauffret O, Mely Y. OIV-1 nukleokapsid oqsilining moslashuvchan
tabiati va o'ziga xos funktsiyalari. J Mol Biol. 2011; 410:565-581. [PubMed: 21762801]
j.bbagrm.2018.01.013
115. Chjan A, Vassarman KM, Ortega J, Stiven AC, Storz G. Sm-ga o'xshash Hfq oqsili OxyS RNKning maqsadli
mRNKlar bilan o'zaro ta'sirini oshiradi. Mol hujayra. 2002; 9:11–22. [PubMed: 11804582]
di-snRNP yig'ish jarayonida U4 va U6 RNKlarining katalizlangan tavlanishi. Nukl kislotalari Res. 2016;
44:1398-1410. [PubMed: 26673715]
101. Duval M, Korepanov A, Fuchsbauer O, Fechter P, Haller A, Fabbretti A, Choulier L, Micura R, Klaholz BP,
Romby P, Springer M, Marzi S. Escherichia coli ribosoma oqsili S1 ribosomalar uchun tuzilgan mRNKlarni
ochadi. faol tarjima boshlanishi. PLoS Biol. 2013; 11: e1001731. [PubMed: 24339747]
RNK 3' uchlarini inson La oqsili tomonidan tanib olishda konformatsion plastisiya. tuzilishi.
108. Maraia RJ, Lamichhane TN. 3' eukaryotik prekursor tRNKlarni qayta ishlash. Wiley Interdiscip Rev RNK. 2011;
2:362–375. [PubMed: 21572561]
2011; 39:6633–6645. [PubMed: 21543454]
[PubMed: 23470731]
104. Raghunathan PL, Guthrie C. U4 va U6 kichik yadroviy ribonukleoprotein zarralarini qayta tug'diradigan
spliceosomal qayta ishlash omili. Fan. 1998 yil; 279:857-860. [PubMed: 9452384]
103. Kleri A, Blatter M, Allain FH. RNKni tanib olish motivlari: zerikarlimi? To'liq emas. Curr Opin Struct Biol.
113. Babitzke P. RNK-bog'lovchi oqsilni allosterik nazorat qilish orqali transkripsiyaning susayishi va tarjima
boshlanishini tartibga solish: Bacillus subtilis TRAP oqsili. Curr Opin Microbiol. 2004; 7:132-139. [PubMed:
15063849]
114. Waters LS, Storz G. Bakteriyalardagi tartibga soluvchi RNKlar. hujayra. 2009; 136:615-628. [PubMed:
19239884]
111. Kotik-Kogan O, Valentine ER, Sanfelice D, Conte MR, Curry S. Strukturaviy tahlil ochib beradi.
100. Wu H, Mitra M, Naufer MN, McCauley MJ, Gorelick RJ, Rouzina I, Musier-Forsyth K, Williams MC. OIV-1
nukleokapsid oqsilining nuklein kislotasi chaperon funktsiyasi va retrovirus replikatsiyasiga asosiy qoldiqlarning
differentsial hissasi. Nukl kislotalari Res. 2014 yil; 42:2525–2537. [PubMed: 24293648]
106. Didychuk AL, Montemayor EJ, Brow DA, Butcher SE. Proteinlarga tuzilish talablari
116. Vecerek B, Moll I, Afonyushkin T, Kaberdin V, Blasi U. RNK chaperone Hfq ning mRNKlar bilan o'zaro ta'siri:
Escherichia coli ning temir metabolizmida Hfq ning bevosita va bilvosita rollari. Mol mikrobiol. 2003; 50:897–
909. [PubMed: 14617150]
2008; 16:852-862. [PubMed: 18547518]
102. Qu X, Lancaster L, Noller HF, Bustamante C, Tinoco I Jr. Ribosomal protein S1 ikki zanjirli RNKni bir necha
bosqichda echib tashlaydi. Proc Natl Acad Sci US A. 2012; 109:14458–14463. [PubMed: 22908248]
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Woodson va boshqalar.
