«биоинформатикага муқаддима»

 
Шимолий денгизда учровчи Siona intestinalis булути 
 
Яна бир мисол, сутэмизувчилар эндотелинлари ва илон токсинларининг 
структуравий гомологик оиласи. Структуралари бир бирига ўхшаш бўлишига қарамасдан 
уларнинг функционал ҳоссалари бир биридан фарқ қилади: бири қон –томир 
айланишининг фойдали бошқарувчилари бўлса, иккинчиси ҳаѐт учун хавфлидир. Бундан 
бирламчи структура модданинг ҳусусиятлари тўғрисида тўлиқ маълумотларни 
сақламаслиги маълум бўлади. Шунинг учун моддаларнинг фазовий структурасини 
тўлиқроқ ўрганиш мақсадга мувофиқ бўлади.
Эндотелин/токсинлар структур-гомологик оқсилларининг бирламчи структуралари 
 
Қуйида ЯМР-спектроскопия усули ѐрдамида аниқланган, мазкур оила вакиллари –
эндотелин-1 ва сарафотоксин S6.нинг фазовий структураси келтирилган. Расмда улар 
шундай қайрилганки, бунда фазовий гомологияга максимал яқинлаштирилади. Аммо ҳар 
қанча айлантириб кўрилса ҳам уларнинг тўлиқ гомологиясига эришиб бўлмайди. Бирлмчи 
структураси деярли бир хил бўлишига қарамай, таъсирланиш хар ҳил рецептор 
структуралари томонидан амалга оширилади, шу орқали турли ҳил физиологик 
эффекталра ҳам эга бўлади.

---

 
 
 
 

 Бу каби содда мисоллар ѐрдамида функционал протеомикани тўлиқ тавсифлаб 
бўлмайди. Организмда оқсил ва бошқа моддаларнинг ўзоро таъсирланиш тармоғи 
тўғрисидаги тушунчаларни яратиш катта мехнат кучи ва барча замонавий 
биоинформацион воситаларни жалб этишни талаб қилади. Бу каби тушунчаларни яратиш 
устида ишлар бошланган ва йилдан йилга бойитиб борилмоқда.
 
 
Карбон кислоталар метаболизми ҳаритасининг умумий контурлари 
 
Карбон кислоталар метаболизми харитасининг яралиши бу сохада қўлга киритилган 
дастлабки ютуқлардан бири саналади. У Россия фанлар академияси қошидаги А.Н. Бах 
номидаги биокимѐ институтида яратилган. Бу харита доимий даврий тузилишдаги 
реакциялар тармоғини намоѐн этади. Харитада вертикал бўйлаб бир хил сондаги углерод 
атомларини (1дан 10 тагача) тутувчи бирикмалар, горизонтал чизиқда эса функционал 
аналогик метаболитларни намоѐн этади. Харитадаги кимѐвий структуралар кўплаб 
кўрсатмага 
эга 
стрелкалар 
(мос 
кинѐвий 
жараѐнларда 
иштирок 
этувчи 
ферментлар(оқсиллар)) билан боғланган. Буни Д.И.Менделеевнинг даврий системасига 
қиѐсласа бўлади. Менделеев даврий системаси сингари мазкур харита башорат қилиш 
кучига эга. Уни ѐрдами билан бир қатор янги ферментлар башорат қилинган, кейинчалик
эса ушбу ферментлар тадқиқотлар натижасида кашф қилинган. Бу каби схемалар бошқа 
метаболитик 
йўллар 
(углевод, 
аминокислота), 
биокимѐвий 
реакцияларининг 
метаболитлари учун ҳам тарқалиши мумкин.