Reja: proteomika tushunchalari; Proteomikaning usullari va asosiy vazifalari; Proteomik tahlil usullari; Proteomika

REJA:

1. PROTEOMIKA tushunchalari;

2. Proteomikaning usullari va asosiy vazifalari;
3. Proteomik tahlil usullari;

Proteomika- oqsillarning tuzilishi va funktsiyasini o'rganadigan, shuningdek tirik hujayra ichidagi oqsil-oqsil o'zaro ta'sirining murakkab tarmog'ini tahlil qiladigan fan.
Proteomikaning asosiy savollarini quyidagicha shakllantirish mumkin: Har bir alohida oqsilning tuzilishi va xususiyatlari qanday? Tananing har bir o'ziga xos hujayrasida oqsillar to'plami nima? Ko'p va xilma -xil oqsillar hujayra ichida qanday o'zaro ta'sir qiladi? Ko'p komponentli tarmoq tugunlarida qanday oqsillar joylashgan va bu tarmoqning har bir oqsil komponenti faoliyatini tartibga solish qanday amalga oshiriladi? Afsuski, bu savollarga hali to'liq javob yo'q. Ko'pgina organizmlarning genomlari hal qilingan va ko'plab genlarning nukleotidlar ketma -ketligi tasvirlangan bo'lsa -da, ko'p sonli genlarning (va shuning uchun ular kodlaydigan oqsillarning) vazifalari noma'lum bo'lib qolmoqda.
Proteomikaning usullari va asosiy vazifalari
Oqsillarning tuzilishini o'rganishda ketma -ketlik usullari muhim rol o'ynaydi; oqsil tarkibidagi aminokislotalar ketma -ketligini aniqlash usullari (oqsilning birlamchi tuzilishi). Protein tuzilishida (oqsilning ikkilamchi va uchinchi tuzilishi) aminokislotalarning fazoviy joylashishini o'rganish uchun spektroskopik usullar (dumaloq dikroizm usuli va infraqizil spektroskopiya usuli va boshqalar) keng qo'llaniladi. NMR usullari va rentgen strukturaviy tahlillari oqsilning uchinchi tuzilishi haqida eng to'liq va batafsil ma'lumotni beradi va 1-3 Å gacha bo'lgan aniqlikdagi oqsil tuzilishini o'rganishga imkon beradi. Proteinning uchinchi darajali tuzilishi haqidagi ma'lumotlar ma'lum bir oqsil bajaradigan vazifalar haqida muhim ma'lumot beradi va ko'pincha shunga o'xshash funktsiyali oqsillar fazoviy tuzilishga o'xshashdir. Ultrasentrifugatsiya va gel filtrlash usullari oqsilning to'rtlamchi tuzilishini o'rganishga imkon beradi. Ta'riflangan usullarning kombinatsiyasidan foydalanish har bir oqsilning tuzilishi va xususiyatlarini batafsil tavsiflashga va shu tariqa proteomikaning asosiy savollaridan biriga javob olishga imkon beradi.
Proteomikaning yana bir muhim muammosi - bu ma'lum bir hujayrada ifoda etilgan barcha oqsillarning to'liq tarkibini tavsiflash. Bu muammoni hal qilish uchun mass-spektrometriya bilan biriktirilgan ikki o'lchovli (2D) gel elektroforez usuli qo'llaniladi. 2D elektroforez hujayrani tashkil etuvchi oqsillarning ko'pini ajratishga imkon beradi va mass -spektrometriya usuli oqsillarning har birini o'ziga xos tarzda aniqlash imkonini beradi. Bunday tadqiqotning maqsadi - normal sharoitda va turli omillar ta'sirida yoki turli patologik sharoitlarda oqsillarning ifodasini solishtirish. Maxsus oqsillarning (marker oqsillari) ifoda darajasini aniqlash onkologik, neyrodejenerativ va boshqa kasalliklarni tashxislashda ishlatilishi mumkin.
Hujayrada sodir bo'layotgan jarayonlarni tushunish uchun ma'lum sharoitlarda ifoda etilgan oqsillarning tabiati va majmuini bilish etarli emas. Qaysi oqsillar bir -biri bilan o'zaro ta'sir qiladi va bunday o'zaro ta'sirlar sherik oqsillarning tuzilishi va xususiyatlariga qanday ta'sir qiladi, degan savolni o'rganish juda muhim. Proteinlarning o'zaro ta'sirini tahlil qilish uchun birgalikda immunopresipitatsiya usullari (oqsil-antijeni va uning sherigi oqsillarini immun sorbentda sorbtsiyasi), so'ngra sherik oqsillarni aniqlash uchun mass-spektrometriya, ikkita gibrid usul, fag-displey va boshqalardan foydalaniladi. boshqalar Hamkor oqsillarni aniqlash o'rganilayotgan oqsilning ishlash mexanizmi haqida muhim ma'lumot berishi mumkin, oqsil-oqsil o'zaro ta'sirini aniqlash esa hujayralar ichida sodir bo'ladigan turli jarayonlarni tasvirlashga imkon beradi.