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
14-bet
Mikrobiol spektri
Machine Translated by Google

---

[PubMed: 21788484]
136. Beisel CL, Updegrove TB, Janson BJ, Storz G. Hfq tomonidan maqsad tanlashni bir nechta omillar belgilaydi
122. Weichenrieder O. RNKning Hfq va halqa hosil qiluvchi (L)Sm oqsillari bilan bog'lanishi: optimal ketma-ketlikni o'qish
va RNK magistral konformatsiyasi o'rtasidagi kelishuv. RNK Biol. 2014 yil; 11:537–549.
117. Vecerek B, Moll I, Blasi U. Escherichia coli hfq RNK chaperonening translyatsion avtonazorati
126. Sauer E, Weichenrieder O. Hfq tomonidan RNK 3'-uchini tanib olish uchun strukturaviy asos. Proc Natl Acad Sci US
A. 2011; 108:13065–13070. [PubMed: 21737752]
131. Mikulecky PJ, Kaw MK, Brescia CC, Takach JC, Sledjeski DD, Feig AL. Escherichia coli Hfq DsrA, rpoS va poli(A)
RNKlar uchun aniq o'zaro ta'sir sirtiga ega. Nat Struct Mol Biol. 2004; 11:1206-1214. [PubMed: 15531892]
sRNK. RNK. 2008; 14:1907–1917. [PubMed: 18658123]
123 Shumaxer MA, Pearson RF, Moller T, Valentin-Hansen P, Brennan RG. ning tuzilmalari
DsrA. J Bakteriol. 2001; 183:1997–2005. [PubMed: 11222598]
119. Chen J, Gottesman S. Hfq tarjima repressiyasini E. coli da stressdan kelib chiqqan mutagenez bilan bog'laydi.
Embo J. 2002; 21:3546–3556. [PubMed: 12093755]
129 Fei J, Singx D, Chjan Q, Park S, Balasubramanian D, Golding I, Vanderpool CK, Ha T. RNK biokimyosi. Regulyatsiya
qiluvchi kodlanmagan RNKning in vivo maqsadli qidiruv kinetikasini aniqlash.
Fan. 2015; 347: 1371-1374. [PubMed: 25792329]
120 Ellis MJ, Trussler RS, Haniford DB. Hfq translatsiyani inhibe qilish uchun to'g'ridan-to'g'ri IS10 transposaza
mRNKning ribosoma bilan bog'lanish joyiga bog'lanadi. Mol mikrobiol. 2015; 96:633-650. [PubMed: 25649688]
134 Soper T, Mandin P, Majdalani N, Gottesman S, Vudson SA. Kichik RNKlar tomonidan ijobiy tartibga solish va Hfq roli.
Proc Natl Acad Sci US A. 2010; 107:9602–9607. [PubMed: 20457943]
137. Moller T, Franch T, Hojrup P, Keene DR, Bachinger HP, Brennan RG, Valentin- Hansen P. Hfq: a
11195. [PubMed: 18826256]
125. Otaka H, Ishikawa H, Morita T, Aiba H. PolyU dumi bakterial kichik RNKlarning rho-mustaqil terminatori Hfq harakati
uchun juda muhimdir. Proc Natl Acad Sci US A. 2011; 108:13059–13064.
121. Kavita K, de Mets F, Gottesman S. Hfq va uning sherigi tomonidan RNKga asoslangan tartibga solishning yangi jihatlari
130. Chjan A, Schu DJ, Tjaden BC, Storz G, Gottesman S. O'zaro ta'sir yuzalarida mutatsiyalar
127. Sledjeski DD, Whitman C, Zhang A. Hfq tarjima qilinmagan RNK tomonidan tartibga solish uchun zarur.
gen. RNK. 2005; 11:976–984. [PubMed: 15872186]
118. Desnoyers G, Masse E. RNK chaperon Hfq ning kichik RNK ishga tushirilishi orqali tarjima boshlanishining kanonik
bo'lmagan repressiyasi. Gen Dev. 2012; 26:726-739. [PubMed: 22474262]
pleiotropik translatsiya regulyatori Hfq va Hfq-RNK kompleksi: bakterial Sm-ga o'xshash oqsil.
