ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ОДНОКОПИЙНЫХ ГЕНОВ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ФИТОПАТОГЕНОВ
РОДА FUSARIUM
В УЗБЕКИСТАНЕ
Раджапов Ф., Эгамбердиев Ш., Салахутдинов И., Абдуллаев А., Глухова Л.,
Адылова О., Муллаохунов Б., Абдурахмонов И.
Центр геномики и биоинформатики АН РУз, Минсельводхоз, ассоциации «Узпахтасаноат»
Введение.
С развитием молекулярных технологий, открытия технологии ДНК-маркеров стало
возможным более детальное изучение геномов фитопатогенов. Первоначально, идентификация грибных
фитопатогенов базировалась исключительно на их морфологических характеристиках. Тем не менее, для
ряда родов грибов, точное определение видовой принадлежности, а тем более идентификация подвидов
(форма, раса) сопряжены с определенными трудностями, связанными с перекрыванием близко-видовых и
морфологических признаков, а также с длительностью процедуры микробиологической дифференциации
этих фитопатогенов. Среди известных методов, применяющиеся для исследования этих фитопатогенов,
является белковые маркеры (изозимы) [1], RFLPs (Restriction Fragment Length Polymorphisms -
Полиморфизм длин рестрикционых фрагментов) [2], AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism -
Полиморфизм длины амплифицированного фрагмента) [3], RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA -
Произвольно амплифицированная полиморфная ДНК) [4].
Для анализа этих патогенов указанные методы были достаточно информативными, однако
некоторые из них требовали существенных затрат, как временных, так и финансовых, или были трудны
для интерпретации данных. Открытие однокопийных генов (фактора элонгации, нитратредуктазы, гена
малой митохондриальной субъединицы и др.) позволило разработать новые, более чувствительные
методы, требующие незначительные количества геномной ДНК, и позволяющие осуществлять быструю
идентификацию и дифференциацию грибов на генетическом уровне, поскольку эти гены менее
подвержены влиянию окружающей среды, чем морфологические признаки [5].
На сегодняшний день за период 2007-2011 годы по Узбекистану в Ферганской долине поражение
средневолокнистого хлопчатника патогенами рода Fusarium достигало 68%. В частности, в
Шахристанском районе Андижанской области сорт С-6524 поражался до 32,5%, в Олтинкульском районе
Андижанской области до 30%, этот же сорт в районе Багдад Ферганской долины поражался до 64,2%, сорт
Наманган-77 на некоторых полевых участках Наманганской области поражался до 68% [6] Что привело к
существенным финансовым потерям и нанеся тем самым огромный экономический ущерб. Поэтому
особой важной проблемой является быстрая и точная идентификация патогенных грибов на молекулярном
уровне. Целью данной работы является показать: точность и быстроту идентификации внутривидовой и
расовой принадлежности этих патогенов с использованием однокопийных генов.
Do'stlaringiz bilan baham: |