Innovatsiyalarni boshqarish funktsiyalarining ikkita guruhini ajratish mumkin: asosiy va yordamchi. Asosiy (sub'ektiv) funktsiyalar innovatsiyalarni amalga oshirishning barcha turlari va har qanday sharoitlari uchun eng keng tarqalgan. Ular innovatsion faoliyatni boshqarish jarayonining asosiy bosqichlarining mazmunini aks ettiradi va barcha ierarxik darajadagi boshqaruv faoliyatining predmet sohalarini ajratib ko'rsatadi. Bularga quyidagilar kiradi: maqsadlarni belgilash, rejalashtirish, tashkil etish va nazorat qilish. Innovatsiyalarni boshqarishning yordamchi funktsiyalari korxonada asosiy sub'ektni boshqarish funktsiyalarini samarali amalga oshirishga yordam beradigan boshqaruv jarayonlari va vositalarini o'z ichiga oladi.
Bularga ijtimoiy-psixologik va texnologik funktsiyalar kiradi. Menejmentning ijtimoiy-psixologik funktsiyalari jamoadagi ishlab chiqarish munosabatlarining tabiati bilan bog'liq. Bu delegatsiya va motivatsiya. Delegatsiya - innovatsion jarayonlarni boshqarish bo'yicha ishlarni oqilona taqsimlashga va boshqaruv apparati xodimlari o'rtasida ularni amalga oshirish uchun javobgarlikka qaratilgan boshqaruv qarorlari majmui. Motivatsiya tashkilot xodimlarini ma'naviy va moddiy rag'batlantirish tizimini yaratishni, shuningdek, tashkilot xodimlarining kasbiy rivojlanishi va martaba imkoniyatlarini rejalashtirish, tashkil etish va ta'minlashni o'z ichiga oladi. Boshqaruvning texnologik funktsiyalari sub'ekt va ijtimoiy-psixologik funktsiyalarni amalga oshirish vositalari bo'lib, boshqaruv qarorlarini qabul qilish va aloqalarni amalga oshirishni (innovatsiyalarni muvaffaqiyatli ilgari surish uchun ma'lumotlarni tayyorlash, qabul qilish, qayta ishlash va uzatish) o'z ichiga oladi.
Bularga ijtimoiy-psixologik va texnologik funktsiyalar kiradi. Menejmentning ijtimoiy-psixologik funktsiyalari jamoadagi ishlab chiqarish munosabatlarining tabiati bilan bog'liq. Bu delegatsiya va motivatsiya. Delegatsiya - innovatsion jarayonlarni boshqarish bo'yicha ishlarni oqilona taqsimlashga va boshqaruv apparati xodimlari o'rtasida ularni amalga oshirish uchun javobgarlikka qaratilgan boshqaruv qarorlari majmui. Motivatsiya tashkilot xodimlarini ma'naviy va moddiy rag'batlantirish tizimini yaratishni, shuningdek, tashkilot xodimlarining kasbiy rivojlanishi va martaba imkoniyatlarini rejalashtirish, tashkil etish va ta'minlashni o'z ichiga oladi. Boshqaruvning texnologik funktsiyalari sub'ekt va ijtimoiy-psixologik funktsiyalarni amalga oshirish vositalari bo'lib, boshqaruv qarorlarini qabul qilish va aloqalarni amalga oshirishni (innovatsiyalarni muvaffaqiyatli ilgari surish uchun ma'lumotlarni tayyorlash, qabul qilish, qayta ishlash va uzatish) o'z ichiga oladi.