[PubMed: 24828406]
132. Soper TJ, Woodson S.A. rpoS mRNK rahbari DsrA bilan tavlanishni osonlashtirish uchun Hfq ni ishga oladi.
kichik RNKlarni bog'laydi. EMBO J. 2012; doi: 10.1038/emboj.2012.52
RNK-RNK o'zaro ta'sirida vositachilik qiluvchi bakterial Sm-ga o'xshash protein. Mol hujayra. 2002; 9:23–30.
128. Ishikawa H, Otaka H, Maki K, Morita T, Aiba H. Bakterial sRNKlarning funktsional Hfq-bog'lash moduli U-ga boy ketma-
ketlikdan oldin va undan keyin 3' poli( U) dum. RNK. 2012; 18:1062-1074. [PubMed: 22454537]
133. Link TM, Valentin-Hansen P, Brennan RG. Ichak tayoqchasi Hfq bilan bog'langan tuzilishi
poliriboadenilat RNK. Proc Natl Acad Sci US A. 2009; 106:19292–19297. [PubMed: 19889981]
135 Updegrove T, Wilf N, Sun X, Wartell RM. Hfq ning RprA-rpoS mRNK juftligiga ta'siri: Hfq-RNK ulanishi va 5' rpoS mRNK
yetakchi mintaqasining ta'siri. biokimyo. 2008; 47:11184–
124. Brescia CC, Mikulecky PJ, Feig AL, Sledjeski DD. DsrA RNKda Hfq-bog'lanish joyini aniqlash: Hfq DsrA ikkilamchi
tuzilishini o'zgartirmasdan bog'lanadi. Rna. 2003; 9:33–43. [PubMed: 12554874]
Gen Dev. 2017; doi: 10.1101/gad.302547.117
[PubMed: 11804583]
Differentsial ta'sir E. coli Hfq kichik RNKlar va ularning mRNK maqsadlari bilan assotsiatsiyasi. J Mol Biol. 2013;
425:3678–3697. [PubMed: 23318956]
sRNKlar. Curr Opin Microbiol. 2017; 42:53–61. [PubMed: 29125938]
Mualli
f
qo'
ly
ozma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
15-bet
Mikrobiol spektri
Woodson va boshqalar.
Machine Translated by Google

---

va ipning Hfq ga siljishi. Nuklein kislotalari Res. 2009; 37:6205–6213. [PubMed: 19671524]
147. Hwang W, Arluison V, Hohng S. Samarali tavlanish uchun vosita sifatida Hfq ning proksimal bog'lanish joyi
uchun DsrA va rpoS fragmentlarining dinamik raqobati. Nuklein kislotalari Res. 2011; 39:5131–5139.
[PubMed: 21357187]
Chaperone. Angew Chem Int Ed Engl. 2015; 54:7281–7284. [PubMed: 25959666]
140. Papenfort K, Said N, Welsink T, Lucchini S, Hinton JC, Vogel J. ArcZ tomonidan mRNK regulyatsiyasining o'ziga
xos va pleiotropik naqshlari, saqlanib qolgan, Hfq ga bog'liq kichik RNK. Mol mikrobiol. 2009; 74:139-158. [PubMed:
19732340]
145 Arluison V, Hohng S, Roy R, Pellegrini O, Regnier P, Ha T. Kichkina kodlanmagan RNK tomonidan transkripsiyadan
keyingi tartibga solishda Hfq ning RNK chaperon faolligini spektroskopik kuzatish. Nukl kislotalari Res. 2007;
35:999-1006. [PubMed: 17259214]
152. Updegrove TB, Wartell RM. Escherichia coli Hfq mutatsiyalarining RNK bog'lanishiga va rpoS riboregulatsiyasida
sRNK * mRNK dupleks shakllanishiga ta'siri. Biochim Biophys Acta. 2011; 1809:532-540. [PubMed: 21889623]
mikrobiol. 2000; 38:667-672. [PubMed: 11115103]
141. Tree JJ, Granneman S, McAteer SP, Tollervey D, Gally DL. Bakteriofagni aniqlash
146 Zheng A, Panja S, Woodson SA. Arginin yamog'i Hfq ning RNKni yumshatish faolligini taxmin qiladi
144. Xopkins JF, Panja S, McNeil SA, Woodson SA. Tuz va RNK tuzilishining tavlanishga ta'siri
