|
Mavzu: Qiyosiy genomikada genomlarni kompyuter dasturlari yordamida bir-biriga solishtirish, ketma-ketliklarni taqqoslash, gomolog genlar, ortologlar, paraloglar, ksenaloglar, genlar evolyusiyasi va ularning kelib chiqichi.
Reja:
1. Genomlar organizmning chizmalari sifatida
2. Genomlar ketma -ketligini aniqlash
3. Genomlarning xilma -xilligi
4. Qiyosiy genomika
Genomlar organizmning chizmalari sifatida
Genom - bu organizmning DNKda saqlanadigan irsiy ma'lumotlarning to'liq to'plami. Genomda kodlangan ma'lumotlarning o'zgarishi - biz atrofimizda ko'rayotgan (va biz qila olmaydigan) fenotipik xilma -xillikning asosiy omillari.filtrlanaditabiiy tanlanish orqali va ular evolyutsiyaning harakatlantiruvchi kuchlari. Agar ko'p hujayrali organizmdagi har bir hujayra bir xil DNK ketma -ketligini o'z ichiga olsa, qanday qilib har xil turdagi hujayralar bo'lishi mumkin (masalan, jigar hujayrasi miyadagi hujayradan shunchalik farq qilishi mumkin, agar ikkalasi ham bir xil DNKni olib yursa)? Ma'lumotni qanday o'qiymiz? O'qiganimizni qanday izohlaymiz? Biz genomda aniqlagan barcha "qismlar" qanday qilib funktsional jihatdan o'zaro bog'liqligini qanday tushunamiz? Bularning barchasi xususiyatlarning namoyon bo'lishi bilan qanday bog'liq? Qanday qilib genomdagi o'zgarishlar belgilarning o'zgarishiga olib keladi?
Genomlar ketma -ketligini aniqlash
Genomlarda kodlangan ma'lumotlar hayot, uning vazifalari, xilma -xilligi va evolyutsiyasini tushunish uchun muhim ma'lumotlarni beradi. Shuning uchun biologiya bo'yicha tadqiqotlarni boshlash uchun oqilona joy genomda kodlangan
Texnologik taraqqiyot, materialshunoslik sohasidagi yutuqlar (xususan, kichik hajmdagi narsalarni yaratish qobiliyatimiz), optika, elektrotexnika va kompyuter injiniringi, bioinjeneriya va kompyuter fanlari bizni DNK ketma -ketligi qobiliyatini keskin oshirishga olib keldi. va shunga mos ravishda DNKning ketma -ketligi narxining keskin pasayishi. Bu fikrni isbotlash uchun mashhur misol, inson genomini ketma-ketlashtirish uchun xarajatlardagi o'zgarishlarni solishtirishdir. Inson genomining birinchi loyihasini ishlab chiqish uchun deyarli 15 yil va 3 milliard dollar sarflandi. Bugun,ketma -ket bo'lishihar birining narxi 1000 dollardan kam bo'lgan bitta asbobda bir kunda (narx va vaqt pasayishda davom etmoqda). Bugungi kunda Illumina, Pacific Bioscience, Oxford Nanopore va boshqalar kabi kompaniyalar raqobatbardosh texnologiyalarni taklif qilmoqdalar, bu esa DNK ketma -ketligining narxini pasaytiradi, hajmi, sifati, tezligi va portativligini oshiradi.
DNK ketma -ketligi inqilobining eng hayajonli elementlaridan biri shundaki, u biologlar, kimyogarlar, materialshunoslar, elektrotexniklar, mexanik muhandislar, kompyuter olimlari va dasturchilar, matematiklar va statistiklar, mahsulot ishlab chiqaruvchilar va boshqa ko'plab kompaniyalarning hissalarini talab qilgan va talab qilmoqda. texnik mutaxassislar. DNK ketma -ketligi uchun to'siqlarni ochishning mumkin bo'lgan ilovalari va oqibatlari, shuningdek, investorlarni, ishbilarmonlarni, mahsulot ishlab chiqaruvchilarni, tadbirkorlarni, axloqshunoslarni, siyosatchilarni va boshqalarni yangi imkoniyatlarni izlashga va o'sayotgan texnologiyadan qanday qilib eng yaxshi va mas'uliyat bilan foydalanish haqida o'ylashga undadi. .
Genom ketma-ketligidagi texnologik yutuqlar to'liq genom ketma-ketliklarining virtual oqimiga olib keldi va ommaviy ma'lumotlar bazalariga joylashtirildi. Siz ularning ko'pini Milliy biotexnologiyalar markazida topishingiz mumkin. O'n minglab mavjud, to'liq tartibli genomlar soni - 2000 dan ortiq eukaryotik genomlar, 600 dan ortiq arxaeal genomlar va 12000 ga yaqin bakterial genomlar. O'n minglab qo'shimcha genomlar ketma -ketligi loyihalari amalga oshirilmoqda. Ko'p sonli genom ketma -ketligi mavjud bo'lganda yoki yaqinda paydo bo'ladi - biz bu genomlarda ko'rgan narsalarimiz haqida ko'plab savollar berishni boshlashimiz mumkin. Qaysi naqshlar barcha genomlarga xos?
Qancha genlar kodlangan
genomlarda? Bular qanday tashkil etilgan? Qancha turdagi xususiyatlarni topishimiz mumkin? Biz topgan xususiyatlar nima qiladi? Genomlar bir -biridan qanchalik farq qiladi? Genomlarning qanday rivojlanishini bizga ko'rsatadigan dalillar bormi? Keling, bu savollarning bir nechtasini qisqacha ko'rib chiqaylik.
Do'stlaringiz bilan baham: |
