1.3. Компьютерное молекулярное моделирование
Компьютерное моделирование требует абстрагирования от
конкретной природы явлений, построения сначала качественной, а
затем и количественной модели. За этим следует проведение серии
вычислительных экспериментов на компьютере, интерпретация
результатов, сопоставление результатов моделирования с поведением
исследуемого объекта, последующее уточнение модели и т.д.
Еще в XIX веке ученые пришли к заключению, что увидеть
молекулы нельзя, поскольку размеры атомов значительно меньше
длины волны видимого света [5]. А ведь знание пространственной
структуры молекул позволило бы понять и спрогнозировать
протекание тех или иных физико-химических процессов, объяснить
свойства исследуемого вещества или даже получить вещество с
заданными полезными свойствами. Все же информацию о строении
молекул получить можно [1, 3, 14, 16, 18, 24, 77].
Для определения молекулярной структуры в кристаллической
фазе вещества в настоящее время широко используются методы
рентгеноструктурного анализа, нейтронного рассеяния, ядерного
13
магнитного резонанса (ЯМР) [76]. Но для молекул, состоящих из
большого числа атомов и находящихся в жидкой фазе или растворе,
применим только метод ЯМР, но и он не дает полного представления
о внутримолекулярной подвижности больших молекул. Поэтому
открытие новых материалов, имеющих требующиеся физико-
химические свойства, всегда являлось конечной целью ученого-
экспериментатора и было долгое время возможно лишь на уровне
интуиции, совмещенной с большим опытом исследования. В
настоящее
время
благодаря
стремительному
развитию
вычислительной техники приблизиться к заветной цели позволяют
методы компьютерного моделирования [98, 71, 46, 48, 70, 68].
Во многих случаях компьютерное моделирование оказывается
единственным способом получения детальных количественных
сведений о поведении сложных молекулярных систем, известных в
природе или, что важнее, планируемых к созданию. Сопоставляя
результаты вычислений с опытными данными, можно определить
наиболее важные факторы и закономерности проявлений свойств
реальных молекул. С другой стороны, компьютерное моделирование
часто выступает в качестве связующего звена между теорией и
физическим экспериментом. Это особенно важно, когда в теории не
удается получить точного аналитического решения сложных систем
уравнений,
описывающих
поведение
молекул.
Наконец,
компьютерное моделирование во многих случаях является мощным
средством повышения информативности самих экспериментальных
методов исследования молекул.
14
Do'stlaringiz bilan baham: |