138. Sauer E, Shmidt S, Weichenrieder O. Hfq heksamerlarining lateral yuzasiga kichik RNK bog'lanishi va mRNK
nishonini tanib olishda strukturaviy o'zgarishlar. Proc Natl Acad Sci US A. 2012; 109:9396–9401. [PubMed:
22645344]
153. Peng Y, Curtis JE, Fang X, Vudson SA. Bakterial chaperon Hfq bilan kompleksda mRNKning strukturaviy
modeli. Proc Natl Acad Sci US A. 2014; 111:17134–17139. [PubMed: 25404287]
139. Panja S, Schu DJ, Woodson SA. Hfq chetidagi konservalangan argininlar tayanch juft hosil bo'lishi va
almashinuvini katalizlaydi. Nuklein kislotalari Res. 2013; 41:7536–7546. [PubMed: 23771143]
151 Panja S, Pol R, Greenberg MM, Woodson SA. Yorug'lik bilan tetiklanadigan RNKning RNK tomonidan tavlanishi
156. Salim NN, Feig AL. FhlA mRNK yetakchisi hududidagi yuqori oqimdagi Hfq ulanish joyi bu jarayonni osonlashtiradi
OxyS-fhlA o'zaro ta'siri. PLOS One. 2010; 5: e13028. [PubMed: 20927406]
157 Gorski SA, Vogel J, Doudna JA. RNKga asoslangan tanib olish va nishonga olish: o'ziga xoslik urug'ini ekish.
Nat Rev Mol Cell Biol. 2017; 18:215-228. [PubMed: 28196981]
va Hfq. J Mol Biol. 2014 yil; 426:275-285. [PubMed: 24051417]
148. Suxodolets MV, Garges S. Escherichia coli RNK polimerazasining ribosoma oqsili S1 va Sm-ga o'xshash ATPaz
Hfq bilan o'zaro ta'siri. biokimyo. 2003; 42:8022-8034. [PubMed: 12834354]
158 Husayn R, Lim HN. Hfq uchun raqobat tufayli kichik RNK signalizatsiyasining buzilishi. Proc Natl Acad Sci US A. 2011;
108:1110-1115. [PubMed: 21189298]
143. Schu DJ, Chjan A, Gottesman S, Storz G. Muqobil Hfq-sRNK shovqin usullari muqobil mRNK tan olinishini
talab qiladi. Embo j. 2015; doi: 10.15252/embj.201591569
149 Vang V, Vang L, Zou Y, Zhang J, Gong Q, Vu J, Shi Y. DsrA bog'lanishida Escherichia coli Hfq heksamerlarining
hamkorligi. Gen Dev. 2011; 25:2106–2117. [PubMed: 21979921] 150. de Ribeiro EA Jr, Beich-Frandsen M,
Konarev PV, Shang W, Vecerek B, Kontaxis G, Hammerle H, Peterlik H, Svergun DI, Blasi U, Djinovic-Carugo K.
Structural flexi of RNA Hfq chaperon funktsiyasi uchun molekulyar asos sifatida. Nuklein kislotalari Res. 2012;
40:8072-8084. [PubMed: 22718981]
155. Bordeau V, Felden B. Curli sintezi va ichak bakteriyalarida biofilm hosil bo'lishi RNK chaperoni tomonidan yordam
beradigan psevdoknotdan tashkil topgan dinamik kichik RNK moduli tomonidan boshqariladi. Nuklein kislotalari
Res. 2014 yil; 42:4682–4696. [PubMed: 24489123]
patogen Escherichia coli da kodlangan anti-sRNKlar. Mol hujayra. 2014 yil; 55:199-213. [PubMed: 24910100]
Gram-manfiy va gramm-musbat bakteriyalardan. J Mol Biol. 2016; 428:2259–2264. [PubMed: 27049793]
154. Lease RA, Belfort M. DsrA RNK tomonidan riboregulatsiya: global iqtisodiyot uchun transaksiyalar. Mol
142. Peng Y, Soper TJ, Woodson SA. sRNKlar tomonidan rpoS tartibga solishda AAN motivlarining pozitsion ta'siri
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mikrobiol spektri
16-bet
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Woodson va boshqalar.
