Замонавий биоинформацион дастурлар. Режа

Маъруза мавзусининг қисқача баёни:
Замонавий биоинформатика фанининг ривожланишида ва бу фаннинг кенг соҳалар бўйича тадқиқ қилиниши янгидан янги усулларнинг юзага келишига сабаб бўлди. Ўрганилаётган объектнинг хусусиятларига қараб замонавий биоинформатикада қуйидагича усуллар мавжуд:
ACT (Artemis Comparison Tool) — геном таҳлили
Arlequin — анализ популяцион-генетик маълумотларнинг таҳлили
BioEdit — нуклеотидли ва аминокислотали кетма-кетликларни кўплик текислашларнинг муҳаррири
BioNumerics — универсал тижорат дастурлар пакети
BLAST — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликлари бўйича маълумотлар базаларидан қариндош кетма – кетликларни излаш
Clustal W — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари
Clustal X — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари
DnaSP — ДНК кетма – кетликларидаги полиморфизмларни таҳлили
FigTree — филогенетик дарахтларнинг муҳаррири
Genepop — популяцион-генетик таҳлил
Genetix — популяцион-генетик таҳлил (дастур фақат француз тилида тақдим этилади)
JalView — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастур муҳаррири
MacClade — маълумотларни интерактив эволюцион таҳлили учун зарур тижорат дастури
MEGA — молекуляр-эволюцион генетик таҳлил
Mesquite — қиёсий биология учун Java тилидаги дастур
Muscle — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастури. ClustalW га нисбатан анча тез ва аниқ ишлайди.
PHYLIP — филогенетик дастурлар пакети
Phylo_win — филогенетик таҳлил. Дастур график интерфейсга эга.
PopGene — Популяциянинг генетик хилма- хиллик таҳлили
Populations — популяцион-генетик таҳлил
PSI Protein Classifier — PSI-BLAST дастури воситасида олинган натижаларнинг жамланиши
Seaview — филогенетик таҳлил (график интерфейси билан)
Sequin —кетма-кетликларни GenBank, EMBL, DDBJ даги тўпланиши
T-Coffee — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари дастури. ClustalW ва ClustalX га қараганда анча сезгирроқ
UGENE — нуклеотидлар ва аминокислоталар кетма-кетликларининг кўплик таққосланишлари, филогенетик таҳлил, аннотирлаш, маълумотлар базалари билан ишлаш учун эркин ҳолатдаги рус тилидаги дастур.