Генетика, геномика ва биотехнологиянинг замонавий муаммолари

МОЛЕКУЛЯРНОЕ КАРТИРОВАНИЕ ГЕНОВ PHYA, PHYB
И HY5 У ХЛОПЧАТНИКА 
 
Кушанов Ф.Н., Буриев З.Т., Имамходжаева А.С., Абдурахмонов И.Ю. 
Центр Геномики и биоинформатики АН РУз 
111215, Узбекистан, Ташкентская обл., Кибрайский р-он, ул. Университетская, д. 2 
[e-mail] 
Изменения в морфологии растений, происходящие под действием 
светового излучения, называется фотоморфогенезом, и они регулируются 
семейством генов фитохрома. Гены фитохромов и их роль широко изучается у 
сельскохозяйственных культур. Так, Абдурахмонов И.Ю. с соавт. (2010) 
проклонировали и секвенировали гены фитохромов 
PHYA, PHYB, PHY, 
и
 PHYE
у хлопчатника [1]. В продолжение этих исследований в настоящей работе 
представлены результаты молекулярного картирования генов 
PHYA, PHYB
и 
HY5
у хлопчатника с использованием ген-специфических CAPs (cleaved 
amplified polymorphisms) маркеров.
 
В исследовании пользовалась популяция рекомбинантно-инбредных линий 
(РИЛ) хлопчатника, полученных от межвидового скрещивания сорта TM-1 с 

---

Материалы конференции «Современные проблемы генетики, геномики и биотехнологии», 18 мая 2016г. 
25 
сортом 3-79. РИЛ популяция была любезно предоставлена нам нашим 
американским партнёром доктором John Yu.
По результатам тестирования родительских линий с помощью 10-ти ген-
специфичных пар-праймеров были отобраны четыре наиболее информа-тивные, 
которые позволили выявить четкий полиморфизм расщепленных фрагментов 
ДНК исследуемых генотипов. Продукты амплификации этих ген-специфичных 
пары 
PHYA1
CAPs, PHYB dCAPs, PHYB dCAPs -2 и G.h. HY52 dCAPs маркеров, 
были обработаны эндонуклеазой рестрикции Dpn II, Alu I, Hpa I и Hinf I, 
соответственно. Эти отобранные CAPs маркеры были использованы для 
генотипирования РИЛ популяции и последующего определения хромосом-ного 
местоположения генов 
PHYA, PHYB
и 
HY5
на генетической карте сцепления 
хлопчатника. Данные по генотипированию обрабатывали с помощью 
программы JoinMap 3.0. 
Наиболее детальная и полная карта хлопчатника разработана Yu с соавт
.
(2014) при использовании более 1825 SSR- маркеров [2]. В наших 
исследованиях для создания молекулярно-генетической карты сцепления 
популяции РИЛ в дополнение к 279 ранее отобранным SSR-маркерам были 
использованы еще четыре специфичных для генов 
PHYA
, 
PHYB
и 
HY5
CAPs - 
маркеров (пороговое значение LOD=6 и выше). Размер сконструированной нами 
карты составил 394,3 сМ со средним расстоянием между двумя маркерами в 
1,39 сМ. По результатам исследований, гены 
PHYA
, 
PHYB
и 
HY5
располагались 
на хромосомах 10, 11 и 24, соответственно. В данных хромосомах, согласно Yu 
с соавт
.
(2014) идентифицируются множество локусов количественных 
признаков (QTL), ассоциированных с разными параметрами волокна и 
хозяйственно-ценными показателями хлопчатника [2]. В наших исследованиях 
также обнаружено множество QTL, сцепленных с данными свойствами 
хлопчатника с LOD-балом 3,0 и ниже.
Таким образом, нами проведено молекулярное картирование генов 
PHYA
, 
PHYB
и 
HY5
у хлопчатника. При создании карты сцепления и идентификации 
хромосомной локализации локусов микросаттелитных и САРs - маркеров мы 
пользовались литературными данными, опубликован-ными по данной проблеме 

---

Материалы конференции «Современные проблемы генетики, геномики и биотехнологии», 18 мая 2016г. 
26 
до сегодняшнего дня. Карта сцепления, сконструированная нами, имела 
незначительные отличия от карты Yu с соавт. (2014) [2]. Эти различия, по-
видимому, явились следствием внесения в карту сцепления хлопчатника новых 
маркеров (генов 
PHYA
, 
PHYB
и 
HY5
), идентифицированных нами.
Список использованной литературы 
1.
Abdurakhmonov I.Y., Buriev Z.T., Saha S., Logan-Young C.J., Abdukarimov A., 
Pepper A.E. Duplication, divergence and persistence in the Phytochrome 
photoreceptor gene family of cottons (Gossypium spp.). // BMC Plant Biol. 2010 
y. 10:119. 
2.
Yu J.Z, Ulloa M., Hoffman S.M., Kohel R.J., Pepper A.E., Fang D.D., Percy 
R.G., Burke J.J. Mapping genomic loci for cotton plant architecture, yield 
components, and fiber properties in an interspecific (Gossypium hirsutum L. × G. 
barbadense L.) RIL population // Molecular Genetics and Genomics. 2014 y. 
Volume 289, Issue 6, pp 1347-1367.