Machine Translated by Google

---

170. Koculi E, Li NK, Thirumalai D, Woodson SA. Tetrahymena ribozimining burmalanishi
165. Grohman JK, Del Campo M, Bhaskaran H, Tijerina P, Lambowitz AM, Russell R. DEAD-box oqsillarining
mexanizmlarini umumiy RNK chaperonlari sifatida tekshirish: CYT-19 ning C-terminal domeni RNKning
umumiy tan olinishiga vositachilik qiladi. biokimyo. 2007; 46:3013–3022. [PubMed: 17311413]
159. Moon K, Gottesman S. Ichak tayoqchasidagi Hfq bog'lovchi kichik RNKlar o'rtasidagi raqobat. Mol
poliaminlar: qarshi ion valentligi va hajmining ahamiyati. J Mol Biol. 2004; 341:27–36. [PubMed: 15312760]
175. Vang C, Uverskiy VN, Kurgan L. Tartibsiz yadro: Eukaryota, Bakteriyalar va Arxeylardan 1121 turdagi DNK va
RNK-bog'lovchi oqsillarda ichki buzilishning ko'pligi.
176. Santyago-Frangos A, Jeliazkov JR, Grey JJ, Vudson SA. Kislotali C-terminal domenlari Hfq RNK
chaperonini avtoregulyatsiya qiladi. hayot. 2017; 6 p.i. 27049.
166 Mohr G, Del Campo M, Mohr S, Yang Q, Jia H, Jankowsky E, Lambowitz AM. In vivo va in vitro tahlil qilingan
Mss116p DEAD-box oqsilining C-terminal domenining funktsiyasi. J Mol Biol.
171. Koculi E, Thirumalai D, Woodson SA. Qarama-qarshi zaryad zichligi pozitsiyani belgilaydi va
161 Fender A, Elf J, Hampel K, Zimmermann B, Vagner EG. RNKlar Sm-ga o'xshash Hfq oqsilida faol aylanishadi.
Gen Dev. 2010; 24:2621–2626. [PubMed: 21123649]
167. Busa VF, rektor MJ, Russell R. CYT-19 DEAD-box proteini RNK substratlarini bog'lash uchun C-dumidagi
arginin qoldiqlaridan foydalanadi. biokimyo. 2017; 56:3571–3578. [PubMed: 28650145]
172 Hauk G, McKnight JN, Nodelman IM, Bowman GD. Chd1 kromatin remoderining xromodomainlari ATPase
motoriga DNK kirishini tartibga soladi. Mol hujayra. 2010; 39:711-723. [PubMed: 20832723]
168. Russell R, Jarmoskaite I, Lambowitz AM. RNKni qayta qurishni molekulyar tushunishga
162. Boehr DD, Nussinov R, Rayt PE. Biomolekulyar tanib olishda dinamik konformatsion ansambllarning
roli. Nat Chem Biol. 2009; 5:789–796. [PubMed: 19841628]
173. Kozlov AG, Koks MM, Lohman TM. Escherichia coli bir zanjirli DNK-bog'lovchi (SSB) oqsilining C termini
tomonidan bir zanjirli DNK bog'lanishini tartibga solish. J Biol Chem. 2010; 285:17246–
178. Beich-Frandsen M, Vecerek B, Konarev PV, Sjoblom B, Kloiber K, Hammerle H, Rajkovitsch L,
E. coli RNK chaperone Hfq ning C-terminalining dinamikasi va funktsiyasi haqida tizimli tushunchalar.
Nuklein kislotalari Res. 2011; 39:4900–4915. [PubMed: 21330354]
169 Kucera NJ, Hodsdon ME, Wolin SL. O'z-o'zidan buzilgan C terminusi La proteiniga turli xil kodlanmagan RNK
prekursorlarining biogeneziga yordam beradi. Proc Natl Acad Sci US A. 2011; 108:1308-1313. [PubMed:
21212361]
164 Vo MN, Barany G, Rouzina I, Musier-Forsyth K. OIV-1 nukleokapsid oqsili
174 Tretter EM, Berger JM. DNK giraza ortologlarining supercoiling to'siq nuqtasini aniqlash mexanizmlari: I.
Konservalanmagan kislotali C-terminal dumi Escherichia coli giraza faolligini modulyatsiya qiladi. J Biol Chem.
