Масштабный анализ микроРНК в биологических жидкостях:
поиск маркеров рака для «жидкой биопсии»
Рыкова Е.Ю.
1,2,4
, Запорожченко И.А.
1,2
, Пономарева А.А.
3
, Коношенко М.Ю.
1,2
,
Брызгунова О.Е.
1,2
, Лехнов Е.А.
1,2
, Пашковская О.А.
2
, Власов В.В.
1
, Чердынцева Н.В.
3
,
Лактионов П.П.
1,2
1 ИХБФМ СО РАН, Новосибирск, Россия
2 НИИ патологии кровообращения им. Академика Е.Н. Мешалкина, Новосибирск, Россия
3 Томский НИМЦ, Томск, Россия
4 НГТУ, Новосибирск, Россия
Для успешного лечения онкологических заболеваний необходимы методы, при-
годные для ранней диагностики рака, прогноза ответа опухоли на терапию и выявления
рецидивов. При развитии опухолей выявлены изменения состава внеклеточных нукле-
иновых кислот, циркулирующих в крови и других биологических жидкостях (цирНК),
что делает перспективной разработку методов «жидкой биопсии» на основе цирНК-мар-
керов. Поиск маркерных микроРНК крови представляет значительный интерес,
поскольку многие микроРНК участвуют в трансформации клеток в качестве онкогенов
и онкосупрессоров, при этом циркулирующие микроРНК (цир-микроРНК) стабильны
в биологических жидкостях при получении образцов, их хранении и обработке.
Для создания высокоточных диагностических тестов проведено сравнительное
исследование цир-микроРНК больных раком предстательной железы (РПЖ), раком
легкого (РЛ) и здоровых доноров с использованием масштабного анализа на основе
количественной ПЦР на платформе miRCURY LNA miRNA qPCR Panels (Exiqon,
Дания). Масштабный сравнительный анализ экспрессии 84-х микроРНК в моче боль-
ных РПЖ и пациентов с доброкачественной гиперплазией предстательной железы
(ДГПЖ) относительно здоровых доноров позволил выбрать маркерные микроРНК,
определяемые в двух фракциях мочи (супернатант и суммарные микровезикулы мочи).
С использованием этих микроРНК разработаны диагностические системы, позво-
ляющие поставить диагноз РПЖ с суммарной точностью 97%. Для выявления
маркерных микроРНК при РЛ проведено масштабное исследование 179-ти микроРНК
в плазме крови онкологических больных и здоровых доноров. Регрессионный анализ
данных показал, что определение 10-ти парных отношений, составленных из 14-ти
микроРНК, позволяет диагностировать больных РЛ с высокой эффективностью
(AUC=0.979). Таким образом, в настоящей работе показана эффективность высоко-
производительных технологий анализа нуклеиновых кислот для поиска диагности-
ческих маркеров рака. Верификация выявленных маркеров проводится методом
количественной ПЦР в расширенных группах доноров.
Работа поддержана грантом РНФ № 16-15-00124.
Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
86
Do'stlaringiz bilan baham: |