Сборник содержит материалы научной мультиконференции «Биотех- нология медицине будущего»

Использование масс-спектрометрического анализа для идентификации 
структурных белков потенциально терапевтических бактериофагов
Байков И.К.
1
, Зеленцова Е.А.
2
, Морозова В.В.
1
, Ушакова Т.А.
1
, Боковая О.В.
1
, 
Фофанов М.В.
1
, Тикунова Н.В.
1
.
1
Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского 
отделения Российской академии наук, Новосибирск, Россия 
2
Институт «Международный томографический центр» Сибирского отделения 
Российской академии наук, Новосибирск, Россия
Baykov I.K.
1
, Zelentsova E.A.
2
, Morozova V.V.
1
, Ushakova T.A.
1
, Bokovaya O.V.
1
,
Fofanov M.V.
1
, Tikunova N.V.
1
.
1
Institute of Сhemical Biology аnd Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Russia 
2
International Tomography Center SB RAS, Novosibirsk, Russia
При исследовании бактериофагов возникает необходимость установить функцию 
той или иной рамки считывания, полученной при секвенировании генома бактериофага. 
При отсутствии выраженной гомологии с известными последовательностями сделать 
это на основе одной лишь последовательности гена затруднительно. В случае струк-
турных белков масс-спектрометрический анализ является мощным методом, который 
позволяет сопоставить фрагмент генома с белковым продуктом. В данной работе были 
проанализированы пять потенциально-терапевтических бактериофагов: PM85, PM135, 
KP8, KP179 и SA57, поражающих некоторые штаммы P. mirabilis, K. pneumoniae и S. au- 
reus. Было установлено несколько белков, пропущенных при аннотации генома, в част- 
ности небольшой белок бактериофага PM135, предположительно являющийся декори-
рующим белком. Для некоторых рамок считывания на основе масс-спектрометри-
ческих данных была уточнена позиция стартового кодона. Ряд рамок считывания,
не имеющих гомологии с известными последовательностями, был отнесен к генам 
структурных белков с неустановленной функцией. Анализ последовательности амино-
кислотных остатков некоторых структурных белков позволил установить ряд струк-
турных особенностей.
Исследование было выполнено при поддержке проекта РФФИ 18-34-00636.

---

Всероссийская мультиконференция с международным участием «Биотехнология – медицине будущего»
29 июня - 2 июля 2019 г., г. Новосибирск, Россия
147