T. C. Jenkins biofizika kafedrasi, Jons Xopkins universiteti, 3400 N. Charlz St., Baltimor, md 21218 aqsh

Subrata Panja1 va Endryu Santyago-Frangos2
hfq, bor
(15), bunday oqsillarni taklif qiladi
,
Yakuniy tahrirlangan shaklda nashr etilgan:
E. coli
Sara A. Vudson1,*
E. coli
E. coli
RNK shaperonlarining ushbu uy xo'jaligi va tartibga solish funktsiyalari RNK tuzilmalarini giperstabilizatsiya
qiluvchi sovuq haroratlarda ayniqsa muhimdir. Masalan, past haroratli o'sish jarayonida sovuq zarba domenini
bog'laydigan RNK oqsillarini yuqori regulyatsiyasi RNK tuzilmalarini beqarorlashtiradi, aks holda past
haroratlarda transkripsiya uzayishi va tarjima boshlanishiga putur etkazadi (14). Bundan tashqari, sovuq zarba
oqsillari va boshqa RNK ÿaperonlarining haddan tashqari ifodalanishi RNKning noto'g'ri qatlamlanishi ta'sirini
keng miqyosda yumshatish uchun zararli mutatsiyalarni tamponladi.
.
muallifning qo'lyozmasi
RNK regulyatsiyasini boshqaradigan oqsillar
*[e-mail] manziliga yozishmalar; tel. [phone]; FAKS 410-516-7348.
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Muall
if 
q
o'
ly
o
zma
Mualli
f
qo'
ly
ozma
M
ua
l
li
f 
qo'l
y
oz
ma
Mikrobiol spektri
. muallifning qo'lyozmasi; PMC-da 2018-yil 10-avgustda mavjud.
HHS jamoatchilikka kirish
KIRISH
Abstrakt
Machine Translated by Google

---

Hfq, qanday qilib jismoniy rasmni taqdim qila boshladilar
RNK qo'sh spirallari barqaror va uzoq umr ko'rishadi, lekin zanjir o'tkazish yoki filial migratsiya reaktsiyalari
paytida tayanch juftlarining ketma-ket migratsiyasi orqali o'zaro almashishga qodir. Barqarorlik va o'zaro
almashinishning bu xususiyatlari gen ifodasini yoqish yoki o'chirishga qodir bo'lgan metastabil tuzilmalarni
yaratish uchun RNKga juda mos keladi. RNK qo'sh spiralining barqarorligi tufayli RNK tartibga soluvchi
elementlar bitta poyali halqa yoki anti-sezuvchi spiral kabi kichik bo'lishi mumkin yoki yanada rivojlangan
uchinchi darajali tuzilmalarni o'z ichiga olishi mumkin (32-34). RNKga asoslangan tartibga solishning potentsial
soddaligi mikroblarga yangi tartibga solish sxemalarini ishlab chiqishning maqsadga muvofiq vositasini taklif
qiladi (35). (Shuningdek, R. Raghavan bobiga qarang). Shuningdek, u sintetik biologlarga genetik muhandislik
uchun jozibali platformani taqdim etadi (36, 37). (Shuningdek, M. Hammondning bobiga qarang).
asosan ribosoma biogenezi va RNK almashinuvida harakat qiladi (12, 20). Biroq, bu bobda ATPni
gidrolizlamasdan RNK tuzilmalarini "passiv" qayta tashkil etuvchi RNKni bog'lovchi oqsillarga e'tibor qaratiladi.
Bakteriyalarda bu turdagi passiv RNK chaperoni sovuq zarba oqsillarini (CSPs) (14), Sm oilasi oqsilini Hfq
(21), RNK bog'lovchi oqsillarning FinO / ProQ oilasini (22) va ribosoma oqsillarini S1 (23-25) o'z ichiga oladi. )
va S12(26). Bakterial nukleoid bilan o'zaro ta'sir qiluvchi H-NS va StpA ham RNK chaperon faolligiga ega (17).
ATP-mustaqil RNK chaperon xususiyatlariga ega eukaryotik oqsillarga hnRNP A1 (27) kabi RNKni aniqlash
motivi (RRM) oqsillari, yaxshi o'rganilgan retrovirus nukleokapsid oqsili (NCp7) (28, 29) kabi virusli oqsillar va La
va Ro oqsillari kiradi. (30, 31).
Barqaror RNK tayanch juftlari yaxshi kalitlarni yaratsa-da, tabiiy nukleobazalar sonining kamligi
RNKning tartibga soluvchi o'zaro ta'sirining o'ziga xosligini cheklaydi va RNKning noto'g'ri qatlamlanishi ehtimolini
oshiradi (16). Misol uchun, 10 bp lik poyali halqa hosil qilishning erkin energiyasi odatda 37 C da -10 dan -20
kkal/mol gacha o'zgarib turadi, lekin bir xil uzunlikdagi mos kelmaydigan spiral 1-2 kkal/mol kamroq barqaror
bo'lishi mumkin. to'liq mos keladigan spiral. RNK uzaygan sari uning bir nechta barqaror ikkilamchi struktura
hosil qilish ehtimoli sezilarli darajada oshadi.
Yuqoridagi misollarning xilma-xil biologik rollari kodlanmaydigan RNKdagi strukturaviy o'zgarishlarni
kuzatuvchi, osonlashtiradigan yoki tezlashtiradigan oqsillarning keng ahamiyatini ta'kidlaydi. Ushbu bobda
CspA, OIV NCp7, ribosoma oqsili S1 va oqsillar kabi yaxshi o'rganilgan misollar RNK regulyatsiyasi
paytida RNK tuzilmalarini
qanday qayta qurishi muhokama qilinadi.
Ikki tomonlama spirallar orasidagi uchinchi darajali o'zaro ta'sirlar qo'sh spirallar to'g'ri tekislangan katlama
oraliqlariga ustunlik berib, katlamani yanada aniqroq qiladi (38, 39). Shunga qaramay, RNK ketma-ketligida bir-
biridan uzoqda joylashgan nukleotidlar orasidagi o'zaro ta'sirlar entropik jihatdan yaqin nukleotidlar orasidagi
o'zaro ta'sirga qaraganda kamroq qulaydir. Natijada, barqaror mahalliy o'zaro ta'sirlar uzoq masofali o'zaro
ta'sirlardan ustun keladi, bu mahalliy konformatsiyani qidirishni puchga chiqaradi va noto'g'ri tayanch juftlik
naqshlarining saqlanib qolishiga imkon beradi (40, 41).
E. coli