4. Molekulyar dinamika nima Chem3D da molekulyar mexanika va molekulyar dinamika Molekulyar mexanika va moiekuiyar dinamikani Chem3D dasturida hisoblasli uchun dastur menyusida MM2 bandi bor. Unda esa molekulyar sistema geometriyasini maqbullashtirish uchun Minimize Energy va moiekuiyar dinamika algoritmini ishga tushurish uchun Molecular Dynamics buyruqlari bor
5. Kuch maydonlari nima? Agar fazoning birorta bo’lagiga moddiy nuqtaga tasir qilayotgan kuch shu nuqtaning kordinatalariga bog’liq holda o’zgaruvchi bo’lsa yani u holda fazoning bunday bo’lagiga kuch maydoni deyiladi.
6. Molekulyar mexanika usullari nima uchun empirik usullar deyiladi? Molekulyar mexanika va moiekuiyar dinamikani Chem3D
dasturida hisoblasli uchun dastur menyusida MM2 bandi bor.
Unda esa molekulyar sistema geometriyasini maqbullashtirish
uchun Minimize Energy va moiekuiyar dinamika algoritmini ishga
tushurish uchun Molecular Dynamics buyruqlari bor
7. Yarim empirik hisoblash usullari nima Noempirik {ab initio) usullar kvant kimyoning aniq hisoblash usullari bolishiga qaramasdan ularni keng qo‘llanilishiga to‘siqlik qiladigan bir qator quyidagi muhim kamchiliklar mavjud: « hisoblashlarning n'^ ga (bunda n ~ bazis atom orbitaîlarining soni) oshadigan hisob vaqtiga bogliq bolgan qiyinchiligi, n~200“ 250 tadan superkompyuterlardan foydalanishni talab qihshi (n~200~250 kengaytirilgan bazis qo‘lianiiganda atomlar soni N “ 10” 20 ga mos keladi); ® hozirgi kunga qadar korreiyatsion energiyani to liq hisobga olish muammosi hal qilingan emas. Chunki ba’zi hollarda korreiyatsion energiya molekula to liq energlyasiga (Etoi) nisbatan kichik bo‘Hshiga qaramasdan mustahkam kovalent bog‘ energiyasiga mos keladi. Masalan, Ä F molekulasi uchun kelishilgan maydon (KM) usulining Hartri-Fok chegarasida (HFCh) hisoblash! quyidagi xarakteristikalarni beradi:
yarimeBipirik usullar chegaralanganJigmmg asosi uning uslunliWari bilan bir ildizga ega. Bunday o^ziga xoslik barcha kvant kimyoviy hisobiash usiiUariga xos va «hisoblash aniqligi ~ hisoblash teziigi»- parametrlaridagi maqbul nisbatni tanlay olmaslik bilan bog‘langan. Barcha yarimempirik usullar uchun quyidagi kamchiliklar xos: • yarimempirik usullarda hisoblashlaming aniqligi kengaytirilgan bazis (bieksponensial yoki undan ham murakkab) ab initio usuliariga qaraganda ancha past; • obyektlar atrofi, jumladan ularning fizik xarakteristikaiar to‘plami berilgan yarimempirik usullarda qoniqarli aniqlikda o‘rganilishi mumkin boiishiga qaramasdan ularda qollaniladigan parametrlashtirish sxemalari o‘ziga xos chegaralanishga ega. Yarimempirik usullar odatda organik moddalarni hisoblash uchun ishiatiladi. Metallorganik, jumladan kompleks birikmalar ishlatilganda parametrlashtirishning maxsus sxemasi talab etiladi.