1. Genomlar organizmning chizmalari sifatida Genomlar ketma -ketligini aniqlash

DNK mikrosxemalarini tahrirlash
To'liq genom ketma -ketligi genotiplash texnologiyasining oldingi etakchisi bo'lgan DNK massividan kattaroq kattalikdagi genom haqida ma'lumot beradi.
Odamlar uchun, DNK massivlari hozirda bir milliongacha genetik variantlar haqida genotipik ma'lumot beradi [77] [78] [79], to'liq genom ketma -ketligi esa inson genomidagi barcha olti milliard asos haqida ma'lumot beradi, yoki 3000 barobar ko'proq ma'lumot. Shu sababli, to'liq genom ketma-ketligi DNK qatori bozorlari uchun buzuvchi yangilik hisoblanadi, chunki ikkalasining aniqligi 99,98% dan 99,999% gacha (takrorlanmaydigan DNK mintaqalarida) va ularning sarf materiallari narxi 6 milliard tayanch jufti uchun 5000 dollar raqobatbardoshdir. (ba'zi ilovalar uchun) DNK massivlari bilan (1 million taglik juftlik uchun 500 dollar). [40]
Mutatsion chastotalar Tartibga solish
Genomlarning butun ketma -ketligi butun inson genomlari uchun mutatsiya chastotasini aniqladi. Odamlar (ota -onadan bolalarga) avlodlar orasidagi butun genomdagi mutatsiya chastotasi har bir avlodga taxminan 70 ta yangi mutatsiyani tashkil qiladi. [80] [81] 100 yoshli bir juft monozigotik (bir xil egizaklar) uchun qon hujayralarida butun genom ketma-ketligini solishtirishda oʻzgaruvchanlikning yanada pastroq darajasi aniqlandi. [82] Faqat 8 ta somatik farq topildi, ammo qon hujayralarining 20% ​​dan kamida sodir bo'lgan somatik o'zgarishlar aniqlanmaydi.
Inson genomining maxsus protein kodlash hududlarida, ota-onalar/bola avlodlari o'rtasida oqsillar ketma-ketligini o'zgartiradigan taxminan 0,35 mutatsiya mavjudligi taxmin qilinadi (har bir avlod uchun bitta mutatsiyaga uchragan oqsildan kam). [83]
Saraton kasalligida genomning beqarorligi tufayli mutatsiya chastotalari ancha yuqori. Bu chastota bemorning yoshiga, DNKni shikastlovchi moddalarga (masalan, ultrabinafsha nurlanishi yoki tamaki tutunining tarkibiy qismlari) ta'siriga va DNKni tiklash mexanizmlarining faolligiga/faolsizligiga bog'liq bo'lishi mumkin. [ iqtibos kerak ] Bundan tashqari, mutatsiya chastotasi saraton turiga qarab farq qilishi mumkin: germline hujayralarida mutatsiyaning tezligi megabazada taxminan 0,023 mutatsiyaga to'g'ri keladi, lekin bu raqam ko'krak saratoni (Mb uchun 1,18-1,66 somatik mutatsiyalar), o'pka saratoni (17,7) da ancha yuqori. yoki melanomalarda (≈33). [84] Gaploid inson genomi taxminan 3200 megabazadan iborat bo'lganligi sababli, [85] bu har bir avlodda germline DNKsida taxminan 74 mutatsiyaga (asosan kodlanmagan hududlarda) aylanadi, ammo ko'krak bezi saratonida har bir haploid genom uchun 3,776-5,312 somatik mutatsiyalar, 56,40 yilda. o'pka saratoni va melanomalarda 105600.
Inson genomida somatik mutatsiyalarning tarqalishi juda notekis [86], shuning uchun genga boy, erta replikatsiya qilinadigan hududlar, genlar kambag'al, kech replikatsiya qilingan heteroxromatinga qaraganda kamroq mutatsiyaga ega bo'ladi, ehtimol DNKni tiklashning differentsial faolligi tufayli. [87] Xususan, H3K9me3 giston modifikatsiyasi yuqori, [88] va H3K36me3 past mutatsiya chastotalari bilan bog'liq. [89]