Proteomika. 2016; 16: 1486-1498. [PubMed: 27037624]
mikrobiol. 2011; 82: 1545–1562. [PubMed: 22040174]
160. Olejniczak M. Hfq oqsili bilan o'xshash bog'lanishiga qaramay, tartibga soluvchi RNKlar o'zlarining raqobatdosh
ko'rsatkichlari bo'yicha juda katta farq qiladi. biokimyo. 2011; 50:4427–4440. [PubMed: 21510661]
2008; 375: 1344-1364. [PubMed: 18096186]
RNKning katlamali o'tish holatlarining plastikligi. J Mol Biol. 2006; 359:446-454. [PubMed: 16626736]
177. Santyago-Frangos A, Kavita K, Schu DJ, Gottesman S, Woodson SA. Hfq RNK chaperonining C-terminal
domeni sRNK raqobatini va maqsadli RNKning chiqarilishini qo'zg'atadi. Proc Natl Acad Sci US A. 2016; 113:
E6089–e6096. [PubMed: 27681631]
17252. [PubMed: 20360609]
DEAD-box oqsillari tomonidan. RNK Biol. 2013; 10:44–55. [PubMed: 22995827]
163. Uverskiy VN. Protein komplekslarida ichki buzilishning ko'p qirrali rollari. FEBS Lett. 2015; 589:2498-2506.
[PubMed: 26073257]
Miles AJ, Kontaxis G, Uolles BA, Svergun DI, Konrat R, Blasi U, Djinovic-Karugo K.
2012; 287: 18636–18644. [PubMed: 22457353]
RNK/DNK elementining transaktivatsiyaga javob berish yo'li halqa-qovuzloq "o'pish" dan "fermuar" ga o'tadi.
J Mol Biol. 2009; 386:789-801. [PubMed: 19154737]
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Woodson va boshqalar.
Mikrobiol spektri
17-bet
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Machine Translated by Google

---

181. Santyago-Frangos A, Vudson SA. Hfq chaperone bakterial sRNK bilan tanishish tezligini oshiradi.
Wiley Interdiscip Rev RNK. 2018; doi: 10.1002/wrna.1475: e1475
Musier-Forsyth K. C-terminal domeni elektrostatik mexanizm orqali inson T hujayrali leykemiya virusi
1-toifa nukleokapsid oqsilining nuklein kislotasi chaperon faolligini modulyatsiya qiladi. J Biol Chem.
Nuklein kislotalari Res. 2012; 40:8698-8710. [PubMed: 22730296]
2010; 285:295-307. [PubMed: 19887455]
180. Qualley DF, Styuart-Meynard KM, Vang F, Mitra M, Gorelick RJ, Rouzina I, Uilyams MC,
179 Vinsent HA, Henderson CA, Stone CM, Cary PD, Gowers DM, Sobott F, Taylor JE, Callaghan AJ.
Qrr1 sRNK bilan kompleksda Vibrio cholerae Hfq ning past aniqlikdagi eritma tuzilishi.
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Woodson va boshqalar.
Mikrobiol spektri
18-bet
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
Machine Translated by Google

---

RNKning ikkilamchi strukturasini (chapda) va uchinchi tuzilmani (o'ngda) shakllantirishning odatiy kinetik
mexanizmi. Ikki tomonlama spirallarni (tsilindrlarni) ixcham oraliq mahsulotlarga yig'ish, mahalliy RNKni
ishlab chiqarish uchun uchinchi darajali o'zaro ta'sirlarni qayta tashkil etish bilan davom etadi. RNK ko'plab
ikkilamchi tuzilmalarni qabul qilishi mumkinligi sababli, ba'zi molekulalar to'g'ridan-to'g'ri mahalliy tuzilishga
(yuqori yo'l) buklanadi, boshqalari esa mahalliy bo'lmagan tuzilmalarda tuzoqqa tushadi. Klassik iterativ
tavlanish modelida chaperonlar (oltin, pastki) bog'laydi va qisman ochilgan noto'g'ri oraliq mahsulotlarni
bog'laydi, so'ngra ochilgan RNKni yana katlama uchun chiqaradi. (60) ruxsati bilan moslashtirilgan.
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma