Oqsil molekulalarida gomologik domenlarni izlash

-PDB-oqsil malumotlar bazasi
- SWISS-PROT & TrEMBL - annotated protein sequence database and computer annotated supplement
- PIR - Protein Information Resource


Ketma-ketliklarni taqqoslash uchun mo’ljallangan dastur ta’minotlari:

• 
  T-COFFEE – Turli ketma-ketliklarni bir vaqtning o’zida taqqoslash.
  
• 
  VISTA – Ikki genom ketma-ketliklaridagi farqlarni taqqoslash.
  
• 
  BAliBASE – Ketma-ketliklarni taqqoslash asosida baholash.
  

Oqsil domenlari klassifikatsiyasi:

• 
  InterPro - integration of Pfam, PRINTS, PROSITE, SWISS-PROT + TrEMBL
  
• 
  SMART - analysis of domains in proteins
  
• 
  ProDom - protein domain database