Iqtisodiyoti 14 nashriyalar 275 iqtisodiyoti profilga qaring 102

Kalit so'zlar: hisoblash, statistik, nazoratsiz o'rganish, nazorat ostida o'rganish, yo'l
Bular nazoratsiz ta'lim usullari, nazorat ostida o'qitish usullari, yo'l tahlili
olish uchun turli xil ma'lumotlarni tahlil qilish usullari yoki ularning kombinatsiyasidan foydalanish kerak
spektrometriya (MS). Bundan tashqari, tadqiqotning turli maqsadlari va dizaynlariga asoslanib, u bo'lishi mumkin
metabolomikadagi misollar bilan metabolomik ma'lumotlar bo'yicha amalga oshirilishi mumkin bo'lgan tahlil turlari.
biz ushbu sharhda muhokama qilgan tamoyillar va vositalarni umumlashtirish.
ANTRACT
Metabolomik ma'lumotlarni tahlil qilish uchun keng tarqalgan bo'lib qo'llaniladigan hisoblash va statistik usullar.
aniq va keng qamrovli natija. Ushbu sharhda biz umumiy ko'rinishni taqdim etish niyatidamiz
vaqt kursi metabolomikasi ma'lumotlarining usullari va tahlili. Jadvalni taqdim etish bilan yakunlaymiz
Metabolomik ma'lumotlarni ishlab chiqaruvchi ikkita asosiy eksperimental usullarning tamoyillarini tavsiflang:
organizmda sodir bo'layotgan metabolik holat va biokimyoviy hodisalarning tasviri
ma'lumotlar bazalari va metabolomik tadqiqotlar uchun mavjud resurslar. Ikkinchi bo'lim qisqacha bo'ladi
Biologik namunalardagi minglab metabolitlarni tahlil qilish va tahlil qilish orqali u bir butunlikni ta'minlaydi
tahlil qilish, vaqt kursi ma'lumotlari
2
Machine Translated by Google

---

KIRISH
Omiks - bu biomolekulalar yig'indisini o'rganadigan fan. Xuddi genomika to'liq tahlil bo'lganidek
Spasik, Oliver 2005).
metabolom ko'p miqdordagi birikmalarni, shu jumladan aminokislotalar, lipidlar,
Broadhurst, Wilson, Wishart 2012). Metabolomni o'rganish uchun bir nechta yondashuvlar mavjud,
kasalliklar xavfini tashxislash, kuzatish yoki bashorat qilish uchun ishlatilishi mumkin bo'lgan xususiyatlar (Xia,
organizmdagi metabolitlar yoki metabolomlar (Griffin, Shockcor 2004; Oliver 2002). The
metabolomika umumiy ma'lumotni olish uchun metabolitlarning katta diapazoni bo'yicha miqdoriy ma'lumotlarni to'playdi
Krishnan 2009).
2004). Maqsadli tahlil oz miqdordagi ma'lum metabolitlarning miqdorini aniqlashga qaratilgan.
ularning darajalari biologik tizimlarning genetik yoki
organik kislotalar yoki nukleotidlar. Metabolitlar kimyoviy reaksiyalarda ishlatiladi yoki ishlab chiqariladi va
maqsadli tahlil, metabolik profil va metabolik barmoq izlari (Griffin, Shockcor
hujayradan tashqari metabolitlarga e'tibor qaratadi. Shaxsiy metabolitlarni o'rganish o'rniga,
transkriptom va proteomaga qaraganda sistematik buzilishlarga (Kell, Braun, Davey, Dann,
ekologik o'zgarishlar. Shu sababli, metabolomning sezgirligi ko'proq
Metabolik profillash noma'lum metabolitlarning kattaroq to'plamiga qaratilgan. Metabolik barmoq izlari
gen transkriptlarini har tomonlama tahlil qilish, metabolomika to'liq to'plamini tahlil qilishdir
metabolitlar o'lchanadigan biologik bo'lgan biomarkerlarni topishga olib kelishi mumkin
Hujayra jarayonlari reaktsiyalar uchun maxsus metabolitlarni o'z ichiga oladi. Bularni o'rganish va yozib olish
genom, proteomika oqsillarni har tomonlama tahlil qilish, transkriptomika esa
muayyan holat bilan bog'liq metabolizmni tushunish (Kaddurah-Daouk,
3
Machine Translated by Google

