Изменения экспрессии генов, индуцируемые аналогами днРНК
GAS5
в клетках человека
Семенов Д.В.
1
, Савиновская Ю.И.
1
, Зинченко Н.Д.
1,2
, Савельева А.В.
1
, Нуштаева А.А.
1
,
Коваль О.А.
1,2
, Немудрая А.А.
1
, Кулигина Е.В.
1
, Степанов Г.А.
1
, Рихтер В.А.
1
1
ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН,
Новосибирск, Россия
2
ФГАОУ ВО Новосибирский национальный исследовательский государственный
университет, НГУ, Новосибирск, Россия
Ген
GAS5
человека транскрибируется РНК-полимеразой II с образованием
пре-днРНК, интроны которой процессируются с образованием 10 малых ядрыш-
ковых C/D-бокс РНК, а экзоны формируют набор полиаденилированых транскриптов,
биологические функции которых в настоящее время не установлены. Известно, что
понижение уровня зрелых полиаденилированных изоформ днРНК
GAS5
в клетках
злокачественных опухолей человека является индикатором прогрессии и метастазиро-
вания опухоли. Повышение уровня днРНК
GAS5
связано с подавлением пролиферации,
снижением жизнеспособности и апоптотической гибелью онкотрансформировнных
клеток в культуре. Поэтому днРНК
GAS5
является перспективным объектом для разра-
ботки средств диагностики и терапии онкологических заболеваний человека.
Для того, чтобы описать механизм действия днРНК
GAS5
в данной работе были
сконструированы и получены векторы, экспрессирующие изоформы днРНК
GAS5
в клетках человека. Установлено, что трансфекция фибробластов HEK293, аденокар-
циномы легкого A549 и аденокарциномы молочной железы человека полученными
векторами сопровождается эктопической эксперссией изоформ днРНК
GAS5
. Эктопи-
ческая экспрессия изоформ днРНК
GAS5
сопровождалась снижением жизнеспособ-
ности клеток человека.
Полнотранскриптомным анализом дифференциальной экспрессии генов было
установлено, что трансфекция клеток A549, MCF-7 и HEK293
GAS5
-экспрессиру-
ющими плазмидами сопровождается ранними (8 ч) изменениями уровней наборов
мРНК. При этом наборы дифференциально экспрессируемых мРНК существенно
различались для разных культур клеток человека. Биоинформационный анализ данных
полнотранскриптомного исследования позволил выявить общие характеристики
наборов дифференциально экспрессируемых генов, такие как: контроль транскрип-
ционными факторами семейства MAX; участие в воспалительных процессах, опосре-
дованных хемокинами и цитокинами; а также участие в апоптотических процессах.
В совокупности полученные данные позволяют предложить новый механизм регуляции
экспрессии генов с участием днРНК
GAS5
.
Работа была поддержана грантом РНФ № 16-14-10284 и проектом базового бюджетного
финансирования Минобрнауки РФ № 0245-2019-0001.
Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
55
Do'stlaringiz bilan baham: |