1. Genomlar organizmning chizmalari sifatida Genomlar ketma -ketligini aniqlash

Genomlarning xilma -xilligi
O'lchamlarning xilma-xilligi,raqamgenlar va xromosomalar
Genom o'lchamlari diapazonini o'rganishdan boshlaylik. Quyidagi jadvalda biz ma'lumotlar bazasidan genomlar namunasini ko'ramiz. Erkin tirik organizmlarning genomlari juda katta hajmda ekanligini ko'rishimiz mumkin. Ma'lum bo'lgan eng kichik genomkodlangan580 ming asosiy juftlik bilan, eng kattasi 150 milliard juftlik juftligi - ma'lumot uchun, inson genomining 3,2 milliard juft juftligini eslang. Bu o'lchamlarning katta diapazoni. Genlar sonida ham shunga o'xshash nomutanosibliklar mavjud.
Jadval1. Ushbu jadval turli organizmlar uchun ba'zi genom ma'lumotlarini ko'rsatadi. 2n = diploid raqam. Atribut:Mark T. Facciotti (o'z ishi—http://book.bionumbers.org/how-big-are-genomes/ saytidan ko'chirilgan)

1-jadvalni ko'rib chiqish, shuningdek, ba'zi organizmlar o'zlari bilan olib yurishini ko'rsatadiBundan ko'proqbitta xromosoma. Ba'zi genomlar ham poliploidBu shuni anglatadiki, ular o'xshash, lekin bir xil bo'lmagan bir nechta nusxalarini saqlaydilar (gomologik) har bir xromosomaning nusxalari. Diploid organizm o'z genomida har bir xromosomaning ikkita gomologik nusxasini (odatda onadan va otadan) olib yuradi. Odamlar diploiddir. Bizning somatik hujayralarimizda 23 ta xromosomaning 2 ta gomologik nusxasi mavjud. Biz onamizdan 23 nusxada individual xromosomalarni va otamizdan 23 nusxani oldikjami46. ​​Ba'zi o'simliklarning ploidligi yuqori. Misol uchun, biz har bir xromosomaning to'rtta gomologik nusxasi bo'lgan o'simlik deb ataymiz tetraploid. Biz har bir xromosomaning bitta nusxasi bo'lgan organizmni ataymiz haploid.
Genomlarning tuzilishi
1 -jadvalda, shuningdek, boshqa diqqatga sazovor joylar haqida ma'lumot berilgan. Misol uchun, agar biz pufferfish genomini shimpanze genomiga solishtirsak, ular taxminan bir xil miqdordagi genlarni (19 000) kodlashini ta'kidlaymiz, ammo ular buni sezilarli darajada farq qiladigan genomlarda bajaradilar - mos ravishda 400 million tayanch juft va 3,3 milliard tayanch juft. . Bu shuni anglatadiki, pufferfish genomi shimpanze genomida biz kutganimizdan ko'ra, uning genlari o'rtasida kamroq bo'shliqqa ega bo'lishi kerak. Bu shunday va gen zichligidagi farq faqat bu ikki genomga xos emas. Agar biz 1-rasmga qarasak, u inson genomining 50 kb qismini ifodalashga harakat qilsa, biz oqsillarni kodlaydigan hududlardan tashqari (ko'rsatilganqizil va pushti ranglarda) boshqa ko'plab "xususiyatlar" mumkino'qilishigenomdan. Bu elementlarning ko'pchiligi juda takrorlanadigan ketma -ketlikni o'z ichiga oladi.

1-rasm. Bu rasm insonning 50 kb segmentini ko'rsatadib7-xromosomadagi T-hujayrali retseptorlari lokusi. Bu rasmda inson genomining kichik bir qismi tasvirlanganturlarimumkin bo'lgan "xususiyatlar"o'qilishiva genomda dekodlangan, shu jumladan, shuningdek, oqsillarni kodlash ketma-ketligi. Qizil va pushti oqsillarni kodlaydigan hududlarga mos keladi. Boshqa ranglar boshqacha ifodalayditurlarigenomik elementlar. Mualliflik:Mark T.. Facciotti (o'z ishi—www dan takrorlangan.ncbi.nlm.nih.gov/kitoblar/NBK21134/)
Endi biz butun insonning qaysi qismini ko'rib chiqsakgenombu turdagi elementlarning har biri (2-rasmga qarang), biz oqsillarni kodlovchi genlar gaploid genomining 3,2 milliard asoslarining atigi 48 millionini tashkil qilishini ko'ramiz.

2 -rasm. Bu grafikda insonning haploid genomidagi DNKning ko'p juft juftliklari tasvirlangantarqatiladihar xil aniqlanadigan xususiyatlar orasida. E'tibor bering, genomning faqat kichik bir qismibog'liqdiroqsillarni kodlaydigan hududlar bilan bevosita. Atribut:Mark T.. Facciotti (o'z ishi—rasmda ko'rsatilgan manbalardan olingan)