Asosiy usullar
Kiritish
MATLAB
Dispersiyani
tahlil
qilish
Agar ob'ektlar ichida bir nechta
o'lchovlar mavjud bo'lsa, ANOVA
usuli (turli vaqt nuqtalarida
o'lchanadi)
(ASCA)
Ko'p o'zgaruvchanlik uchun ANOVA
Asosiy biologik
jarayonning dinamik
xususiyatini eng
yaxshi tavsiflovchi model
Oqim taqsimotini toping
Tarmoq kinetikasining
simulyatsiya natijalari
chora-tadbirlar
Vaqt kursi
(masalan, silliqlash splinelar
aralash effektlar modeli)
(metabolik profillar) va ularning
farqini miqdoriy jihatdan aniqlang
modellashtirish
ba'zi cheklovlarga asoslangan
reaktsiyani maksimallashtirish /
minimallashtirish
Sinov
vaqtiga
bog'liq effektlar; turli
sub'ektlarning
metabolitlari uchun
vaqt profillarini
solishtiring
Ruxsat etilgan effektlar
ma'lumotlarni tahlil qilish
Metabolitlar
ma'lumotlarining
dinamik xususiyatini
(masalan, bioritm) modellashtiring
Maqsad
Metabolitlar reaktsiya
tarmoqlarining dinamik
harakatlarini simulyatsiya qilish
Ikki yoki undan ortiq berilgan omillar
Yagona oqim
taqsimoti
Dasturiy ta'minot
MS va NMR tepalik ro'yxati
yoki spektral qutilar
Submodellarning ballari
va yuklash uchastkalari,
vaqt profillari uchastkalari
R
Funktsional asoslangan usul
ARMA modeli)
Ilova
Oqim balansi tahlili
(ANOVA)
Chiqish
Kinetik reaksiya tarmoq modeli
Takrorlangan
Tahlil turi
Yo‘l, stexiometrik matritsa,
cheklovlar va maqsad funksiyasi
ANOVA
Yorliqli ma'lumotlar jadvallari
(sinfga a'zolik
ko'rsatkichlari): har bir satr
bir vaqtning o'zida bir mavzuning
kuzatuv qiymatini va har bir
ustun metabolitlar
kontsentratsiyasini
ifodalaydi.
javob
Metaboanalitik,
Egri chiziqlar to'plamini taxmin qilish
Yo'l, stoxiometrik matritsa,
kinetik parametr va tezlik
tenglamasi
Har bir metabolit uchun
vaqtga bog'liq
effektlarni sinovdan
o'tkazish natijalari,
vaqt profili chizmalari
ANOVA - bir vaqtning o'zida
komponentlar tahlili
Har bir metabolit uchun
guruhlar o'rtasidagi vaqt
profilidagi farqlarni
sinovdan o'tkazish
natijalari
Vaqt seriyalari modellari (masalan
Uzoq vaqt seriyalari ma'lumotlari
66
Machine Translated by Google
Dettling, Dudoit, Ellis va boshqalar. 2004), shu jumladan metabolik yo'llarni tahlil qilish uchun paketlar (Luo, Brouwer 2013; Zhang, Wiemann 2009).
a. Biz faqat metabolomikada tez-tez ishlatiladigan dasturiy ta'minot paketlari yoki veb-vositalari tanladik. b. MetaboAnalyst bu foydalanish uchun qulay veb-asoslangan vositadir
Young, Wishart 2009). c. Bioconductor R-da qurilgan va bioinformatika uchun ko'plab foydali paketlarni taqdim etgan (Gentleman, Carey, Bates, Bolstad,
metabolomikaning eng asosiy hisoblash va statistik usullarini qamrab oladi (Xia, Mandal, Sinelnikov, Broadhurst, Wishart 2012; Xia, Psychogios,
67
Nashrlar statistikasini koÿrish
Machine Translated by Google
Do'stlaringiz bilan baham: |