1. Genomlar organizmning chizmalari sifatida Genomlar ketma -ketligini aniqlash

RNK viruslari, evolyutsiyasi
Virus mutatsiyalari va genomlarning o'zaro ta'siri
Virus genomlari va undagi mutatsiyalar turli yo'llar bilan o'zaro ta'sir qilishi mumkin. Epistaz RNK viruslarida tez-tez uchraydigan hodisa bo'lib ko'rinadi va hozirgi kunga qadar aniqlangan epistatik o'zaro ta'sirlarning aksariyati sinergik emas, balki antagonistikdir (Sanjuan va boshqalar., 2004). Muhimi, epistatik effektlar xostlar o'rtasida ham farq qiladi va shuning uchun virus paydo bo'lishining markazida bo'lishi mumkin (Lalić va Elena, 2013). Epistaz turi, shuningdek, moslashishning asosiy jihati bo'lgan RNK viruslarida ko'rinadigan genetik mustahkamlik darajasiga ta'sir qiladi. RNK viruslarining yuqori xato tezligi, ularning juda ixcham genomlari bilan birlashganda, mutatsiyalar bir xil funktsiyalarni qayta -qayta buzib, antagonistik epistazga olib keladi (Elena) va boshqalar., 2006). Buni bartaraf etish uchun RNK viruslari ularga genetik mustahkamlikni ta'minlaydigan turli mexanizmlarni ishlab chiqdi (Elena, 2012) va qisman populyatsiyaning katta soni bilan himoyalangan.
Virus genomlari nuqsonli aralashuvchi (DI) zarralar va komplementatsiya mavjudligi orqali o'zaro ta'sir qilishi mumkin, ularning ikkalasi ham yuqori ko'p infektsiyani talab qiladi. DI zarrachalari RNK viruslarida keng tarqalgan kuzatuvdir (Saira va boshqalar., 2013), ko'pincha katta genomik o'chirishlarga ega va qiziqarli evolyutsion oqibatlarga olib keladi. DI zarralarining qisqaroq genomlari ularning to'liq uzunlikdagi virus genomlariga qaraganda tezroq ko'payishini anglatadi va shuning uchun foydali mutatsiyalarning tarqalishini nazariy jihatdan inhibe qilishi mumkin. DI zarralari, ehtimol, viruslar populyatsiyasida bir-birini to'ldirish orqali saqlanib qolishi ehtimoldan yiroq emas, bu bir nechta viruslar bitta hujayraga zarar etkazishi mumkin bo'lgan holatdir (Garsiya-Arriaza) va boshqalar., 2004). Komplementatsiya evolyutsion ahamiyatga ega, chunki bu zararli mutatsiyalar uzoq vaqt saqlanib qolishiga imkon beradi (Aaskov va boshqalar., 2006), lekin mustahkamlikni ham oshirishi mumkin (Gao va Feldman, 2009).