---

kasalliklarni davolash uchun dorilar, shu jumladan saraton (Griffin, Shockcor 2004), yurak-qon tomir
2010). Metabolomika minimal invaziv protsedura bo'lishi mumkin, chunki ma'lumotlar to'planishi mumkin
Metabolomikaning g'oyasi odamlar shirinlikdan foydalangandan beri mavjud
Metabolomikaga oid birinchi ilmiy maqola (Pauling, Robinson, Teranishi, Cary 1971). so'z
1971 yilda yozilgan "Gaz-suyuqlik bo'linish xromatografiyasi orqali siydik bug'i va nafasi".
2012) va kistik fibroz (Wetmore, Joseloff, Pilewski, Li, Lawton, Mitchell, Milburn va boshqalar.
genetik modifikatsiya" (Nicholson, Lindon, Xolms 1999). Griffin, o'z qog'ozida (Griffin,
kontekstga bog'liq bo'lgan metabolitlarning / past molekulyar og'irlikdagi oraliq mahsulotlarning to'liq to'plami;
organizm tomonidan sintezlanadi (Oliver, Winson, Kell, Baganz 1998). Nikolson va boshqalar. birinchi marta foydalangan
hayvonlarni o'rganishda hujayra jarayonlarini tushunish va genlarning funktsiyasini dekodlash uchun o'simliklar
plazma, siydik, miya omurilik suyuqligi (CSF) yoki to'qimalar ekstrakti. Bundan o'rganishda ham foydalanilgan
"Metabolom" Olivier va boshqalar tomonidan yaratilgan. 1998 yilda va metabolitlar to'plami sifatida belgilangan
tirik tizimlarning patofizyolojik stimullarga dinamik multiparametrik metabolik reaktsiyasi yoki
Metabolomika orqali biomarkerlarni aniqlash diagnostika, oldini olish va ishlab chiqarishga yordam beradi
Uchikata, Kobayashi, Matsubara, Fukusaki 2013).
biomarkerlarni kashf qilish, oziq-ovqat mahsulotlarini tadqiq qilish va o'simlik dori vositalarida (Putri, Nakayama, Matsuda,
1999 yilda nashr etilgan metabonomika so'zi "miqdoriy o'lchov" degan ma'noni anglatadi
Daouk, Krishnan 2009), diabet (Vang-Sattler, Yu, Herder, Messias, Floegel, He, Heim va boshqalar.
individual metabolitlarni aniqlash imkonini berdi. Robinson va Paulingning “Miqdoriy tahlil
diabetda yuqori glyukozani aniqlash uchun siydik. 1960-yillarda xromatografik ajratish texnikasi
kasalliklar (Griffin, Aterton, Shockcor, Atzori 2011), markaziy asab tizimi kasalliklari (Kaddurah)
Shockcor 2004), Oliver tomonidan berilgan metabolomikaning eng yaxshi ta'riflaridan biri bu "
4
Machine Translated by Google

---

yoki organizm".
Springer tomonidan nashr etilgan Metabolomiks jurnali . Jamiyat endi Twitter tasmasiga ega
ma'lumotlar Inson Metabolome ma'lumotlar bazasida saqlanadi, u 2007 yilda birinchi loyihasini ishlab chiqdi
Metabolomikani aniqlash va tahlil qilish texnologiyalari moslashtirildi va takomillashtirildi
2009 yil, 2002 yildagi 50 dan kamroq (Griffiths, Koal, Wang, Kohl, Enot, Deigner 2010). Sifatida
hayot fanlarida metabolomikani tushunish. Metabolomika jamiyati keyinchalik a
Metabolomik ma'lumotlarni aniqlash va tahlil qilish. Metabolitlar ma'lumotlar bazalarida topilgan ma'lumotlar mavjud
Metabolomik ma'lumotlarni o'z ichiga olgan ko'plab ma'lumotlar bazalari mavjud va ularning har biri boshqacha
xalqaro konferensiya va Metabolomika jurnali. METLIN, birinchi metabolomika
(@MetabolomicsSoc), Metabolomics jamiyati yangiliklarini taqdim etadi, uning yillik
metabolomikadan foydalanish o'sishda davom etishi kutilmoqda.
Metabolik ma'lumotlar bazalari ko'plab metabolitlarni tadqiqotchilarga osonlikcha yordam beradigan tarzda tartibga solishdir
hujayra, to'qima, organning fiziologiyasi, rivojlanish yoki patologik holatiga qarab o'zgarib turadi
inson to'qimalari va biosuyuqliklaridagi barcha metabolitlarni toping va kataloglang. Bu metabolit
ma'lumotlar bazasi, shuningdek, 2004 yilda tashkil etilgan. 2005 yilda Inson Metabolome loyihasi ishga tushirildi.
NMR va MS spektrlaridan metabolik yo'llargacha bo'lgan ma'lumotlar. maqsadi
2004-yilda Metabolomika jamiyati o'sishni rag'batlantirish, foydalanish va
Metabolomikaga oid maqolalar soni ortib bormoqda. 800 dan ortiq maqolalar yozilgan
(Wishart, Jewison, Guo, Wilson, Knox, Liu, Djoumbou va boshq. 2013). So'nggi yillarda raqam
So'nggi yillarda doimiy ravishda yangilanib bordi, chunki metabolomik tadqiqotlar kengayib bormoqda