Genomika asoslari

Qo’shimchalar yordamida yondashish asoslari.
Xisoblash ishlarida algoritmlarning qo’llanilishi ketma-ketliklar takrorlanib kelganda yahshi natija olish imkonini bermaydi, chunki tekshirilishi kerak bo’lgan ketma-ketliklar soni sezilarli darajada ortadi. Bunday muammoni yechish uchun suffiksli shajara-qo’shimchalarga asoslangan algoritmlardan foydalaniladi. Ushbu yondashuvning afzalligi, xususan, takrorlashlar algoritmning ishlash vaqtini tejaydi, chunki takroriy ketma-ketliklar ushbu shajaradan tushirib yuboriladi. Olingan ketma-ketliklar sof shaklida, agar xato yoki almashtirishlar bo’lmasa masalan, Mpscan dasturi ishlatilganda, bunday yondashuv juda tez ishlaydi. Mavzuni mustahkamlash savollar: 1.Genomni xaritalash mohiyatini ochib bering? 2. Xaritalash turlarini ochib bering? 3. Genom xaritalash dasturlariga misollar keltiring?

GLOSSARIY:
O’zgaruvchanlik - bu organizmlarning atrof-muhit sharoitlari ta’sirida o’zgarishi va yangi belgilar va fazilatlarga ega bo’lish xususiyatidir. Bir nechta turlari mavjud:

1. 
   Modifikatsiya - atrof-muhit sharoitlari ta’siri ostida yuzaga keladi, shuning uchun u meros qilib olinmaydi
   
2. 
   Fenotipik (irsiy emas) - organizmlar turli xil omillar ta’sirida o’zlarining fenotiplarini o’zgartiradilar
   
3. 
   Genotipik o’zgaruvchanlik irsiy materialning o’zgarishi bilan bog’liq bo’lib, meros qilib olinadi
   

Allel (yoki allelik genlar) Shu joylashgan genlar tashkil lokusların homoloj xromosomalar va xuddi shu belgi rivojlantirish uchun muqobil variantlarni aniqlash.
Jinssiz ko’payish yangi shaxsning jinssiz somatik (tana) hujayralaridan rivojlanib borishi bilan tavsiflanadi. Jinssiz ko’payish bilan yangi organizm bir hujayradan yoki onaning ko’payish uchun ixtisoslanmagan bir necha hujayralaridan paydo bo’lishi mumkin.
Ko’plab protozoa (amyoba, yashil va boshqalar), bir hujayrali suv o’tlari odatdagi mitotik hujayralar bo’linishi bilan ko’payadi . Boshqa yagona, bir hujayrali turlari: Ba’zi quyi zamburug’lar, suv o’tlari (xlorella), protozoa bilan ifodalanadi sporulation . Ko’p hujayrali organizmlar ham sporulyatsiyaga qodir: ularning sporalari ko’pincha maxsus hujayralarda yoki organlarda - sporangiyada hosil bo’ladi 
Genotip - organizmning barcha genlarining umumiyligi.
Farq bo’lmagan shaxslar genotip belgilansin fenotip , deb atalmish tahlil o’tish ishlatiladi. Bunday holda, genotipini aniqlash kerak bo’lgan shaxs, retsessiv belgi uchun individual homozigot bilan kesishadi.