Xxiv международная медико-биологическая конференция молодых исследователей Фундаментальная наука и клиническая

МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ДОКИНГ МЕЖДУ МОЛЕКУЛОЙ 
СТАВУДИНА И ПРОТЕАЗОЙ ВИЧ-1 5COK
Казаков Р.В., студ., Ханчевский М.А., студ., Деусова Е.С., студ.
Международный государственный экологический институт 
имени А.Д. Сахарова БГУ,
Минск, Республика Беларусь
Научный руководитель: Шахаб С.Н., к.х.н., доц.
Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) — это инфекция, по-
ражающая иммунную систему организма, в частности лейкоциты. 
ВИЧ разрушает эти клетки, ослабляя иммунитет человека против 
таких инфекций, как туберкулез и некоторые виды рака. Если коли-
чество CD4-клеток человека падает ниже 200, его иммунитет серьез-
но снижается, что делает его более восприимчивым к инфекциям. 
Человек с числом CD4- клеток ниже 200 описывается как больной 
СПИДом (синдром приобретенного иммунодефицита). Проблема 
носит глобальный характер и нуждается в решении.
Цель исследования: 
определить ингибирующие свойства и срод-
ство Ставудина (2',3'-дидегидро-2',3'-дидеокситимидин, d4t) к про-
теазе ВИЧ-1, используя методы молекулярного моделирования
Материалы и методы исследования: 
В ходе работы использова-
лись следующие программные пакеты: ChemOffice 2016, HyperChem 
08, Gaussian 09W и Molegro molecular viewer. В качестве биологиче-
ской мишени выбрана протеаза ВИЧ-1. Кристаллическая структура 
биополимера с разрешением 1,80 ангстрем взята из банка белков: 
https://www.rcsb.org/structure/5COK. 
Результаты и их обсуждение:
Между 2',3'-дидегидро-2',3'-
дидеокситимидином и протеазой ВИЧ-1 образовались 3 водород-
ные связи с разной энергией(E): от -0,206 до -1,736 соответственно. 
В результате расчетов было выявлено образование трех водородных 
связей между лигандом и протеином: 1 водородная связь(E=-0,206) 
между аминокислотным остатком Val 32 и кислородом пирими-
динового основания в положении 4; 2 водородные связи(E=-1,736
и -0,302) между кислородом карбоксильной группы, азотом амино-

---

678
ФАРМАКОЛОГИЯ, ФАРМАКОГНОЗИЯ, ФАРМАЦЕВТИКА, ТОКСИКОЛОГИЯ
группы группы Asp 29 и кислородом гидроксильной группы пири-
мидинового азотистого основания в положении 2.
Выводы: 
Ставудин, образуя 3 водородные связи, с протеазой 
ВИЧ-1, способствует ее ингибированию, в результате чего происхо-
дит нарушение функциональной активности протеина.

---

ФАРМАКОЛОГИЯ, ФАРМАКОГНОЗИЯ, ФАРМАЦЕВТИКА, ТОКСИКОЛОГИЯ
679